77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0213 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0188  uroporphyrin-III C-methyltransferase, putative  98.36 
 
 		 375 aa  704    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0210  protein of unknown function DUF513, hemX  98.91 
 
 		 366 aa  707    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.582748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0213  protein of unknown function DUF513 hemX  100 
 
 		 366 aa  714    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0258  protein of unknown function DUF513 hemX  91.53 
 
 		 366 aa  627  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.871916 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0060  hypothetical protein  61.62 
 
 		 391 aa  408  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0130  uroporphyrin-III C-methyltransferase, putative  61.62 
 
 		 376 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5485  hypothetical protein  65.11 
 
 		 380 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0282  protein of unknown function DUF513, hemX  55.13 
 
 		 376 aa  293  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69430  hypothetical protein  51.12 
 
 		 376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6004  hypothetical protein  54.72 
 
 		 375 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47580  HemX-like protein  47.33 
 
 		 337 aa  258  8e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0485  protein of unknown function DUF513, hemX  33.03 
 
 		 369 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3593  protein of unknown function DUF513 hemX  28.46 
 
 		 435 aa  105  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0176  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  27.73 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0102462  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03678  predicted uroporphyrinogen III methylase  28.09 
 
 		 401 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256191  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4168  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  28.09 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.524316  normal  0.397242 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03627  hypothetical protein  28.09 
 
 		 401 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.234561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4204  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  27.81 
 
 		 397 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0774615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4318  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  27.81 
 
 		 397 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0179476  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4023  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  27.81 
 
 		 391 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000192392  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3665  YjgF-like protein  26.6 
 
 		 494 aa  100  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4262  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  27.81 
 
 		 421 aa  99.4  8e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5241  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  27.53 
 
 		 405 aa  99  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3989  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  28.57 
 
 		 395 aa  98.6  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.145743  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4149  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  28.21 
 
 		 389 aa  97.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4176  protein of unknown function DUF513 hemX  28.12 
 
 		 393 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.743979  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4218  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  28.21 
 
 		 389 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4266  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  28.21 
 
 		 389 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.954268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4164  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  27.93 
 
 		 389 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000187856  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4325  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  27.93 
 
 		 389 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.802933 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4018  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  27.56 
 
 		 374 aa  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623611  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0534  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  27.56 
 
 		 374 aa  91.7  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0196  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  27.56 
 
 		 374 aa  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000200378  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3061  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.22 
 
 		 672 aa  91.7  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4173  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  30.8 
 
 		 374 aa  86.7  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0524748  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002104  HemX-like protein  28.14 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0177  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  29.49 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0140625  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3982  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  30 
 
 		 374 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0294425  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3107  protein of unknown function DUF513, hemX  30.4 
 
 		 536 aa  82  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.52248  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2662  hypothetical protein  22.25 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00316  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.03 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0340  protein of unknown function DUF513, hemX  29.17 
 
 		 458 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0027  protein of unknown function DUF513, HemX  28.73 
 
 		 424 aa  77  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2793  hypothetical protein  21.98 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0226  putative uroporphyrinogen III C-methyltransferase  27.71 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0033  protein of unknown function DUF513, hemX  27.73 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00148  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.51 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2400  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.23 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.92491  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0438  protein of unknown function DUF513, hemX  25.08 
 
 		 416 aa  72  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0218  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase HemX  28.69 
 
 		 404 aa  72  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.763199  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3256  hemX protein  25.81 
 
 		 396 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.30464 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3640  uroporphyrin-III C-methyltransferase HemX  25.49 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0504  hypothetical protein  25.7 
 
 		 582 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3589  protein of unknown function DUF513, hemX  28.12 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0316  protein of unknown function DUF513, hemX  25.31 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3903  protein of unknown function DUF513 hemX  26.81 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4096  protein of unknown function DUF513 hemX  26.38 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.922963 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0384  protein of unknown function DUF513, hemX  26.38 
 
 		 413 aa  63.2  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.410491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3640  protein of unknown function DUF513, hemX  26.38 
 
 		 413 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.776641  normal  0.794889 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0072  putative uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.37 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0386  protein of unknown function DUF513, hemX  26.38 
 
 		 409 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0371  protein of unknown function DUF513 hemX  26.14 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3980  protein of unknown function DUF513 hemX  25.96 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4135  protein of unknown function DUF513, HemX  24.79 
 
 		 383 aa  59.7  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4002  hypothetical protein  25.53 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.143928  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4315  hemX protein  25.53 
 
 		 414 aa  57  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0481  protein of unknown function DUF513 hemX  25.19 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1027  protein of unknown function DUF513, hemX  26.94 
 
 		 552 aa  55.8  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.425311  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2176  uroporphyrin-III C-methyltransferase  22.74 
 
 		 320 aa  54.3  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2205  putaitve hemX protein  22.87 
 
 		 317 aa  53.1  0.000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000920193  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1439  protein of unknown function DUF513 hemX  25.57 
 
 		 492 aa  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0386  protein of unknown function DUF513, hemX  23.92 
 
 		 403 aa  51.2  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.276274  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2668  protein of unknown function DUF513, hemX  25.82 
 
 		 403 aa  48.9  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000148689 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0701  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.55 
 
 		 689 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1070  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.87 
 
 		 672 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0046  uroporphyrin-III C-methyltransferase  21.96 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.120112  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3410  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.57 
 
 		 672 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>