34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0088 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0088  glyoxalase family protein  100 
 
 		 138 aa  286  6e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3000  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  72.46 
 
 		 138 aa  214  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0247436  normal  0.442163 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3178  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  72.46 
 
 		 138 aa  214  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3081  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  72.46 
 
 		 138 aa  214  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0448436  normal  0.495021 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0913  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  71.01 
 
 		 140 aa  213  9e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.943234 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1016  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  71.74 
 
 		 138 aa  212  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144748  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3280  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  71.74 
 
 		 138 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0562613 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1111  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  71.74 
 
 		 138 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00744956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1078  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  71.74 
 
 		 138 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1009  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  71.74 
 
 		 138 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.238543  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1045  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  66.67 
 
 		 139 aa  206  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.702459 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2789  glyoxalase family protein  67.39 
 
 		 142 aa  203  6e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3586  glyoxalase family protein  67.39 
 
 		 138 aa  201  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0992  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64.49 
 
 		 139 aa  201  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0886  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.22 
 
 		 139 aa  196  7e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001042  lactoylglutathione lyase  63.24 
 
 		 139 aa  191  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2124  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.87 
 
 		 139 aa  184  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0194253  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04755  lactoylglutathione lyase  60.29 
 
 		 139 aa  180  6e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1566  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.82 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0760824  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4210  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.72 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2166  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.09 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0593975  normal  0.513472 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2495  hypothetical protein  26.24 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3747  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.23 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2180  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.82 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4485  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.43 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0261666  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0953  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.08 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136753  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2268  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.27 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337413  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5788  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.29 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0683068  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0981  methylmalonyl-CoA epimerase  27.14 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0245792  normal  0.390705 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0389  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  21.95 
 
 		 131 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.258603 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4478  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.85 
 
 		 132 aa  41.6  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.613578 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1491  glyoxalase I/lactoylglutathione lyase  28.91 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.111293  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1581  glyoxalase family protein  25.78 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2033  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.15 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.543398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>