77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0008 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0008  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  167  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482211  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0584  hypothetical protein  51.32 
 
 		 78 aa  76.3  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3892  hypothetical protein  43.59 
 
 		 78 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2119  hypothetical protein  43.59 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0915376  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1528  hypothetical protein  44.58 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.719633  normal  0.202496 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2645  hypothetical protein  44.93 
 
 		 72 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1163  hypothetical protein  44.44 
 
 		 73 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61010  hypothetical protein  43.04 
 
 		 84 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1388  protein of unknown function DUF465  43.84 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3133  hypothetical protein  43.84 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.143017  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2989  hypothetical protein  43.84 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.992485  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2975  hypothetical protein  43.84 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000873818  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3788  hypothetical protein  43.59 
 
 		 84 aa  65.5  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0715  protein of unknown function DUF465  40.79 
 
 		 80 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5251  hypothetical protein  41.77 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.464221  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4761  hypothetical protein  42.65 
 
 		 72 aa  65.1  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544295  normal  0.403355 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1847  hypothetical protein  39.24 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.301519  normal  0.093539 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1273  hypothetical protein  41.56 
 
 		 79 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4690  hypothetical protein  38.89 
 
 		 73 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0906435  normal  0.0131343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0426  hypothetical protein  40.85 
 
 		 82 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.751467  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1114  hypothetical protein  40.58 
 
 		 71 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601711  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3280  hypothetical protein  44.74 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0859  hypothetical protein  40.79 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000472034  hitchhiker  0.0000091308 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1880  hypothetical protein  39.24 
 
 		 79 aa  59.7  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0754  hypothetical protein  40.51 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0753  hypothetical protein  40.51 
 
 		 80 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4858  hypothetical protein  36.23 
 
 		 71 aa  57.4  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400364  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1244  hypothetical protein  42.47 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1314  hypothetical protein  42.47 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000026782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3963  hypothetical protein  39.24 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3920  hypothetical protein  39.24 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.787239  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0175  hypothetical protein  37.97 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.025388  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3645  hypothetical protein  41.33 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169985  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1294  hypothetical protein  41.1 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0154  hypothetical protein  37.97 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000241141  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6133  hypothetical protein  36.84 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.713405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1323  hypothetical protein  39.47 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.938492  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2344  hypothetical protein  37.66 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.519419 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1817  protein of unknown function DUF465  39.13 
 
 		 73 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0116394  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02520  hypothetical protein  38.24 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.148318  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1761  hypothetical protein  35.62 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1438  hypothetical protein  35.62 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.119684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3391  hypothetical protein  38.96 
 
 		 90 aa  51.2  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41080  hypothetical protein  29.87 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.441707  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3745  hypothetical protein  38.96 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0577  hypothetical protein  36.36 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4134  hypothetical protein  34.85 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0834  hypothetical protein  35.53 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0411  hypothetical protein  37.88 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0446  hypothetical protein  34.85 
 
 		 70 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00475096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3506  hypothetical protein  34.85 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00012483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3681  hypothetical protein  34.85 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0122929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4510  hypothetical protein  33.33 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0466  hypothetical protein  33.33 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000739571  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0490  hypothetical protein  33.33 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000900641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0487  hypothetical protein  33.33 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000002687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3853  hypothetical protein  33.33 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000215717  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3234  hypothetical protein  35.9 
 
 		 82 aa  43.5  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06468  hypothetical protein  37.68 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0542  hypothetical protein  33.33 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0502225  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3404  hypothetical protein  31.82 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3391  hypothetical protein  34.85 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000297352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1355  hypothetical protein  35.62 
 
 		 81 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2030  hypothetical protein  34.85 
 
 		 74 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171486  hitchhiker  0.0000000000000487786 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01383  hypothetical protein  32.86 
 
 		 74 aa  41.2  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01394  hypothetical protein  32.86 
 
 		 74 aa  41.2  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000608  hypothetical protein  37.5 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000125444  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1749  hypothetical protein  32.86 
 
 		 74 aa  41.2  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.297536  hitchhiker  6.336410000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2234  hypothetical protein  32.86 
 
 		 74 aa  41.2  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.282383 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1604  hypothetical protein  32.86 
 
 		 74 aa  41.2  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1507  hypothetical protein  32.86 
 
 		 74 aa  41.2  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2221  protein of unknown function DUF465  32.86 
 
 		 74 aa  41.2  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.322461  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3628  hypothetical protein  34.21 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000561848  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0459  hypothetical protein  30.3 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1031  conserved hypothetical protein (DUF465 domain protein)  39.68 
 
 		 71 aa  40.4  0.007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.453831  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2120  hypothetical protein  31.82 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0709  hypothetical protein  37.68 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>