More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4043 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03738  proline dipeptidase  75.62 
 
 		 443 aa  726    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24078  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4134  peptidase M24  75.62 
 
 		 443 aa  726    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.689702  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4228  proline dipeptidase  75.62 
 
 		 443 aa  726    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000144079  normal  0.0133545 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4214  proline dipeptidase  76.52 
 
 		 443 aa  723    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0112386  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03687  hypothetical protein  75.62 
 
 		 443 aa  726    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.173056  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4366  proline dipeptidase  75.62 
 
 		 443 aa  726    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000311805  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0263  proline dipeptidase  78.1 
 
 		 443 aa  742    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00615185  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4043  proline dipeptidase  100 
 
 		 443 aa  919    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.144286  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3900  proline dipeptidase  79.01 
 
 		 443 aa  749    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.022198  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4317  proline dipeptidase  74.94 
 
 		 443 aa  723    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00026447  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3746  proline dipeptidase  77.43 
 
 		 443 aa  738    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0139114  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1913  proline dipeptidase  79.23 
 
 		 443 aa  748    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137948  normal  0.0277892 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4070  proline dipeptidase  75.62 
 
 		 443 aa  726    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000225581  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4310  proline dipeptidase  76.52 
 
 		 443 aa  723    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.554834 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4163  proline dipeptidase  75.62 
 
 		 443 aa  726    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215567  hitchhiker  0.000134113 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4191  proline dipeptidase  76.52 
 
 		 443 aa  723    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4263  proline dipeptidase  76.52 
 
 		 443 aa  723    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3932  proline dipeptidase  79.23 
 
 		 443 aa  748    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4233  proline dipeptidase  95.94 
 
 		 443 aa  885    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.118401  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3948  proline dipeptidase  76.07 
 
 		 443 aa  722    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.34685  normal  0.023319 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4370  proline dipeptidase  76.52 
 
 		 443 aa  723    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0284  proline dipeptidase  79.23 
 
 		 443 aa  748    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000682682  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5286  proline dipeptidase  75.17 
 
 		 443 aa  723    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0321906  normal  0.0291317 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03734  proline dipeptidase  54.16 
 
 		 448 aa  492  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0033  proline dipeptidase  54.3 
 
 		 439 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.12189  normal  0.0842725 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0021  proline dipeptidase  51.47 
 
 		 440 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000247485 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0022  proline dipeptidase  51.47 
 
 		 440 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0718408  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0017  proline dipeptidase  51.47 
 
 		 440 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.173112  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0022  proline dipeptidase  51.92 
 
 		 439 aa  474  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0014  proline dipeptidase  51.69 
 
 		 440 aa  473  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.258964  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0021  proline dipeptidase  51.24 
 
 		 440 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215078  normal  0.0114173 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0019  proline dipeptidase  51.69 
 
 		 439 aa  472  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0806227  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0017  proline dipeptidase  51.92 
 
 		 439 aa  474  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.767781  normal  0.0779588 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0020  proline dipeptidase  52.71 
 
 		 440 aa  473  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00930691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0025  proline dipeptidase  51.69 
 
 		 439 aa  473  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000000409434 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0024  proline dipeptidase  50.68 
 
 		 439 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.840072  normal  0.0225878 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0016  proline dipeptidase  51.58 
 
 		 440 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.98827  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0022  proline dipeptidase  50.45 
 
 		 439 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.324765  hitchhiker  0.00118901 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0019  proline dipeptidase  51.13 
 
 		 440 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0013  proline dipeptidase  49.89 
 
 		 443 aa  461  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0199  proline dipeptidase  53.03 
 
 		 443 aa  464  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0014  proline dipeptidase  51.81 
 
 		 439 aa  457  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02375  proline dipeptidase  50.23 
 
 		 492 aa  422  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3276  proline dipeptidase  46.54 
 
 		 443 aa  392  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0455  proline dipeptidase  42.42 
 
 		 429 aa  317  3e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5810  peptidase M24  42.01 
 
 		 470 aa  297  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174422  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3908  proline dipeptidase  38.22 
 
 		 433 aa  276  5e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969925  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00832  peptidase D, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14920)  33.8 
 
