291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3410 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0731  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  65.85 
 
 
659 aa  742    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1078  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  65.85 
 
 
659 aa  742    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2283  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  65.85 
 
 
659 aa  742    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1231  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  65.7 
 
 
659 aa  739    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1072  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  65.85 
 
 
659 aa  742    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2178  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  71.66 
 
 
686 aa  875    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.280216  hitchhiker  0.000563849 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5751  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  63.62 
 
 
656 aa  747    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0870  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  64.69 
 
 
656 aa  713    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.787739 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3001  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  65.85 
 
 
659 aa  742    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0873  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  65.85 
 
 
659 aa  749    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3410  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
672 aa  1348    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1812  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  64.84 
 
 
656 aa  744    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681171  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2333  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  64.99 
 
 
655 aa  765    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.623737 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2467  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  65.3 
 
 
655 aa  773    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2424  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  64.84 
 
 
656 aa  744    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1596  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  65.85 
 
 
659 aa  742    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447843  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2428  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  64.69 
 
 
656 aa  747    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.475486  normal  0.299485 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1070  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  94.35 
 
 
672 aa  1233    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0701  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.99 
 
 
689 aa  499  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2748  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.65 
 
 
693 aa  463  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2356  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.96 
 
 
695 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134951  normal  0.286784 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2570  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  40.85 
 
 
702 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2165  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.32 
 
 
665 aa  225  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.255779 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3672  hypothetical protein  35.73 
 
 
348 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0033  protein of unknown function DUF513, hemX  33.91 
 
 
363 aa  185  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2688  hypothetical protein  34.14 
 
 
349 aa  180  9e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0766  protein of unknown function DUF513 hemX  36.77 
 
 
354 aa  172  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000143732 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1439  protein of unknown function DUF513 hemX  32.93 
 
 
492 aa  166  9e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2892  protein of unknown function DUF513, hemX  33 
 
 
358 aa  159  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.321706  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1438  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  41.26 
 
 
267 aa  158  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1997  protein of unknown function DUF513, hemX  32.7 
 
 
360 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  hitchhiker  0.00087964 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2379  protein of unknown function DUF513 hemX  32.67 
 
 
358 aa  156  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1038  protein of unknown function DUF513, hemX  32.11 
 
 
357 aa  155  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715062  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3673  uroporphyrinogen-III synthase  40.89 
 
 
260 aa  151  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0657  uroporphyrinogen III synthase HEM4  37.18 
 
 
274 aa  150  8e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3061  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.14 
 
 
672 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2566  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.12 
 
 
343 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2689  uroporphyrinogen-III synthase  37.97 
 
 
260 aa  148  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1199  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.77 
 
 
274 aa  144  6e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.843372  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1717  protein of unknown function DUF513, hemX  30.9 
 
 
369 aa  142  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1376  protein of unknown function DUF513 hemX  33.11 
 
 
363 aa  138  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.557955  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2230  protein of unknown function DUF513 hemX  28.97 
 
 
380 aa  137  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555979  hitchhiker  0.00638141 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3000  putative uroporphyrin-III methylase  36.69 
 
 
340 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0501277  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0028  Uroporphyrinogen-III synthase  36.57 
 
 
272 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3088  protein of unknown function DUF513, hemX  32.59 
 
 
386 aa  128  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.513686  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0011  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.2 
 
 
271 aa  123  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.458741 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0034  uroporphyrinogen-III synthase  31.94 
 
 
256 aa  118  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2378  uroporphyrinogen-III synthase  38.01 
 
 
272 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1375  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  36.92 
 
 
257 aa  114  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.297632  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0504  hypothetical protein  26.78 
 
 
582 aa  114  8.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2891  uroporphyrinogen-III synthase  38.78 
 
 
272 aa  114  8.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.328432  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3001  uroporphyrinogen-III synthase  39.45 
 
 
275 aa  113  9e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00619435  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1716  uroporphyrinogen III synthase  33.33 
 
