106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3665 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_3665  YjgF-like protein  100 
 
 
494 aa  996    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0485  protein of unknown function DUF513, hemX  30.13 
 
 
369 aa  143  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0176  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  28.95 
 
 
374 aa  137  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0102462  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3107  protein of unknown function DUF513, hemX  37.5 
 
 
536 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.52248  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0196  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  27.59 
 
 
374 aa  130  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000200378  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0534  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  27.59 
 
 
374 aa  130  6e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4018  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  27.59 
 
 
374 aa  130  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623611  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3593  protein of unknown function DUF513 hemX  28.54 
 
 
435 aa  126  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4023  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  28.78 
 
 
391 aa  125  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000192392  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4318  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  28.78 
 
 
397 aa  125  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0179476  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4204  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  28.78 
 
 
397 aa  125  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0774615  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4262  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  28.78 
 
 
421 aa  125  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4176  protein of unknown function DUF513 hemX  30.04 
 
 
393 aa  124  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.743979  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5241  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  30.04 
 
 
405 aa  124  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0218  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase HemX  30.06 
 
 
404 aa  124  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.763199  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0226  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  29.84 
 
 
374 aa  123  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03678  predicted uroporphyrinogen III methylase  28.49 
 
 
401 aa  123  9e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4168  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  28.49 
 
 
397 aa  123  9e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.524316  normal  0.397242 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03627  hypothetical protein  28.49 
 
 
401 aa  123  9e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.234561  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47580  HemX-like protein  33.21 
 
 
337 aa  122  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00316  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.09 
 
 
393 aa  120  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002104  HemX-like protein  30.58 
 
 
403 aa  120  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4266  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  29.18 
 
 
389 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.954268  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0177  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  28.81 
 
 
377 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0140625  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4218  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  28.88 
 
 
389 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4149  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  28.84 
 
 
389 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4164  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  28.88 
 
 
389 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000187856  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4325  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  28.88 
 
 
389 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.802933 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3982  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  30.15 
 
 
374 aa  116  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0294425  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4173  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  31.16 
 
 
374 aa  116  7.999999999999999e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0524748  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3989  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  28.34 
 
 
395 aa  116  7.999999999999999e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.145743  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0504  hypothetical protein  26.73 
 
 
582 aa  114  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0371  protein of unknown function DUF513 hemX  29.58 
 
 
397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0481  protein of unknown function DUF513 hemX  28.42 
 
 
383 aa  110  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2793  hypothetical protein  29.2 
 
 
374 aa  109  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2662  hypothetical protein  29.2 
 
 
374 aa  109  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0340  protein of unknown function DUF513, hemX  29.33 
 
 
458 aa  109  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0438  protein of unknown function DUF513, hemX  27.38 
 
 
416 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4135  protein of unknown function DUF513, HemX  26.72 
 
 
383 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0060  hypothetical protein  28.35 
 
 
391 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3256  hemX protein  28.35 
 
 
396 aa  103  8e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.30464 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00148  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.96 
 
 
390 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3980  protein of unknown function DUF513 hemX  30.67 
 
 
393 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0027  protein of unknown function DUF513, HemX  27.91 
 
 
424 aa  101  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0316  protein of unknown function DUF513, hemX  25.37 
 
 
380 aa  100  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3903  protein of unknown function DUF513 hemX  31.05 
 
 
393 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4002  hypothetical protein  30.67 
 
 
393 aa  100  8e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.143928  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0130  uroporphyrin-III C-methyltransferase, putative  27.96 
 
 
376 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0386  protein of unknown function DUF513, hemX  28.47 
 
 
409 aa  99.8  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3640  protein of unknown function DUF513, hemX  28.47 
 
 
413 aa  99.4  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal  0.794889 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4096  protein of unknown function DUF513 hemX  30.25 
 
 
393 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.922963 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2400  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.26 
 
 
399 aa  98.2  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.92491  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0046  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.62 
 
 
399 aa  97.8  4e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.120112  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0384  protein of unknown function DUF513, hemX  27.85 
 
 
413 aa  97.8  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.410491  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0033  protein of unknown function DUF513, hemX  28.65 
 
 
363 aa  97.4  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3589  protein of unknown function DUF513, hemX  26.74 
 
 
399 aa  97.1  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4315  hemX protein  30.54 
 
 
414 aa  95.9  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3640  uroporphyrin-III C-methyltransferase HemX  27.62 
 
 
380 aa  95.5  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0258  protein of unknown function DUF513 hemX  28.53 
 
 
366 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.871916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0188  uroporphyrin-III C-methyltransferase, putative  27.81 
 
 
375 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0282  protein of unknown function DUF513, hemX  31.51 
 
 
376 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0210  protein of unknown function DUF513, hemX  27.81 
 
 
366 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.582748  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0213  protein of unknown function DUF513 hemX  27.81 
 
 
366 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199068  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0386  protein of unknown function DUF513, hemX  25.4 
 
 
403 aa  87.8  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.276274  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0072  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.7 
 
 
472 aa  86.7  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1027  protein of unknown function DUF513, hemX  28.1 
 
 
552 aa  85.9  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.425311  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0701  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.68 
 
 
689 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5485  hypothetical protein  28.42 
 
 
380 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2570  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.98 
 
 
702 aa  83.2  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2205  putaitve hemX protein  24.6 
 
 
317 aa  82.4  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000920193  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2165  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.82 
 
 
665 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.255779 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2176  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.33 
 
 
320 aa  79  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3061  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.89 
 
 
672 aa  76.6  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1439  protein of unknown function DUF513 hemX  26.05 
 
 
492 aa  74.3  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2356  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.92 
 
 
695 aa  74.3  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134951  normal  0.286784 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1070  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.56 
 
 
672 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3410  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.56 
 
 
672 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69430  hypothetical protein  28.47 
 
 
376 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2668  protein of unknown function DUF513, hemX  24.81 
 
 
403 aa  68.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000148689 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6004  hypothetical protein  29.5 
 
 
375 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2688  hypothetical protein  26.38 
 
 
349 aa  68.6  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3088  protein of unknown function DUF513, hemX  27.54 
 
 
386 aa  67.4  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.513686  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2748  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.38 
 
 
693 aa  63.5  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3672  hypothetical protein  25.06 
 
 
348 aa  60.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1038  protein of unknown function DUF513, hemX  25.21 
 
 
357 aa  56.2  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715062  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2230  protein of unknown function DUF513 hemX  24.78 
 
 
380 aa  55.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555979  hitchhiker  0.00638141 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2428  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.93 
 
 
656 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.475486  normal  0.299485 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5751  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.07 
 
 
656 aa  55.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2163  protein of unknown function DUF513 hemX  31.01 
 
 
410 aa  53.9  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1997  protein of unknown function DUF513, hemX  24.51 
 
 
360 aa  53.9  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  hitchhiker  0.00087964 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2333  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.12 
 
 
655 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.623737 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2467  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.12 
 
 
655 aa  50.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1812  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.91 
 
 
656 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681171  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2424  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.91 
 
 
656 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2178  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.62 
 
 
686 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.280216  hitchhiker  0.000563849 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2892  protein of unknown function DUF513, hemX  25.76 
 
 
358 aa  49.3  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.321706  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2379  protein of unknown function DUF513 hemX  25.76 
 
 
358 aa  48.5  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2566  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.08 
 
 
343 aa  46.2  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1717  protein of unknown function DUF513, hemX  25 
 
 
369 aa  46.6  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0873  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  22.75 
 
 
659 aa  44.7  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>