 		 469 aa  133  6.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.06769  normal  0.708956 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05810  ProlidasePutative uncharacterized protein (EC 3.4.13.9); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX8]  32.19 
 
 		 465 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.708956 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4084  Xaa-Pro dipeptidase  31.94 
 
 		 429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.544517  normal  0.312434 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1440  Xaa-Pro dipeptidase  28.61 
 
 		 461 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.377937 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3422  Xaa-Pro dipeptidase  32.07 
 
 		 464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0860  proline aminopeptidase P II  30.72 
 
 		 437 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000995662  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0606  peptidase M24  26.15 
 
 		 439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3329  proline aminopeptidase P II  30.45 
 
 		 441 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000100618  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0784  peptidase M24  30.45 
 
 		 441 aa  114  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264237  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1559  peptidase M24  33.57 
 
 		 443 aa  114  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3827  proline aminopeptidase P II  30.39 
 
 		 437 aa  114  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000338921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0863  proline aminopeptidase P II  30.39 
 
 		 437 aa  114  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00955422  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4201  proline aminopeptidase P II  30.13 
 
 		 441 aa  113  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000052463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0801  proline aminopeptidase P II  30.62 
 
 		 441 aa  113  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000590411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3042  proline aminopeptidase P II  29.81 
 
 		 441 aa  113  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000751227  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02740  proline aminopeptidase P II  29.81 
 
 		 441 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000920962  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02703  hypothetical protein  29.81 
 
 		 441 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000102485  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3067  proline aminopeptidase P II  29.81 
 
 		 441 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106171  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3236  proline aminopeptidase P II  29.81 
 
 		 441 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000420398  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26550  predicted protein  32.06 
 
 		 490 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0032931 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62767  X-Pro dipeptidase  30 
 
 		 475 aa  112  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1782  peptidase M24  32.31 
 
 		 461 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000518902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4366  peptidase M24  32.06 
 
 		 455 aa  111  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3919  proline aminopeptidase P II  29.74 
 
 		 437 aa  110  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000043495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3337  peptidase M24  31.46 
 
 		 499 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.106603 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1711  peptidase M24  31.51 
 
 		 434 aa  110  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000229951  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5101  peptidase M24  31.74 
 
 		 465 aa  110  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.232729  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2542  aminopeptidase P  32.31 
 
 		 437 aa  109  9.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158286  normal  0.0283016 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3396  proline aminopeptidase P II  30.16 
 
 		 438 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00011206  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1185  peptidase M24  31.21 
 
 		 452 aa  108  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3327  proline aminopeptidase P II  30.29 
 
 		 437 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0020606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0068  Xaa-Pro dipeptidase  30.27 
 
 		 451 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2146  aminopeptidase P  28.09 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3411  Xaa-Pro dipeptidase  30.34 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.141786 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0811  Xaa-Pro dipeptidase  34.8 
 
 		 471 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0541  proline aminopeptidase P II  30.72 
 
 		 441 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2549  peptidase M24  31.29 
 
 		 514 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0444  proline aminopeptidase P II  31.17 
 
 		 441 aa  107  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00849  proline aminopeptidase P II  30.55 
 
 		 437 aa  106  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02200  prolidase, putative  28.23 
 
 		 546 aa  106  7e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.555786  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3294  proline aminopeptidase P II  29.51 
 
 		 438 aa  106  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3229  proline aminopeptidase P II  29.51 
 
 		 438 aa  106  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000552442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2764  peptidase M24  30.2 
 
 		 454 aa  106  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1534  xaa-pro aminopeptidase  30.14 
 
 		 441 aa  106  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000615425  normal  0.874412 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0614  peptidase M24  30.67 
 
 		 464 aa  106  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.178264 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2770  xaa-pro aminopeptidase  31.94 
 
 		 436 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1271  Xaa-Pro aminopeptidase  30.9 
 
 		 461 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3291  proline aminopeptidase P II  29.51 
 
 		 438 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2684  Xaa-Pro dipeptidase  31.25 
 
 		 463 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0623  aminopeptidase P  31.15 
 
 		 468 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920846  normal  0.361918 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3217  proline aminopeptidase P II  29.51 
 
 		 438 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00100894  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0588  peptidase M24  30.35 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5472  Xaa-Pro dipeptidase  27.43 
 
 		 472 aa  104  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.812118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>