87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2230 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2230  protein of unknown function DUF513 hemX  100 
 
 		 380 aa  735    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555979  hitchhiker  0.00638141 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1038  protein of unknown function DUF513, hemX  61.54 
 
 		 357 aa  389  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1997  protein of unknown function DUF513, hemX  61.54 
 
 		 360 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  hitchhiker  0.00087964 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2892  protein of unknown function DUF513, hemX  63.44 
 
 		 358 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.321706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2379  protein of unknown function DUF513 hemX  62.81 
 
 		 358 aa  364  1e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1376  protein of unknown function DUF513 hemX  56.43 
 
 		 363 aa  312  7.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.557955  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1717  protein of unknown function DUF513, hemX  55.03 
 
 		 369 aa  299  6e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3088  protein of unknown function DUF513, hemX  54.6 
 
 		 386 aa  290  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.513686  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0766  protein of unknown function DUF513 hemX  43.53 
 
 		 354 aa  237  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000143732 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3000  putative uroporphyrin-III methylase  46.62 
 
 		 340 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0501277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0701  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.03 
 
 		 689 aa  176  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2165  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.44 
 
 		 665 aa  150  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.255779 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2570  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.44 
 
 		 702 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2356  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.44 
 
 		 695 aa  142  9e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134951  normal  0.286784 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1439  protein of unknown function DUF513 hemX  30.03 
 
 		 492 aa  136  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3672  hypothetical protein  33.54 
 
 		 348 aa  135  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2748  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.97 
 
 		 693 aa  132  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2428  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.27 
 
 		 656 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.475486  normal  0.299485 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0033  protein of unknown function DUF513, hemX  27.46 
 
 		 363 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2467  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.88 
 
 		 655 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2333  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.47 
 
 		 655 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.623737 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2283  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.47 
 
 		 659 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3001  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.47 
 
 		 659 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1072  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.47 
 
 		 659 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1231  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.47 
 
 		 659 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1078  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.47 
 
 		 659 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0731  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.47 
 
 		 659 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1596  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.47 
 
 		 659 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447843  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2688  hypothetical protein  27.36 
 
 		 349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1812  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.97 
 
 		 656 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681171  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2424  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.97 
 
 		 656 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5751  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.97 
 
 		 656 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1070  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.05 
 
 		 672 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0873  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.13 
 
 		 659 aa  117  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3410  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.05 
 
 		 672 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2178  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  28.98 
 
 		 686 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.280216  hitchhiker  0.000563849 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0870  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.59 
 
 		 656 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.787739 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2566  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.71 
 
 		 343 aa  95.5  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2205  putaitve hemX protein  25.76 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000920193  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4135  protein of unknown function DUF513, HemX  24.18 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2176  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.08 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3256  hemX protein  24.69 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.30464 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3980  protein of unknown function DUF513 hemX  28.42 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4096  protein of unknown function DUF513 hemX  28.42 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.922963 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4002  hypothetical protein  28.42 
 
 		 393 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.143928  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0481  protein of unknown function DUF513 hemX  26.2 
 
 		 383 aa  65.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3903  protein of unknown function DUF513 hemX  28.42 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0386  protein of unknown function DUF513, hemX  25.82 
 
 		 409 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3640  protein of unknown function DUF513, hemX  25.82 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal  0.794889 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0384  protein of unknown function DUF513, hemX  28.42 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.410491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0218  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase HemX  22.73 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.763199  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002104  HemX-like protein  23.57 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3665  YjgF-like protein  24.81 
 
 		 494 aa  62.4  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4315  hemX protein  28.89 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0316  protein of unknown function DUF513, hemX  26.87 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3061  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.55 
 
 		 672 aa  61.2  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0438  protein of unknown function DUF513, hemX  24.05 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3589  protein of unknown function DUF513, hemX  27.22 
 
 		 399 aa  59.7  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0386  protein of unknown function DUF513, hemX  26.22 
 
 		 403 aa  59.7  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.276274  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00316  uroporphyrin-III C-methyltransferase  21.26 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0485  protein of unknown function DUF513, hemX  23.7 
 
 		 369 aa  59.3  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3982  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  26.15 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0294425  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0371  protein of unknown function DUF513 hemX  26.29 
 
 		 397 aa  57  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0177  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  23.72 
 
 		 377 aa  55.8  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0140625  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4173  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  25.51 
 
 		 374 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0524748  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2400  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.85 
 
 		 399 aa  54.3  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.92491  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0027  protein of unknown function DUF513, HemX  26.06 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3107  protein of unknown function DUF513, hemX  28.51 
 
 		 536 aa  51.6  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.52248  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0046  uroporphyrin-III C-methyltransferase  22.48 
 
 		 399 aa  50.4  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.120112  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0226  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  25.18 
 
 		 374 aa  50.8  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0176  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  24.46 
 
 		 374 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0102462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0196  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  22.95 
 
 		 374 aa  47  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000200378  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4018  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  22.95 
 
 		 374 aa  47  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623611  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0534  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  22.95 
 
 		 374 aa  47  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3640  uroporphyrin-III C-methyltransferase HemX  21.49 
 
 		 380 aa  46.2  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00148  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.62 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5241  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  24.44 
 
 		 405 aa  44.3  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4262  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  24.44 
 
 		 421 aa  44.3  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4204  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  24.44 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0774615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4023  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  24.44 
 
 		 391 aa  44.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000192392  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4318  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  24.44 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0179476  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4176  protein of unknown function DUF513 hemX  24.44 
 
 		 393 aa  44.3  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.743979  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03678  predicted uroporphyrinogen III methylase  24.44 
 
 		 401 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4168  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  24.44 
 
 		 397 aa  43.9  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.524316  normal  0.397242 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03627  hypothetical protein  24.44 
 
 		 401 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.234561  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3989  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  23.63 
 
 		 395 aa  43.1  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.145743  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0340  protein of unknown function DUF513, hemX  23.76 
 
 		 458 aa  42.7  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>