51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2223 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2223  hypothetical protein  100 
 
 		 858 aa  1768    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2195  hypothetical protein  97.67 
 
 		 858 aa  1707    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0987  hypothetical protein  28.3 
 
 		 911 aa  367  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000754464  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  27.52 
 
 		 913 aa  321  3e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0722  hypothetical protein  26.59 
 
 		 930 aa  318  3e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.851206  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1374  hypothetical protein  28.7 
 
 		 862 aa  303  9e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886385  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1314  ATP-dependent nuclease subunit B  28.47 
 
 		 872 aa  301  3e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00191673  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  26.91 
 
 		 896 aa  276  8e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3621  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  26.61 
 
 		 906 aa  273  7e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221768  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0972  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  26.67 
 
 		 916 aa  265  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0467  hypothetical protein  26 
 
 		 912 aa  261  4e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1698  hypothetical protein  28.82 
 
 		 922 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.88 
 
 		 935 aa  193  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1752  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  23.4 
 
 		 940 aa  190  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.894533 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0479  ATP-dependent nuclease subunit B-like  21.86 
 
 		 908 aa  80.1  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.236866  hitchhiker  0.000840779 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  24.32 
 
 		 951 aa  64.3  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  22.1 
 
 		 780 aa  63.9  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  21.74 
 
 		 911 aa  63.9  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  24.07 
 
 		 976 aa  62.4  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1156  hypothetical protein  21.16 
 
 		 865 aa  60.8  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  22.33 
 
 		 1037 aa  59.3  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0454  hypothetical protein  21.89 
 
 		 969 aa  56.6  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  21.7 
 
 		 957 aa  56.6  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0460  hypothetical protein  21.89 
 
 		 969 aa  56.6  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  19.45 
 
 		 836 aa  52.4  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  20.94 
 
 		 1049 aa  51.6  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  23.25 
 
 		 1054 aa  51.2  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  21.21 
 
 		 962 aa  50.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  22.12 
 
 		 803 aa  50.4  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3960  double-strand break repair protein AddB  21.47 
 
 		 1064 aa  50.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  20.68 
 
 		 958 aa  49.3  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  20.57 
 
 		 781 aa  49.3  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  22.42 
 
 		 1047 aa  48.5  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  22.62 
 
 		 788 aa  48.5  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  21.34 
 
 		 1049 aa  48.5  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0491  double-strand break repair protein AddB  20.82 
 
 		 1040 aa  48.1  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  22.77 
 
 		 788 aa  47.8  0.0008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  21.71 
 
 		 1047 aa  47.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1658  hypothetical protein  21.39 
 
 		 1039 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  22.19 
 
 		 1062 aa  47  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  28.99 
 
 		 919 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1837  hypothetical protein  21.92 
 
 		 909 aa  46.2  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57891  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00780  hypothetical protein  28.64 
 
 		 990 aa  47  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  21.34 
 
 		 1049 aa  46.6  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  20.81 
 
 		 951 aa  45.8  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  22.37 
 
 		 788 aa  45.8  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2845  hypothetical protein  20.84 
 
 		 977 aa  45.8  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0978  hypothetical protein  23.31 
 
 		 1000 aa  45.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.263512  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  18.54 
 
 		 1048 aa  44.7  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0522  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  23.64 
 
 		 1121 aa  44.3  0.01  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0988  UvrD/REP helicase  23.5 
 
 		 1146 aa  44.3  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.181635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>