89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0072 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0072  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 		 472 aa  952    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0176  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  33.07 
 
 		 374 aa  186  9e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0102462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0196  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  31.38 
 
 		 374 aa  177  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000200378  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4018  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  31.38 
 
 		 374 aa  177  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623611  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0534  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  31.38 
 
 		 374 aa  177  5e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0218  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase HemX  32.2 
 
 		 404 aa  171  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.763199  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00148  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.31 
 
 		 390 aa  166  8e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0177  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  32.08 
 
 		 377 aa  164  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0140625  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002104  HemX-like protein  31.41 
 
 		 403 aa  164  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0438  protein of unknown function DUF513, hemX  31.54 
 
 		 416 aa  162  9e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0386  protein of unknown function DUF513, hemX  32.46 
 
 		 403 aa  162  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.276274  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4023  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  30.75 
 
 		 391 aa  162  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000192392  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4204  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  30.75 
 
 		 397 aa  161  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0774615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4318  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  30.75 
 
 		 397 aa  161  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0179476  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4168  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  30.75 
 
 		 397 aa  160  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.524316  normal  0.397242 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00316  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.18 
 
 		 393 aa  160  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4262  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  30.75 
 
 		 421 aa  160  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03627  hypothetical protein  30.75 
 
 		 401 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.234561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03678  predicted uroporphyrinogen III methylase  30.75 
 
 		 401 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4176  protein of unknown function DUF513 hemX  31.03 
 
 		 393 aa  159  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.743979  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3982  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  33.2 
 
 		 374 aa  159  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0294425  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5241  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  30.46 
 
 		 405 aa  158  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3640  uroporphyrin-III C-methyltransferase HemX  29.13 
 
 		 380 aa  156  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4173  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  33.2 
 
 		 374 aa  156  7e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0524748  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0226  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  29.63 
 
 		 374 aa  156  8e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0340  protein of unknown function DUF513, hemX  32.08 
 
 		 458 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2400  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.36 
 
 		 399 aa  153  8e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.92491  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4149  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  29.01 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4218  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  29.01 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4325  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  29.01 
 
 		 389 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.802933 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4164  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  29.01 
 
 		 389 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000187856  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4135  protein of unknown function DUF513, HemX  30.1 
 
 		 383 aa  152  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4266  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  30.06 
 
 		 389 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.954268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3256  hemX protein  29.48 
 
 		 396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.30464 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3589  protein of unknown function DUF513, hemX  36.48 
 
 		 399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3989  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  30.23 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.145743  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4315  hemX protein  34.25 
 
 		 414 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3903  protein of unknown function DUF513 hemX  34.26 
 
 		 393 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0316  protein of unknown function DUF513, hemX  29.77 
 
 		 380 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3640  protein of unknown function DUF513, hemX  34.43 
 
 		 413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal  0.794889 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0386  protein of unknown function DUF513, hemX  34.07 
 
 		 409 aa  141  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3980  protein of unknown function DUF513 hemX  33.86 
 
 		 393 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4096  protein of unknown function DUF513 hemX  33.82 
 
 		 393 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.922963 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4002  hypothetical protein  33.45 
 
 		 393 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.143928  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0384  protein of unknown function DUF513, hemX  34.07 
 
 		 413 aa  139  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.410491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0371  protein of unknown function DUF513 hemX  35.78 
 
 		 397 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0046  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.49 
 
 		 399 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.120112  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0481  protein of unknown function DUF513 hemX  33.47 
 
 		 383 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3107  protein of unknown function DUF513, hemX  28.48 
 
 		 536 aa  107  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.52248  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0504  hypothetical protein  23.97 
 
 		 582 aa  100  8e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3665  YjgF-like protein  26.38 
 
 		 494 aa  92.4  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0485  protein of unknown function DUF513, hemX  24.86 
 
 		 369 aa  90.9  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3061  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.8 
 
 		 672 aa  85.9  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0027  protein of unknown function DUF513, HemX  24.82 
 
 		 424 aa  85.1  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3593  protein of unknown function DUF513 hemX  25.71 
 
 		 435 aa  84.7  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2205  putaitve hemX protein  24.01 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000920193  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2668  protein of unknown function DUF513, hemX  24.14 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000148689 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47580  HemX-like protein  28.57 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2176  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.73 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0060  hypothetical protein  25.45 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0033  protein of unknown function DUF513, hemX  25.87 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0258  protein of unknown function DUF513 hemX  27.56 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.871916 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0282  protein of unknown function DUF513, hemX  26.32 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0213  protein of unknown function DUF513 hemX  26.75 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1439  protein of unknown function DUF513 hemX  25.32 
 
 		 492 aa  62.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0210  protein of unknown function DUF513, hemX  26.75 
 
 		 366 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.582748  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0188  uroporphyrin-III C-methyltransferase, putative  26.75 
 
 		 375 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2793  hypothetical protein  25.89 
 
 		 374 aa  62.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2662  hypothetical protein  26.11 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0130  uroporphyrin-III C-methyltransferase, putative  25.65 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69430  hypothetical protein  24.55 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1027  protein of unknown function DUF513, hemX  25.97 
 
 		 552 aa  61.6  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.425311  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6004  hypothetical protein  25 
 
 		 375 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3410  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  22.7 
 
 		 672 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2165  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.84 
 
 		 665 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.255779 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3672  hypothetical protein  22.48 
 
 		 348 aa  54.7  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5485  hypothetical protein  25.32 
 
 		 380 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2356  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.99 
 
 		 695 aa  53.5  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134951  normal  0.286784 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1070  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  22.49 
 
 		 672 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2688  hypothetical protein  23.59 
 
 		 349 aa  53.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2892  protein of unknown function DUF513, hemX  23.58 
 
 		 358 aa  51.6  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.321706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2379  protein of unknown function DUF513 hemX  23.98 
 
 		 358 aa  51.2  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2424  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  21.04 
 
 		 656 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1812  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  21.04 
 
 		 656 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681171  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2566  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.67 
 
 		 343 aa  47  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2428  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  20.43 
 
 		 656 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.475486  normal  0.299485 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2178  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.33 
 
 		 686 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.280216  hitchhiker  0.000563849 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1997  protein of unknown function DUF513, hemX  24.1 
 
 		 360 aa  44.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  hitchhiker  0.00087964 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1376  protein of unknown function DUF513 hemX  25 
 
 		 363 aa  44.3  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.557955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>