82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_47580 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_47580  HemX-like protein  100 
 
 
337 aa  657    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0130  uroporphyrin-III C-methyltransferase, putative  51.95 
 
 
376 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0060  hypothetical protein  50.15 
 
 
391 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5485  hypothetical protein  51.59 
 
 
380 aa  292  7e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0258  protein of unknown function DUF513 hemX  48.7 
 
 
366 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.871916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0188  uroporphyrin-III C-methyltransferase, putative  47.7 
 
 
375 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0210  protein of unknown function DUF513, hemX  47.7 
 
 
366 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.582748  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0213  protein of unknown function DUF513 hemX  47.7 
 
 
366 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199068  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69430  hypothetical protein  48.77 
 
 
376 aa  255  6e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6004  hypothetical protein  49.03 
 
 
375 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0282  protein of unknown function DUF513, hemX  48.88 
 
 
376 aa  249  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0485  protein of unknown function DUF513, hemX  33.13 
 
 
369 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3665  YjgF-like protein  30.28 
 
 
494 aa  126  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3593  protein of unknown function DUF513 hemX  32.91 
 
 
435 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0340  protein of unknown function DUF513, hemX  31.42 
 
 
458 aa  102  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002104  HemX-like protein  27.61 
 
 
403 aa  96.3  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03678  predicted uroporphyrinogen III methylase  26.17 
 
 
401 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00148  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.97 
 
 
390 aa  96.3  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03627  hypothetical protein  26.17 
 
 
401 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.234561  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4168  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  26.17 
 
 
397 aa  95.9  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.524316  normal  0.397242 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4204  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  25.86 
 
 
397 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0774615  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4318  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  25.86 
 
 
397 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0179476  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4023  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  25.86 
 
 
391 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000192392  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4262  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  25.86 
 
 
421 aa  94  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5241  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  25.86 
 
 
405 aa  94  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00316  uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.3 
 
 
393 aa  93.6  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0196  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  27.54 
 
 
374 aa  92  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000200378  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4018  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  27.54 
 
 
374 aa  92  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623611  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0534  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  27.54 
 
 
374 aa  92  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3107  protein of unknown function DUF513, hemX  30.89 
 
 
536 aa  92.4  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.52248  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2793  hypothetical protein  25.83 
 
 
374 aa  90.9  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2662  hypothetical protein  25.83 
 
 
374 aa  90.5  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0176  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  26.59 
 
 
374 aa  89.4  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0102462  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4176  protein of unknown function DUF513 hemX  25.32 
 
 
393 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.743979  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0218  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase HemX  24.01 
 
 
404 aa  87  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.763199  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4266  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  25.32 
 
 
389 aa  86.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.954268  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2400  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.62 
 
 
399 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.92491  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4149  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  25 
 
 
389 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4218  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  25.32 
 
 
389 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3061  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.27 
 
 
672 aa  84.3  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4325  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  25 
 
 
389 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.802933 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4164  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  25 
 
 
389 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000187856  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0504  hypothetical protein  27.81 
 
 
582 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3989  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  23.99 
 
 
395 aa  77.8  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.145743  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3256  hemX protein  27.39 
 
 
396 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.30464 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0177  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  27.97 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0140625  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3640  uroporphyrin-III C-methyltransferase HemX  28.17 
 
 
380 aa  78.2  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0226  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  26.23 
 
 
374 aa  77.4  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4173  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  27.87 
 
 
374 aa  77  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0524748  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0033  protein of unknown function DUF513, hemX  25.95 
 
 
363 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3982  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  27.46 
 
 
374 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0294425  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0316  protein of unknown function DUF513, hemX  26.46 
 
 
380 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3903  protein of unknown function DUF513 hemX  28.51 
 
 
393 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4096  protein of unknown function DUF513 hemX  28.09 
 
 
393 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.922963 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0384  protein of unknown function DUF513, hemX  28.39 
 
 
413 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.410491  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3980  protein of unknown function DUF513 hemX  28.21 
 
 
393 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0072  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.38 
 
 
472 aa  70.5  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0046  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.1 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.120112  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3589  protein of unknown function DUF513, hemX  27 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4002  hypothetical protein  27.66 
 
 
393 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.143928  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0386  protein of unknown function DUF513, hemX  28.09 
 
 
409 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2205  putaitve hemX protein  27.12 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000920193  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3640  protein of unknown function DUF513, hemX  28.09 
 
 
413 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal  0.794889 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4135  protein of unknown function DUF513, HemX  27.27 
 
 
383 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0027  protein of unknown function DUF513, HemX  31.05 
 
 
424 aa  66.6  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2176  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.69 
 
 
320 aa  65.1  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4315  hemX protein  27.78 
 
 
414 aa  64.7  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0481  protein of unknown function DUF513 hemX  29.17 
 
 
383 aa  64.3  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0438  protein of unknown function DUF513, hemX  26.52 
 
 
416 aa  63.5  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2668  protein of unknown function DUF513, hemX  25.51 
 
 
403 aa  62.8  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000148689 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0386  protein of unknown function DUF513, hemX  26.69 
 
 
403 aa  63.2  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.276274  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1027  protein of unknown function DUF513, hemX  26.2 
 
 
552 aa  61.2  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.425311  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0371  protein of unknown function DUF513 hemX  27.78 
 
 
397 aa  59.7  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1439  protein of unknown function DUF513 hemX  28.61 
 
 
492 aa  56.6  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1070  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.45 
 
 
672 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2688  hypothetical protein  24.9 
 
 
349 aa  50.1  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3672  hypothetical protein  25.46 
 
 
348 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04232  hypothetical protein  28.77 
 
 
306 aa  48.5  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3410  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.11 
 
 
672 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2165  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.86 
 
 
665 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.255779 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2163  protein of unknown function DUF513 hemX  24.39 
 
 
410 aa  44.7  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2178  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.56 
 
 
686 aa  42.7  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.280216  hitchhiker  0.000563849 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>