262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0701 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0701  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
689 aa  1362    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2748  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  73.04 
 
 
693 aa  908    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2356  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  47.7 
 
 
695 aa  549  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134951  normal  0.286784 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2570  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  49.08 
 
 
702 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1070  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.96 
 
 
672 aa  484  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3410  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.82 
 
 
672 aa  477  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2467  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.52 
 
 
655 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2178  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.35 
 
 
686 aa  443  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.280216  hitchhiker  0.000563849 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2333  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.8 
 
 
655 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.623737 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1078  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.91 
 
 
659 aa  428  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3001  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.91 
 
 
659 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0731  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.91 
 
 
659 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1072  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.91 
 
 
659 aa  428  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1231  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.91 
 
 
659 aa  428  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1596  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.91 
 
 
659 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447843  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2283  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.91 
 
 
659 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5751  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.87 
 
 
656 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1812  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.88 
 
 
656 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681171  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2424  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.88 
 
 
656 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0873  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.76 
 
 
659 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2428  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.71 
 
 
656 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.475486  normal  0.299485 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0870  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.88 
 
 
656 aa  405  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.787739 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2165  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  54.6 
 
 
665 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.255779 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0033  protein of unknown function DUF513, hemX  35.07 
 
 
363 aa  197  7e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1997  protein of unknown function DUF513, hemX  38.14 
 
 
360 aa  189  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  hitchhiker  0.00087964 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3672  hypothetical protein  34.81 
 
 
348 aa  188  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1439  protein of unknown function DUF513 hemX  35.85 
 
 
492 aa  188  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2566  uroporphyrin-III C-methyltransferase  39.16 
 
 
343 aa  179  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1038  protein of unknown function DUF513, hemX  33.8 
 
 
357 aa  179  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715062  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2688  hypothetical protein  34.09 
 
 
349 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2230  protein of unknown function DUF513 hemX  32.62 
 
 
380 aa  170  8e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.555979  hitchhiker  0.00638141 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1376  protein of unknown function DUF513 hemX  38.11 
 
 
363 aa  167  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.557955  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2892  protein of unknown function DUF513, hemX  34.19 
 
 
358 aa  163  9e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.321706  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2379  protein of unknown function DUF513 hemX  34.52 
 
 
358 aa  161  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3088  protein of unknown function DUF513, hemX  37.22 
 
 
386 aa  159  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.513686  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1438  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  41.84 
 
 
267 aa  156  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0766  protein of unknown function DUF513 hemX  34.63 
 
 
354 aa  156  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000143732 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1717  protein of unknown function DUF513, hemX  33.88 
 
 
369 aa  153  8.999999999999999e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3000  putative uroporphyrin-III methylase  38.26 
 
 
340 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0501277  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1199  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  33.9 
 
 
274 aa  139  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.843372  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3673  uroporphyrinogen-III synthase  37.46 
 
 
260 aa  137  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0657  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.09 
 
 
274 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0034  uroporphyrinogen-III synthase  34.07 
 
 
256 aa  128  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2689  uroporphyrinogen-III synthase  32.64 
 
 
260 aa  125  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3061  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.73 
 
 
672 aa  122  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4135  protein of unknown function DUF513, HemX  29.09 
 
 
383 aa  118  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0011  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.5 
 
 
271 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.458741 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2891  uroporphyrinogen-III synthase  36.84 
 
 
272 aa  114  7.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.328432  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0438  protein of unknown function DUF513, hemX  26.39 
 
 
416 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2378  uroporphyrinogen-III synthase  36.14 
 
 
272 aa  110  6e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3256  hemX protein  28.53 
 
 
396 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.30464 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0028  Uroporphyrinogen-III synthase  32.75 
 
 
272 aa  108  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0765  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.19 
 
 
267 aa  107  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000129403 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2231  uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.27 
 
 
269 aa  107  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.41378  hitchhiker  0.0093403 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0371  protein of unknown function DUF513 hemX  27.07 
 
 
397 aa  103  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1375  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  35.34 
 
 
257 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.297632  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3001  uroporphyrinogen-III synthase  36.52 
 
 
275 aa  102  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00619435  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0316  protein of unknown function DUF513, hemX  27.35 
 
 
380 aa  101  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0481  protein of unknown function DUF513 hemX  26.89 
 
 
383 aa  100  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0504  hypothetical protein  29.45 
 
 
582 aa  99.8  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0386  protein of unknown function DUF513, hemX  28.36 
 
 
403 aa  100  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.276274  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0485  protein of unknown function DUF513, hemX  27.46 
 
 
369 aa  100  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0503  uroporphyrinogen III synthase HEM4  32.1 
 
 
265 aa  99  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1716  uroporphyrinogen III synthase  31.16 
 
 
273 aa  97.1  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3089  uroporphyrinogen III synthase  32.19 
 
 
287 aa  97.1  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.479559  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0317  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.88 
 
 
243 aa  94.4  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0387  uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.62 
 
 
238 aa  94  9e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.999258  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2162  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.69 
 
 
256 aa  93.2  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3665  YjgF-like protein  25.77 
 
 
494 aa  92  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3982  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  29.68 
 
 
374 aa  92  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0294425  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4176  protein of unknown function DUF513 hemX  29.46 
 
 
393 aa  91.3  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.743979  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1998  uroporphyrinogen III synthase  31.65 
 
 
279 aa  90.5  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000649837 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4023  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  29.46 
 
 
391 aa  90.5  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000192392  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3980  protein of unknown function DUF513 hemX  26.95 
 
 
393 aa  90.1  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4134  uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.98 
 
 
244 aa  90.1  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4318  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  29.46 
 
 
397 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0179476  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4262  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  29.46 
 
 
421 aa  89.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4204  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  29.46 
 
 
397 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0774615  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0177  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  25.22 
 
 
377 aa  89.7  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0140625  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03678  predicted uroporphyrinogen III methylase  29.46 
 
 
401 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4096  protein of unknown function DUF513 hemX  26.59 
 
 
393 aa  89.4  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.922963 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03627  hypothetical protein  29.46 
 
 
401 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.234561  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2567  uroporphyrinogen-III synthase  33.93 
 
 
252 aa  89.4  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.134092 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002104  HemX-like protein  23.69 
 
 
403 aa  89.7  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00316  uroporphyrin-III C-methyltransferase  24.86 
 
 
393 aa  89  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4168  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  29.46 
 
 
397 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.524316  normal  0.397242 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0176  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  26.49 
 
 
374 aa  89  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0102462  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3903  protein of unknown function DUF513 hemX  26.19 
 
 
393 aa  89  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0226  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  26.16 
 
 
374 aa  88.6  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4173  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  28.62 
 
 
374 aa  87.8  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0524748  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4002  hypothetical protein  26.56 
 
 
393 aa  87.8  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.143928  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5241  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  29.05 
 
 
405 aa  87.4  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3107  protein of unknown function DUF513, hemX  30.74 
 
 
536 aa  86.7  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.52248  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0386  protein of unknown function DUF513, hemX  28.57 
 
 
409 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0218  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase HemX  25.2 
 
 
404 aa  85.9  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.763199  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0384  protein of unknown function DUF513, hemX  28.84 
 
 
413 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.410491  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4315  hemX protein  28.97 
 
 
414 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3989  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  28.01 
 
 
395 aa  85.9  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.145743  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3640  protein of unknown function DUF513, hemX  28.57 
 
 
413 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal  0.794889 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3592  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.28 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>