More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3276 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3276  proline dipeptidase  100 
 
 
443 aa  909    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02375  proline dipeptidase  76.42 
 
 
492 aa  709    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0014  proline dipeptidase  46.74 
 
 
440 aa  412  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.258964  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0022  proline dipeptidase  46.05 
 
 
440 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0718408  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0022  proline dipeptidase  46.51 
 
 
439 aa  409  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0021  proline dipeptidase  46.05 
 
 
440 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000247485 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0017  proline dipeptidase  46.05 
 
 
440 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.173112  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0021  proline dipeptidase  46.05 
 
 
440 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215078  normal  0.0114173 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0016  proline dipeptidase  45.69 
 
 
440 aa  410  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.98827  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0019  proline dipeptidase  45.12 
 
 
440 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0022  proline dipeptidase  44.86 
 
 
439 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.324765  hitchhiker  0.00118901 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0017  proline dipeptidase  46.05 
 
 
439 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.767781  normal  0.0779588 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0025  proline dipeptidase  46.05 
 
 
439 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000000409434 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0033  proline dipeptidase  46.3 
 
 
439 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.12189  normal  0.0842725 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4233  proline dipeptidase  46.31 
 
 
443 aa  403  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.118401  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0019  proline dipeptidase  46.05 
 
 
439 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0806227  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3932  proline dipeptidase  45.16 
 
 
443 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0014  proline dipeptidase  46.28 
 
 
439 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0020  proline dipeptidase  46.21 
 
 
440 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00930691  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4043  proline dipeptidase  46.54 
 
 
443 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.144286  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0284  proline dipeptidase  45.16 
 
 
443 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000682682  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1913  proline dipeptidase  44.93 
 
 
443 aa  397  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137948  normal  0.0277892 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03738  proline dipeptidase  44.7 
 
 
443 aa  395  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24078  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4134  peptidase M24  44.7 
 
 
443 aa  395  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.689702  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0013  proline dipeptidase  43.85 
 
 
443 aa  395  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4228  proline dipeptidase  44.7 
 
 
443 aa  394  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000144079  normal  0.0133545 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0024  proline dipeptidase  44.5 
 
 
439 aa  394  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.840072  normal  0.0225878 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4366  proline dipeptidase  44.7 
 
 
443 aa  395  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000311805  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4163  proline dipeptidase  44.7 
 
 
443 aa  395  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215567  hitchhiker  0.000134113 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3900  proline dipeptidase  44.83 
 
 
443 aa  394  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.022198  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03687  hypothetical protein  44.7 
 
 
443 aa  395  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.173056  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4070  proline dipeptidase  44.7 
 
 
443 aa  395  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000225581  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3948  proline dipeptidase  44.47 
 
 
443 aa  389  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.34685  normal  0.023319 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4317  proline dipeptidase  44.24 
 
 
443 aa  391  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00026447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5286  proline dipeptidase  44.24 
 
 
443 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0321906  normal  0.0291317 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03734  proline dipeptidase  44.01 
 
 
448 aa  383  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0263  proline dipeptidase  43.78 
 
 
443 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00615185  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3746  proline dipeptidase  44.8 
 
 
443 aa  383  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0139114  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4214  proline dipeptidase  43.55 
 
 
443 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0112386  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4191  proline dipeptidase  43.55 
 
 
443 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4370  proline dipeptidase  43.55 
 
 
443 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4310  proline dipeptidase  43.55 
 
 
443 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.554834 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4263  proline dipeptidase  43.55 
 
 
443 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0199  proline dipeptidase  45.66 
 
 
443 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0455  proline dipeptidase  40.6 
 
 
429 aa  301  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3908  proline dipeptidase  39.03 
 
 
433 aa  298  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969925  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5810  peptidase M24  37.17 
 
 
470 aa  252  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174422  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4084  Xaa-Pro dipeptidase  33.33 
 
 
429 aa  147  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.544517  normal  0.312434 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1467  Xaa-Pro dipeptidase  38.27 
 
 
493 aa  146  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62767  X-Pro dipeptidase  34.38 
 