 
273 aa  105  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3089  uroporphyrinogen III synthase  33.33 
 
 
287 aa  103  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.479559  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6005  uroporphyrinogen-III synthase  32.53 
 
 
251 aa  103  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201687  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69440  uroporphyrinogen-III synthase  31.73 
 
 
251 aa  100  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2231  uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.92 
 
 
269 aa  100  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.41378  hitchhiker  0.0093403 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0503  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.33 
 
 
265 aa  100  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3256  hemX protein  26.77 
 
 
396 aa  99.4  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.30464 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3592  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.43 
 
 
250 aa  98.6  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4135  protein of unknown function DUF513, HemX  27.04 
 
 
383 aa  98.6  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0765  uroporphyrinogen III synthase HEM4  34.26 
 
 
267 aa  98.2  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000129403 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2669  uroporphyrinogen-III synthase  36.69 
 
 
261 aa  98.6  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000490526 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47590  uroporphyrinogen-III synthase  33.85 
 
 
262 aa  98.2  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0176  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  25.19 
 
 
374 aa  97.8  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0102462  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0438  protein of unknown function DUF513, hemX  25.88 
 
 
416 aa  97.1  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2668  protein of unknown function DUF513, hemX  27.89 
 
 
403 aa  94.7  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000148689 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002104  HemX-like protein  26.6 
 
 
403 aa  94.7  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0481  protein of unknown function DUF513 hemX  27.53 
 
 
383 aa  92.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0386  protein of unknown function DUF513, hemX  27.61 
 
 
403 aa  92.8  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.276274  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1998  uroporphyrinogen III synthase  35.29 
 
 
279 aa  92.8  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000649837 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0281  uroporphyrinogen-III synthase  33.6 
 
 
257 aa  92  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00316  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.42 
 
 
393 aa  92.4  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0212  uroporphyrinogen-III synthase  33.33 
 
 
255 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475879  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0316  protein of unknown function DUF513, hemX  25.15 
 
 
380 aa  92  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3981  uroporphyrinogen-III synthase  31.85 
 
 
246 aa  91.3  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000864571  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0129  uroporphyrinogen-III synthetase  33.33 
 
 
258 aa  90.9  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0196  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  25.85 
 
 
374 aa  90.9  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000200378  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0534  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  25.85 
 
 
374 aa  90.9  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4018  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  25.85 
 
 
374 aa  90.9  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623611  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0061  uroporphyrinogen-III synthase  33.33 
 
 
257 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4172  uroporphyrinogen-III synthase  30.77 
 
 
246 aa  89.7  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0344779  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0485  protein of unknown function DUF513, hemX  26.44 
 
 
369 aa  89.7  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3062  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.82 
 
 
512 aa  88.6  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105684  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2400  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.52 
 
 
399 aa  88.6  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.92491  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00148  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.21 
 
 
390 aa  87.8  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1346  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.98 
 
 
511 aa  87.4  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.694338  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3107  protein of unknown function DUF513, hemX  30.43 
 
 
536 aa  87.4  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.52248  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0387  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.06 
 
 
238 aa  87  9e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.999258  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2176  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.66 
 
 
320 aa  86.7  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5486  uroporphyrinogen-III synthase  31.87 
 
 
255 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3665  YjgF-like protein  26.04 
 
 
494 aa  86.7  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0227  uroporphyrinogen-III synthase  28.79 
 
 
246 aa  86.7  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0177  uroporphyrinogen-III synthase  32.45 
 
 
246 aa  86.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.033755  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0187  uroporphyrinogen-III synthase  32 
 
 
255 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2205  putaitve hemX protein  25.66 
 
 
317 aa  86.3  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000920193  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0177  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  28.81 
 
 
377 aa  85.5  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0140625  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2567  uroporphyrinogen-III synthase  32.96 
 
 
252 aa  85.1  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.134092 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0197  uroporphyrinogen-III synthase  30.19 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00133341  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0535  uroporphyrinogen-III synthase  30.19 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>