More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0436 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0369  SIS domain-containing protein  100 
 
 		 201 aa  408  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0436  sugar isomerase (SIS)  100 
 
 		 201 aa  408  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1226  SIS domain-containing protein  99 
 
 		 201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.939122 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4698  sugar isomerase (SIS)  73.33 
 
 		 199 aa  295  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0591  KpsF/GutQ family protein  33.67 
 
 		 329 aa  136  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000664449  hitchhiker  0.000000000000829793 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1114  arabinose 5-phosphate isomerase  37.44 
 
 		 320 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2308  KpsF/GutQ family protein  37.06 
 
 		 333 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0335  KpsF/GutQ family protein  34.63 
 
 		 334 aa  132  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00223142  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0322  KpsF/GutQ family protein  33.85 
 
 		 340 aa  131  5e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0064  KpsF/GutQ family protein  39.24 
 
 		 321 aa  131  7.999999999999999e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1886  arabinose 5-phosphate isomerase  41.94 
 
 		 317 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.106886  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0137  KpsF/GutQ family protein  37.77 
 
 		 335 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  37.93 
 
 		 320 aa  129  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  37.93 
 
 		 320 aa  129  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  34.81 
 
 		 315 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1749  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  40.38 
 
 		 319 aa  127  8.000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0213  KpsF/GutQ  37.5 
 
 		 320 aa  127  8.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 324 aa  127  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2808  KpsF/GutQ family protein  35.53 
 
 		 331 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0918  polysialic acid capsule expression protein, KpsF/GutQ family protein  37.29 
 
 		 321 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3603  KpsF/GutQ family protein  37.74 
 
 		 324 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.478278 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 324 aa  126  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  38.18 
 
 		 335 aa  125  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3213  KpsF/GutQ family protein  34.18 
 
 		 331 aa  125  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1811  KpsF/GutQ family protein  34.27 
 
 		 319 aa  125  6e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3809  arabinose-5-phosphate isomerase  41.29 
 
 		 340 aa  124  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3810  D-arabinose 5-phosphate isomerase  37.91 
 
 		 328 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2291  KpsF/GutQ family protein  40.51 
 
 		 323 aa  124  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.827671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1362  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  35.45 
 
 		 333 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1665  KpsF/GutQ family protein  35 
 
 		 320 aa  124  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.309824  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1612  KpsF/GutQ family protein  34.54 
 
 		 330 aa  124  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0776  KpsF/GutQ family protein  39.87 
 
 		 324 aa  123  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0182  KpsF/GutQ family protein  37.78 
 
 		 330 aa  123  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02814  conserved hypothetical protein  33.9 
 
 		 339 aa  122  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000939788  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  37.85 
 
 		 339 aa  122  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02764  hypothetical protein  33.9 
 
 		 339 aa  122  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000908304  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  32.2 
 
 		 320 aa  122  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0467  KpsF/GutQ  34.44 
 
 		 328 aa  122  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  34.39 
 
 		 328 aa  122  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5962  KpsF/GutQ family protein  33.33 
 
 		 322 aa  122  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3262  arabinose-5-phosphate isomerase  33.5 
 
 		 351 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12348  Sugar isomerase, KpsF/GutQ family protein  33.85 
 
 		 321 aa  122  5e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3575  D-arabinose 5-phosphate isomerase  35.2 
 
 		 323 aa  122  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.521049 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0922  sugar isomerase  34.57 
 
 		 330 aa  121  6e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3211  KpsF/GutQ family sugar isomerase  33.5 
 
 		 311 aa  121  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3249  KpsF/GutQ family sugar isomerase  33.5 
 
 		 311 aa  121  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.212815  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0617  KpsF/GutQ family protein  37.58 
 
 		 319 aa  121  7e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.851934  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  35.11 
 
 		 333 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0720  KpsF/GutQ family protein  34.69 
 
 		 325 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.500239  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1907  KpsF/GutQ family protein  32.98 
 
 		 330 aa  120  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0436  KpsF/GutQ family protein  35 
 
 		 326 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3219  polysialic acid capsule expression protein KpsF  33.33 
 
 		 339 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0183  KpsF/GutQ family protein  39.02 
 
 		 337 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.367959  normal  0.0516701 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  33.52 
 
 		 321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3652  D-arabinose 5-phosphate isomerase  36.81 
 
 		 328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0678  KpsF/GutQ family protein  34.18 
 
 		 325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.732488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3344  KpsF/GutQ family protein  34.18 
 
 		 325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0334  KpsF/GutQ family protein  34.92 
 
 		 326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0677  KpsF/GutQ family protein  34.18 
 
 		 325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.953587  normal  0.0677039 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2638  KpsF/GutQ family protein  38.71 
 
 		 328 aa  119  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.545154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0438  KpsF/GutQ family protein  36.11 
 
 		 326 aa  119  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.181851 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3030  sugar isomerase, KpsF/GutQ family  38.71 
 
 		 328 aa  119  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0494  KpsF/GutQ family protein  35.03 
 
 		 325 aa  119  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0102894  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0282  KpsF/GutQ family protein  36.11 
 
 		 321 aa  119  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  35.45 
 
 		 326 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4108  KpsF/GutQ family protein  37.58 
 
 		 330 aa  118  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal  0.0965302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6051  KpsF/GutQ family protein  34.57 
 
 		 333 aa  118  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0404  KpsF/GutQ family protein  35.16 
 
 		 323 aa  118  6e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.126623 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  33.9 
 
 		 321 aa  118  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1492  KpsF/GutQ family protein  33.51 
 
 		 330 aa  118  7e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  35.59 
 
 		 323 aa  117  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  34.57 
 
 		 327 aa  117  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3956  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  33.16 
 
 		 325 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  33.94 
 
 		 324 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  32.97 
 
 		 326 aa  117  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  32.8 
 
 		 357 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0211  KpsF/GutQ  35.98 
 
 		 342 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4237  KpsF/GutQ family protein  35.11 
 
 		 333 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  32.8 
 
 		 342 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2110  KpsF/GutQ family protein  31.84 
 
 		 332 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613072  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3372  KpsF/GutQ family protein  33.16 
 
 		 325 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.600625  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  32.8 
 
 		 328 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0401  KpsF/GutQ family protein  38.06 
 
 		 326 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  34.39 
 
 		 328 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  34.39 
 
 		 328 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  36.5 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  36.41 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2063  KpsF/GutQ family protein  36.36 
 
 		 321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.806095  normal  0.101433 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0712  KpsF/GutQ family protein  33.67 
 
 		 325 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0114298 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4132  KpsF/GutQ family protein  38.18 
 
 		 333 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  34.39 
 
 		 328 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  34.39 
 
 		 328 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  34.04 
 
 		 327 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  34.39 
 
 		 328 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0721  KpsF/GutQ family protein  33.67 
 
 		 325 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4201  KpsF/GutQ family protein  38.65 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.899261  normal  0.722227 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0691  KpsF/GutQ family protein  33.67 
 
 		 325 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.983087  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  34.39 
 
 		 328 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  34.39 
 
 		 328 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3663  KpsF/GutQ family protein  33.67 
 
 		 325 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000627199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>