More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0199 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03734  proline dipeptidase  73.81 
 
 		 448 aa  699    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0199  proline dipeptidase  100 
 
 		 443 aa  922    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0013  proline dipeptidase  59.64 
 
 		 443 aa  548  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0017  proline dipeptidase  58.69 
 
 		 440 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.173112  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0021  proline dipeptidase  58.69 
 
 		 440 aa  544  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215078  normal  0.0114173 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0022  proline dipeptidase  58.14 
 
 		 439 aa  543  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0021  proline dipeptidase  58.69 
 
 		 440 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000247485 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0022  proline dipeptidase  58.69 
 
 		 440 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0718408  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0016  proline dipeptidase  58.14 
 
 		 440 aa  544  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.98827  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0014  proline dipeptidase  58.82 
 
 		 440 aa  543  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.258964  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0020  proline dipeptidase  57.79 
 
 		 440 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00930691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0033  proline dipeptidase  57.11 
 
 		 439 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.12189  normal  0.0842725 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0017  proline dipeptidase  57.69 
 
 		 439 aa  537  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.767781  normal  0.0779588 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0019  proline dipeptidase  57.11 
 
 		 440 aa  537  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0025  proline dipeptidase  57.47 
 
 		 439 aa  535  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000000409434 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0022  proline dipeptidase  57.11 
 
 		 439 aa  533  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.324765  hitchhiker  0.00118901 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0019  proline dipeptidase  57.24 
 
 		 439 aa  533  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0806227  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0014  proline dipeptidase  57.47 
 
 		 439 aa  530  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0024  proline dipeptidase  55.98 
 
 		 439 aa  527  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.840072  normal  0.0225878 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3932  proline dipeptidase  53.71 
 
 		 443 aa  488  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1913  proline dipeptidase  53.71 
 
 		 443 aa  488  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137948  normal  0.0277892 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0284  proline dipeptidase  53.71 
 
 		 443 aa  488  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000682682  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4233  proline dipeptidase  52.81 
 
 		 443 aa  484  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.118401  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3900  proline dipeptidase  52.36 
 
 		 443 aa  479  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.022198  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4043  proline dipeptidase  53.03 
 
 		 443 aa  480  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.144286  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3948  proline dipeptidase  53.02 
 
 		 443 aa  477  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.34685  normal  0.023319 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4214  proline dipeptidase  51.68 
 
 		 443 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0112386  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4263  proline dipeptidase  51.68 
 
 		 443 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4310  proline dipeptidase  51.68 
 
 		 443 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.554834 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4370  proline dipeptidase  51.68 
 
 		 443 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4191  proline dipeptidase  51.68 
 
 		 443 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3746  proline dipeptidase  52.36 
 
 		 443 aa  474  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0139114  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03738  proline dipeptidase  51.01 
 
 		 443 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24078  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4134  peptidase M24  51.01 
 
 		 443 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.689702  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4366  proline dipeptidase  51.01 
 
 		 443 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000311805  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4070  proline dipeptidase  51.01 
 
 		 443 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000225581  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4163  proline dipeptidase  51.01 
 
 		 443 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215567  hitchhiker  0.000134113 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0263  proline dipeptidase  51.46 
 
 		 443 aa  469  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00615185  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03687  hypothetical protein  51.01 
 
 		 443 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.173056  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4228  proline dipeptidase  51.24 
 
 		 443 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000144079  normal  0.0133545 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5286  proline dipeptidase  50.79 
 
 		 443 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0321906  normal  0.0291317 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4317  proline dipeptidase  50.34 
 
 		 443 aa  465  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00026447  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02375  proline dipeptidase  46.67 
 
 		 492 aa  403  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3276  proline dipeptidase  45.66 
 
 		 443 aa  389  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0455  proline dipeptidase  41.46 
 
 		 429 aa  325  7e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5810  peptidase M24  40.71 
 
 		 470 aa  312  1e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174422  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3908  proline dipeptidase  38.53 
 
 		 433 aa  299  8e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969925  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05810  ProlidasePutative uncharacterized protein (EC 3.4.13.9); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX8]  30.09 
 
 		 465 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.708956 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62767  X-Pro dipeptidase  32.87 
 
 		 475 aa  149  1.0000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0606  peptidase M24  27.98 
 
