56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0506 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0506  putative tellurium resistance protein  100 
 
 
212 aa  440  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0568  von Willebrand factor type A  100 
 
 
233 aa  441  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1088  putative tellurium resistance protein  99.53 
 
 
222 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3685  von Willebrand factor type A  88.21 
 
 
212 aa  397  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523422  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4667  von Willebrand factor, type A  65.88 
 
 
213 aa  299  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40968  normal  0.0500765 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0629  hypothetical protein  51.18 
 
 
225 aa  232  3e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1170  von Willebrand factor type A  53.3 
 
 
211 aa  226  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.906773 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0628  hypothetical protein  50.23 
 
 
212 aa  205  4e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1166  von Willebrand factor type A  50.79 
 
 
212 aa  200  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4669  von Willebrand factor, type A  50.69 
 
 
212 aa  199  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264174  normal  0.0341202 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0570  von Willebrand factor type A  48.15 
 
 
212 aa  193  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1086  putative tellurium resistance protein  48.15 
 
 
212 aa  193  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0508  putative tellurium resistance protein  48.15 
 
 
212 aa  193  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3687  von Willebrand factor type A  48.15 
 
 
212 aa  194  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189845  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2991  von Willebrand factor type A  40.38 
 
 
219 aa  164  8e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00948375  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3684  von Willebrand factor type A  38.46 
 
 
346 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.497723  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0505  putative tellurium resistance protein  35.75 
 
 
346 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0567  von Willebrand factor type A  35.75 
 
 
346 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1089  putative tellurium resistance protein  35.75 
 
 
346 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4666  von Willebrand factor, type A  36.36 
 
 
350 aa  131  9e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.404551  normal  0.0464435 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1172  von Willebrand factor type A  37.97 
 
 
352 aa  128  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0630  hypothetical protein  35.03 
 
 
343 aa  109  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1917  von Willebrand factor, type A  28.37 
 
 
1204 aa  85.9  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.137165 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0637  von Willebrand factor, type A  30.62 
 
 
224 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0134  von Willebrand factor, type A  30.61 
 
 
218 aa  73.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864003  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2365  von Willebrand factor type A domain-containing protein  36.81 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4762  von Willebrand factor type A domain protein  29.35 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2499  von Willebrand factor type A  29.17 
 
 
225 aa  72  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.950174  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2880  von Willebrand factor type A domain protein  29.17 
 
 
225 aa  72  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.158441  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2368  von Willebrand factor, type A  30.43 
 
 
220 aa  72  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4203  von Willebrand factor type A  29.7 
 
 
244 aa  71.6  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258867  normal  0.0187609 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01967  hypothetical protein  36.11 
 
 
219 aa  71.2  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01978  hypothetical protein  36.11 
 
 
219 aa  71.2  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3010  von Willebrand factor type A domain protein  36.11 
 
 
219 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.136954 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0987  von Willebrand factor type A domain-containing protein  36.11 
 
 
219 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.233145 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1584  von Willebrand factor type A  35.42 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1568  von Willebrand factor type A  35.42 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.921097  normal  0.435058 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3006  hypothetical protein  30.1 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2215  von Willebrand factor type A domain-containing protein  35.42 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0560  von Willebrand factor type A  30.81 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1103  von Willebrand factor, type A  31.71 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3137  von Willebrand factor type A  29.15 
 
 
224 aa  68.2  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1160  von Willebrand factor type A domain protein  35.42 
 
 
219 aa  67.8  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2107  von Willebrand factor type A  29.1 
 
 
254 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1498  von Willebrand factor type A  29.05 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1643  von Willebrand factor type A  28.68 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2727  von Willebrand factor, type A  26.18 
 
 
233 aa  63.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0810  von Willebrand factor, type A  25.77 
 
 
233 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5987  von Willebrand factor, type A  29.01 
 
 
248 aa  62  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919016  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4255  von Willebrand factor, type A  27.45 
 
 
240 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0482  von Willebrand factor type A  27.23 
 
 
222 aa  61.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7176  von Willebrand factor type A  32.26 
 
 
238 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135257  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0408  von Willebrand factor type A  27.6 
 
 
236 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04030  hypothetical protein  29.14 
 
 
268 aa  47.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.827686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3582  hypothetical protein  26.97 
 
 
202 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857055  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04060  hypothetical protein  29.07 
 
 
272 aa  41.2  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.151575 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>