More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A4070 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0263  proline dipeptidase  73.59 
 
 
443 aa  702    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00615185  normal  0.0316528 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03738  proline dipeptidase  100 
 
 
443 aa  924    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24078  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4134  peptidase M24  100 
 
 
443 aa  924    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.689702  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4163  proline dipeptidase  100 
 
 
443 aa  924    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215567  hitchhiker  0.000134113 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3746  proline dipeptidase  71.78 
 
 
443 aa  698    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0139114  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4191  proline dipeptidase  95.49 
 
 
443 aa  889    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4070  proline dipeptidase  100 
 
 
443 aa  924    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000225581  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4043  proline dipeptidase  75.62 
 
 
443 aa  726    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.144286  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3932  proline dipeptidase  73.59 
 
 
443 aa  702    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4263  proline dipeptidase  95.49 
 
 
443 aa  889    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4370  proline dipeptidase  95.49 
 
 
443 aa  889    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4366  proline dipeptidase  100 
 
 
443 aa  924    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000311805  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4228  proline dipeptidase  99.77 
 
 
443 aa  922    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000144079  normal  0.0133545 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4310  proline dipeptidase  95.49 
 
 
443 aa  889    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.554834 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4233  proline dipeptidase  75.85 
 
 
443 aa  727    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.118401  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3948  proline dipeptidase  88.49 
 
 
443 aa  837    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.34685  normal  0.023319 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5286  proline dipeptidase  99.55 
 
 
443 aa  920    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0321906  normal  0.0291317 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3900  proline dipeptidase  72.23 
 
 
443 aa  703    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.022198  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03687  hypothetical protein  100 
 
 
443 aa  924    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.173056  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0284  proline dipeptidase  73.59 
 
 
443 aa  702    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000682682  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4214  proline dipeptidase  95.49 
 
 
443 aa  889    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0112386  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1913  proline dipeptidase  73.59 
 
 
443 aa  702    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137948  normal  0.0277892 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4317  proline dipeptidase  99.32 
 
 
443 aa  920    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00026447  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03734  proline dipeptidase  53.03 
 
 
448 aa  481  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0033  proline dipeptidase  52.71 
 
 
439 aa  473  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.12189  normal  0.0842725 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0022  proline dipeptidase  50.9 
 
 
439 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.324765  hitchhiker  0.00118901 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0022  proline dipeptidase  49.89 
 
 
440 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0718408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0021  proline dipeptidase  49.66 
 
 
440 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215078  normal  0.0114173 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0019  proline dipeptidase  50.23 
 
 
440 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0021  proline dipeptidase  49.89 
 
 
440 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000247485 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0014  proline dipeptidase  50.34 
 
 
440 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.258964  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0017  proline dipeptidase  49.89 
 
 
440 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.173112  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0024  proline dipeptidase  49.32 
 
 
439 aa  456  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.840072  normal  0.0225878 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0022  proline dipeptidase  50.11 
 
 
439 aa  455  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0020  proline dipeptidase  50 
 
 
440 aa  456  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00930691  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0017  proline dipeptidase  49.89 
 
 
439 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.767781  normal  0.0779588 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0016  proline dipeptidase  49.77 
 
 
440 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.98827  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0199  proline dipeptidase  51.01 
 
 
443 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0019  proline dipeptidase  49.66 
 
 
439 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0806227  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0025  proline dipeptidase  49.66 
 
 
439 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000000409434 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0013  proline dipeptidase  47.95 
 
 
443 aa  448  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0014  proline dipeptidase  49.1 
 
 
439 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02375  proline dipeptidase  46.79 
 
 
492 aa  410  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3276  proline dipeptidase  44.7 
 
 
443 aa  387  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0455  proline dipeptidase  40.22 
 
 
429 aa  308  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5810  peptidase M24  39.65 
 
 
470 aa  287  2.9999999999999996e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174422  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3908  proline dipeptidase  37.05 
 
 
433 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969925  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05810  ProlidasePutative uncharacterized protein (EC 3.4.13.9); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX8]  33.12 
 
 
465 aa  139  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.708956 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00832  peptidase D, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14920)  33.1 
 