 
475 aa  144  3e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2684  Xaa-Pro dipeptidase  36.65 
 
 
463 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3411  Xaa-Pro dipeptidase  35.69 
 
 
458 aa  142  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.141786 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05810  ProlidasePutative uncharacterized protein (EC 3.4.13.9); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX8]  27.78 
 
 
465 aa  136  6.0000000000000005e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.708956 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00832  peptidase D, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14920)  33.45 
 
 
469 aa  135  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.06769  normal  0.708956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4366  peptidase M24  34.16 
 
 
455 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0766  peptidase M24  33.45 
 
 
459 aa  134  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.498025  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0068  Xaa-Pro dipeptidase  35.34 
 
 
451 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1821  peptidase M24  30.5 
 
 
454 aa  130  6e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0438992  hitchhiker  0.0000000354037 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0066  peptidase M24  32.47 
 
 
451 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0179653  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5101  peptidase M24  31.63 
 
 
465 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.232729  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26550  predicted protein  31.15 
 
 
490 aa  120  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0032931 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1559  peptidase M24  32.78 
 
 
443 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_29983  predicted protein  34.29 
 
 
524 aa  119  7.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2770  xaa-pro aminopeptidase  30.57 
 
 
436 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4058  peptidase M24  32.18 
 
 
473 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0811  Xaa-Pro dipeptidase  39.51 
 
 
471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3422  Xaa-Pro dipeptidase  35.51 
 
 
464 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1440  Xaa-Pro dipeptidase  33.1 
 
 
461 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.377937 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2764  peptidase M24  30.04 
 
 
454 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1185  peptidase M24  36.84 
 
 
452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0973  aminopeptidase P  28.32 
 
 
439 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0254  putative Xaa-Pro aminopeptidase (aminopeptidase P II) protein  34.5 
 
 
454 aa  114  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.26967 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0606  peptidase M24  27.4 
 
 
439 aa  114  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3935  peptidase M24  33.12 
 
 
436 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18411  putative aminopeptidase P  28.29 
 
 
439 aa  113  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.502832 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02200  prolidase, putative  28.45 
 
 
546 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.555786  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2334  putative XAA-Pro aminopeptidase  32.78 
 
 
433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2542  aminopeptidase P  32.31 
 
 
437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158286  normal  0.0283016 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0325  peptidase M24  30.13 
 
 
444 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1271  Xaa-Pro aminopeptidase  30.34 
 
 
461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0860  proline aminopeptidase P II  30.9 
 
 
437 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000995662  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4829  aminopeptidase P  29.86 
 
 
462 aa  111  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.839316  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2549  peptidase M24  31.85 
 
 
514 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1782  peptidase M24  31.63 
 
 
461 aa  110  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000518902  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0432  aminopeptidase P  29.2 
 
 
465 aa  110  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386273  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0863  proline aminopeptidase P II  30.56 
 
 
437 aa  109  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00955422  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3827  proline aminopeptidase P II  30.56 
 
 
437 aa  109  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000338921  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0500  putative aminopeptidase P  33.11 
 
 
441 aa  108  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0229386  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2146  aminopeptidase P  29.3 
 
 
439 aa  108  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15611  putative aminopeptidase P  31.05 
 
 
439 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0134  peptidase M24  30.1 
 
 
439 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0492  aminopeptidase P  29.03 
 
 
474 aa  108  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476859  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5472  Xaa-Pro dipeptidase  36.46 
 
 
472 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.812118  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2358  peptidase M24  31.54 
 
 
439 aa  108  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000327517  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3475  proline aminopeptidase P II  29.83 
 
 
441 aa  107  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0588  peptidase M24  32.08 
 
 
464 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1873  peptidase M24  31.72 
 
 
458 aa  106  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02378  aminopeptidase P  31.74 
 
 
446 aa  106  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0614  peptidase M24  32.08 
 
 
464 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.178264 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0321  peptidase M24:peptidase M24B, X-Pro dipeptidase/aminopeptidase N-terminal  29.55 
 
 
444 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.735607 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>