 		 439 aa  146  8.000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26550  predicted protein  27.29 
 
 		 490 aa  143  6e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0032931 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00832  peptidase D, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14920)  27.69 
 
 		 469 aa  139  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.06769  normal  0.708956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5101  peptidase M24  25.83 
 
 		 465 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.232729  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4084  Xaa-Pro dipeptidase  30.74 
 
 		 429 aa  134  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.544517  normal  0.312434 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3422  Xaa-Pro dipeptidase  31.29 
 
 		 464 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1821  peptidase M24  27.63 
 
 		 454 aa  133  7.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0438992  hitchhiker  0.0000000354037 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0623  aminopeptidase P  32.42 
 
 		 468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920846  normal  0.361918 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3337  peptidase M24  28.38 
 
 		 499 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.106603 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3411  Xaa-Pro dipeptidase  32.32 
 
 		 458 aa  131  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.141786 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0966  aminopeptidase P  26.67 
 
 		 442 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.309482  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2542  aminopeptidase P  25.86 
 
 		 437 aa  130  5.0000000000000004e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158286  normal  0.0283016 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02200  prolidase, putative  29.17 
 
 		 546 aa  129  7.000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.555786  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1271  Xaa-Pro aminopeptidase  34.38 
 
 		 461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1711  peptidase M24  25.92 
 
 		 434 aa  127  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000229951  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02378  aminopeptidase P  26.55 
 
 		 446 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0848  peptidase M24B X-Pro dipeptidase/aminopeptidase domain-containing protein  26.44 
 
 		 442 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.283134  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1467  Xaa-Pro dipeptidase  28.96 
 
 		 493 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1440  Xaa-Pro dipeptidase  28.24 
 
 		 461 aa  127  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.377937 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1559  peptidase M24  30.27 
 
 		 443 aa  125  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0766  peptidase M24  31.49 
 
 		 459 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.498025  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0068  Xaa-Pro dipeptidase  30.97 
 
 		 451 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2764  peptidase M24  26.42 
 
 		 454 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0863  proline aminopeptidase P II  27.13 
 
 		 437 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00955422  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3827  proline aminopeptidase P II  27.13 
 
 		 437 aa  124  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000338921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0860  proline aminopeptidase P II  26.58 
 
 		 437 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000995662  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0432  aminopeptidase P  32.45 
 
 		 465 aa  123  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386273  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1782  peptidase M24  27.74 
 
 		 461 aa  123  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000518902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0400  peptidase M24  29.23 
 
 		 462 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.429272 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2358  peptidase M24  30.94 
 
 		 439 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000327517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0254  putative Xaa-Pro aminopeptidase (aminopeptidase P II) protein  26.06 
 
 		 454 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.26967 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0385  peptidase M24  28.98 
 
 		 459 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_29983  predicted protein  34.16 
 
 		 524 aa  120  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3327  proline aminopeptidase P II  27.25 
 
 		 437 aa  120  4.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0020606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1534  xaa-pro aminopeptidase  26.21 
 
 		 441 aa  120  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000615425  normal  0.874412 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4366  peptidase M24  31.23 
 
 		 455 aa  119  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2549  peptidase M24  30.43 
 
 		 514 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3277  peptidase M24  26.1 
 
 		 442 aa  119  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.609187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2816  peptidase M24  31.05 
 
 		 441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000333195  normal  0.738801 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2684  Xaa-Pro dipeptidase  31.69 
 
 		 463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3919  proline aminopeptidase P II  27.97 
 
 		 437 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000043495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0066  peptidase M24  30.32 
 
 		 451 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0179653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3362  peptidase M24  25.83 
 
 		 439 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0614  peptidase M24  27.44 
 
 		 464 aa  117  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.178264 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3781  aminopeptidase P  27.61 
 
 		 461 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0541  proline aminopeptidase P II  28.52 
 
 		 441 aa  116  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4336  peptidase M24  29.86 
 
 		 389 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0492  aminopeptidase P  27.25 
 
 		 474 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476859  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3406  peptidase M24  25.83 
 
 		 439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2146  aminopeptidase P  26.87 
 
 		 439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2399  peptidase M24  28.4 
 
 		 435 aa  115  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.320532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>