More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1852 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1852  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 
204 aa  415  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1781  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  97.55 
 
 
204 aa  401  1e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.83041  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3287  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  61 
 
 
208 aa  249  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.633287  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02388  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  57.07 
 
 
207 aa  199  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.2838  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2663  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.5 
 
 
209 aa  177  7e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.989358 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3685  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.5 
 
 
210 aa  169  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2556  thiamine monophosphate synthase  48.15 
 
 
211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.06 
 
 
234 aa  160  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1240  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.22 
 
 
216 aa  155  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3901  thiamine monophosphate synthase  48.26 
 
 
211 aa  152  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0828  thiamine-phosphate diphosphorylase  47.09 
 
 
217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0687  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.72 
 
 
222 aa  149  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0604  thiamine-phosphate diphosphorylase  45.76 
 
 
217 aa  147  9e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0199515  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2999  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.79 
 
 
224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.718744  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  42.79 
 
 
484 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  42 
 
 
497 aa  145  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2067  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.75 
 
 
213 aa  142  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal  0.117527 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  42.29 
 
 
484 aa  141  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3303  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.18 
 
 
220 aa  141  7e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.535978  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  41.71 
 
 
492 aa  139  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0392  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.41 
 
 
214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.309762 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4783  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.15 
 
 
207 aa  138  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.655377  normal  0.0379586 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4659  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.15 
 
 
207 aa  138  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448839  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4837  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.62 
 
 
207 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  42.29 
 
 
490 aa  137  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.36 
 
 
211 aa  134  9e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.656978  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0637  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.15 
 
 
207 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578758  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4946  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.02 
 
 
207 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1080  thiamine-phosphate diphosphorylase  41.46 
 
 
216 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  41.79 
 
 
497 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3151  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.7 
 
 
255 aa  132  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4799  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.74 
 
 
205 aa  131  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1315  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.29 
 
 
216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09270  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.62 
 
 
209 aa  129  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36456  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  39 
 
 
494 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4341  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.89 
 
 
205 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12400  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.65 
 
 
209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1962  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.94 
 
 
213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.247513  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3304  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.16 
 
 
217 aa  124  9e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.324027  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2902  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.16 
 
 
217 aa  124  9e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00933541  hitchhiker  0.00130381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1132  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.09 
 
 
209 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0497  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.67 
 
 
203 aa  124  1e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  37.5 
 
 
479 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.49 
 
 
214 aa  124  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3773  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.93 
 
 
209 aa  123  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0971718 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0820  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.04 
 
 
214 aa  118  7e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000106219  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2347  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.61 
 
 
221 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0400  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.37 
 
 
204 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1811  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.24 
 
 
221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.645451  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.76 
 
 
346 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0349  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.25 
 
 
219 aa  115  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.55 
 
 
224 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2104  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.5 
 
 
223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245468  normal  0.0211222 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.76 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.98 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0353  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.76 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0358  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.13 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.57 
 
 
379 aa  112  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0364  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.89 
 
 
217 aa  112  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1937  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.96 
 
 
219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0505249  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1234  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.17 
 
 
202 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0342  thiamine monophosphate synthase  38.62 
 
 
206 aa  111  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2012  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.39 
 
 
209 aa  111  8.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.549646  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0363  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.78 
 
 
219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.45254  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2062  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.34 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0114882  normal  0.0947623 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1712  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.63 
 
 
220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0573115  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0377  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.78 
 
 
219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4884  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.55 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2684  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.98 
 
 
343 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.67 
 
 
360 aa  109  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.98 
 
 
343 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0440  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.55 
 
 
219 aa  109  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0381  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.14 
 
 
206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0750  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.05 
 
 
219 aa  107  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1379  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.18 
 
 
215 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000146383  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.7 
 
 
212 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.694137  normal  0.669772 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  34.63 
 
 
212 aa  106  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.08 
 
 
343 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1336  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.57 
 
 
207 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3314  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.5 
 
 
347 aa  104  7e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06844  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.38 
 
 
204 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0220  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.18 
 
 
214 aa  104  1e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.615766  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1463  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.05 
 
 
211 aa  103  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0900  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.89 
 
 
219 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 
252 aa  102  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1543  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.98 
 
 
207 aa  102  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0451009  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0896  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.2 
 
 
352 aa  102  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.833365  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000869  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  34.15 
 
 
204 aa  102  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2908  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 
368 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  36.05 
 
 
217 aa  100  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17535  predicted protein  34.04 
 
 
478 aa  100  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.274913 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.13 
 
 
221 aa  100  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040851  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 
206 aa  100  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.94 
 
 
211 aa  99.8  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.01 
 
 
236 aa  99.4  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  38.04 
 
 
209 aa  99.4  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1683  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.82 
 
 
218 aa  99  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000047745  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0436  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33 
 
 
204 aa  98.6  6e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.408006  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0840  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.75 
 
 
350 aa  98.2  8e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0593  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.15 
 
 
206 aa  97.8  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>