76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0258 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_0258  protein of unknown function DUF513 hemX  100 
 
 
366 aa  718    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.871916 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0210  protein of unknown function DUF513, hemX  92.08 
 
 
366 aa  618  1e-176  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.582748  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0188  uroporphyrin-III C-methyltransferase, putative  91.53 
 
 
375 aa  614  1e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0213  protein of unknown function DUF513 hemX  91.53 
 
 
366 aa  614  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199068  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0060  hypothetical protein  60.27 
 
 
391 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0130  uroporphyrin-III C-methyltransferase, putative  60 
 
 
376 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5485  hypothetical protein  65.29 
 
 
380 aa  393  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0282  protein of unknown function DUF513, hemX  54.71 
 
 
376 aa  294  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69430  hypothetical protein  50 
 
 
376 aa  279  6e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6004  hypothetical protein  52.77 
 
 
375 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47580  HemX-like protein  48 
 
 
337 aa  259  7e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0485  protein of unknown function DUF513, hemX  30.17 
 
 
369 aa  127  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3593  protein of unknown function DUF513 hemX  27.91 
 
 
435 aa  104  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3665  YjgF-like protein  26.42 
 
 
494 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4149  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  28.49 
 
 
389 aa  99.8  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4023  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  27.68 
 
 
391 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000192392  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03627  hypothetical protein  27.97 
 
 
401 aa  99  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.234561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4318  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  27.68 
 
 
397 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0179476  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03678  predicted uroporphyrinogen III methylase  27.97 
 
 
401 aa  99  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4168  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  27.97 
 
 
397 aa  99  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.524316  normal  0.397242 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4204  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  27.68 
 
 
397 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0774615  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4218  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  28.49 
 
 
389 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4262  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  27.68 
 
 
421 aa  97.4  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4266  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  28.49 
 
 
389 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.954268  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0176  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  28.34 
 
 
374 aa  97.4  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0102462  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4164  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  28.21 
 
 
389 aa  97.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000187856  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4325  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  28.21 
 
 
389 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.802933 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5241  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  27.4 
 
 
405 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4176  protein of unknown function DUF513 hemX  27.4 
 
 
393 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.743979  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4018  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  26.92 
 
 
374 aa  90.9  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623611  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0534  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  26.92 
 
 
374 aa  90.9  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0196  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  26.92 
 
 
374 aa  90.9  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000200378  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3061  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.45 
 
 
672 aa  89  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00316  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.34 
 
 
393 aa  88.2  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002104  HemX-like protein  26.29 
 
 
403 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0177  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  26.88 
 
 
377 aa  84.3  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0140625  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3989  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  26.02 
 
 
395 aa  84.3  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.145743  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3107  protein of unknown function DUF513, hemX  30.4 
 
 
536 aa  81.3  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.52248  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0226  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  26.46 
 
 
374 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4173  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  29.44 
 
 
374 aa  77.8  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0524748  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3982  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  29.03 
 
 
374 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0294425  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0027  protein of unknown function DUF513, HemX  28.81 
 
 
424 aa  75.5  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0340  protein of unknown function DUF513, hemX  28.33 
 
 
458 aa  73.2  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2662  hypothetical protein  21.47 
 
 
374 aa  73.6  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00148  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.4 
 
 
390 aa  71.6  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0438  protein of unknown function DUF513, hemX  23.96 
 
 
416 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3640  uroporphyrin-III C-methyltransferase HemX  24.93 
 
 
380 aa  68.9  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0218  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase HemX  25.4 
 
 
404 aa  67.8  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.763199  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3256  hemX protein  24.69 
 
 
396 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.30464 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2793  hypothetical protein  21.45 
 
 
374 aa  66.6  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0504  hypothetical protein  24.11 
 
 
582 aa  65.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2400  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.13 
 
 
399 aa  65.1  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.92491  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0072  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.56 
 
 
472 aa  63.5  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4135  protein of unknown function DUF513, HemX  23.81 
 
 
383 aa  62.8  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0316  protein of unknown function DUF513, hemX  24.32 
 
 
380 aa  58.9  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0033  protein of unknown function DUF513, hemX  25.84 
 
 
363 aa  59.3  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3903  protein of unknown function DUF513 hemX  25.96 
 
 
393 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0371  protein of unknown function DUF513 hemX  24.83 
 
 
397 aa  58.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4096  protein of unknown function DUF513 hemX  24.36 
 
 
393 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.922963 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3980  protein of unknown function DUF513 hemX  25.53 
 
 
393 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0384  protein of unknown function DUF513, hemX  26.78 
 
 
413 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.410491  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0386  protein of unknown function DUF513, hemX  26.05 
 
 
409 aa  57  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0481  protein of unknown function DUF513 hemX  25.77 
 
 
383 aa  56.6  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3640  protein of unknown function DUF513, hemX  26.05 
 
 
413 aa  56.6  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal  0.794889 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4002  hypothetical protein  23.93 
 
 
393 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.143928  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0386  protein of unknown function DUF513, hemX  24.06 
 
 
403 aa  55.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.276274  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1439  protein of unknown function DUF513 hemX  25.96 
 
 
492 aa  54.3  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4315  hemX protein  25.63 
 
 
414 aa  53.5  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3589  protein of unknown function DUF513, hemX  25.86 
 
 
399 aa  51.2  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2176  uroporphyrin-III C-methyltransferase  22.06 
 
 
320 aa  50.4  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0701  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.64 
 
 
689 aa  50.4  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2205  putaitve hemX protein  22.97 
 
 
317 aa  49.7  0.00009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000920193  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1027  protein of unknown function DUF513, hemX  25.31 
 
 
552 aa  49.3  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.425311  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1070  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.46 
 
 
672 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2668  protein of unknown function DUF513, hemX  23.1 
 
 
403 aa  46.2  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000148689 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3410  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.35 
 
 
672 aa  42.7  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>