 
469 aa  136  9e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.06769  normal  0.708956 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3411  Xaa-Pro dipeptidase  32.75 
 
 
458 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.141786 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62767  X-Pro dipeptidase  30.99 
 
 
475 aa  125  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0606  peptidase M24  33.33 
 
 
439 aa  125  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1440  Xaa-Pro dipeptidase  29.48 
 
 
461 aa  123  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.377937 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4084  Xaa-Pro dipeptidase  30.59 
 
 
429 aa  123  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.544517  normal  0.312434 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1467  Xaa-Pro dipeptidase  34.04 
 
 
493 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0068  Xaa-Pro dipeptidase  31.68 
 
 
451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_29983  predicted protein  27.73 
 
 
524 aa  121  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02740  proline aminopeptidase P II  31.21 
 
 
441 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000920962  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0784  peptidase M24  31.21 
 
 
441 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264237  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0066  peptidase M24  31.35 
 
 
451 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0179653  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3067  proline aminopeptidase P II  31.21 
 
 
441 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106171  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3236  proline aminopeptidase P II  31.21 
 
 
441 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000420398  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02703  hypothetical protein  31.21 
 
 
441 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000102485  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3329  proline aminopeptidase P II  30.91 
 
 
441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000100618  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4201  proline aminopeptidase P II  31.21 
 
 
441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000052463  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3042  proline aminopeptidase P II  30.91 
 
 
441 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000751227  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0801  proline aminopeptidase P II  31.21 
 
 
441 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000590411  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2542  aminopeptidase P  32.53 
 
 
437 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158286  normal  0.0283016 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3422  Xaa-Pro dipeptidase  29.77 
 
 
464 aa  117  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26550  predicted protein  27.39 
 
 
490 aa  116  6e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0032931 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1821  peptidase M24  30.77 
 
 
454 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0438992  hitchhiker  0.0000000354037 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4366  peptidase M24  32.06 
 
 
455 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2684  Xaa-Pro dipeptidase  32.99 
 
 
463 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3337  peptidase M24  31.03 
 
 
499 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.106603 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2770  xaa-pro aminopeptidase  31.29 
 
 
436 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00849  proline aminopeptidase P II  30.92 
 
 
437 aa  113  7.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02200  prolidase, putative  28.49 
 
 
546 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.555786  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0541  proline aminopeptidase P II  32.07 
 
 
441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0623  aminopeptidase P  31.03 
 
 
468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920846  normal  0.361918 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3327  proline aminopeptidase P II  31.6 
 
 
437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0020606  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3396  proline aminopeptidase P II  31.4 
 
 
438 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00011206  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0766  peptidase M24  31.47 
 
 
459 aa  111  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.498025  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0860  proline aminopeptidase P II  32.19 
 
 
437 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000995662  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3229  proline aminopeptidase P II  30.91 
 
 
438 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000552442  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1559  peptidase M24  31.72 
 
 
443 aa  111  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3294  proline aminopeptidase P II  30.91 
 
 
438 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229287  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0863  proline aminopeptidase P II  31.85 
 
 
437 aa  110  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00955422  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1185  peptidase M24  31.03 
 
 
452 aa  110  6e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3827  proline aminopeptidase P II  31.85 
 
 
437 aa  110  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000338921  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4599  aminopeptidase P  32.29 
 
 
436 aa  109  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2549  peptidase M24  30.38 
 
 
514 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0811  Xaa-Pro dipeptidase  29.9 
 
 
471 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2764  peptidase M24  29.9 
 
 
454 aa  109  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5101  peptidase M24  31.74 
 
 
465 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.232729  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3217  proline aminopeptidase P II  30.79 
 
 
438 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00100894  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1782  peptidase M24  30.56 
 
 
461 aa  109  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000518902  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3502  peptidase M24  30.82 
 
 
443 aa  109  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3291  proline aminopeptidase P II  30.79 
 
 
438 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133072  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3919  proline aminopeptidase P II  30.67 
 
 
437 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000043495  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0614  peptidase M24  30.28 
 
 
464 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.178264 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>