More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1278 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1278  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
618 aa  1228    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.907115  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22860  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  50.66 
 
 
754 aa  534  1e-150  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.499812  normal  0.0374839 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1590  Peptidoglycan glycosyltransferase  49.82 
 
 
692 aa  480  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150258  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1068  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.9 
 
 
579 aa  468  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2416  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.72 
 
 
584 aa  443  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3205  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.78 
 
 
635 aa  435  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0996816  normal  0.0272319 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16620  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  43.27 
 
 
663 aa  415  1e-114  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.422305  normal  0.0185219 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2932  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.97 
 
 
702 aa  413  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00757517  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10750  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  41.85 
 
 
581 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0761789  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  41.85 
 
 
638 aa  402  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1401  peptidoglycan glycosyltransferase  40.43 
 
 
727 aa  399  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677151  normal  0.0298794 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0175  cell division protein  39.93 
 
 
600 aa  388  1e-106  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1104  peptidoglycan glycosyltransferase  41 
 
 
653 aa  384  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0520917  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1565  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.24 
 
 
600 aa  377  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0890  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.93 
 
 
655 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.641188  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1564  peptidoglycan glycosyltransferase  37.54 
 
 
600 aa  360  3e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.924242  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1409  peptidoglycan glycosyltransferase  39.8 
 
 
670 aa  360  4e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00741927  normal  0.017677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5104  peptidoglycan glycosyltransferase  39.65 
 
 
839 aa  354  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0680145  normal  0.0778516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2864  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.7 
 
 
583 aa  353  5.9999999999999994e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539951  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1656  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.7 
 
 
682 aa  352  8e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1107  penicillin-binding protein, transpeptidase domain protein  37.42 
 
 
613 aa  349  7e-95  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3069  peptidoglycan glycosyltransferase  38.63 
 
 
586 aa  322  9.999999999999999e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0109625  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13660  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  36.86 
 
 
608 aa  311  2e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00924315  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2100  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.54 
 
 
568 aa  303  5.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000215244 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24950  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  34.73 
 
 
637 aa  295  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.439069  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2982  peptidoglycan glycosyltransferase  34.05 
 
 
635 aa  294  3e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265942  normal  0.116719 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2665  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.92 
 
 
677 aa  291  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3218  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.58 
 
 
716 aa  290  7e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0525983 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3268  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.67 
 
 
607 aa  289  8e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0424379  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  35 
 
 
708 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5772  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.91 
 
 
635 aa  283  8.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3273  peptidoglycan glycosyltransferase  32.18 
 
 
642 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.709571  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3262  peptidoglycan glycosyltransferase  32.18 
 
 
642 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258403  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3324  peptidoglycan glycosyltransferase  32.18 
 
 
642 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0881195  normal  0.041689 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3444  peptidoglycan glycosyltransferase  36.27 
 
 
716 aa  280  8e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00730132  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12193  penicillin-binding membrane protein pbpB  32.94 
 
 
679 aa  279  1e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.98253e-20  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3529  peptidoglycan glycosyltransferase  32.62 
 
 
652 aa  278  3e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0960605  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2652  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.5 
 
 
654 aa  273  5.000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  34.61 
 
 
578 aa  272  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  33.61 
 
 
586 aa  272  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.62 
 
 
644 aa  271  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  35.03 
 
 
656 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.39 
 
 
654 aa  269  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  34.08 
 
 
578 aa  269  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03264  peptidoglycan synthetase FtsI  33.04 
 
 
585 aa  268  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4225  peptidoglycan synthetase FtsI  33.78 
 
 
583 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1989  cell division protein  31.97 
 
 
552 aa  265  2e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0400114  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.09 
 
 
662 aa  265  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0207  penicillin-binding protein  31.99 
 
 
548 aa  263  8e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.73 
 
 
657 aa  263  8.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0481  peptidoglycan glycosyltransferase  33.22 
 
 
583 aa  263  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3576  peptidoglycan synthetase FtsI  33.45 
 
 
583 aa  262  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.027197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0380  peptidoglycan synthetase FtsI  33.45 
 
 
583 aa  262  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.359534 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  34.26 
 
 
578 aa  262  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3749  peptidoglycan synthetase FtsI  33.45 
 
 
583 aa  262  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105425 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3023  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.81 
 
 
634 aa  261  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0205906  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  32.92 
 
 
578 aa  261  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  34.05 
 
 
675 aa  259  7e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.22 
 
 
582 aa  259  9e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  33.22 
 
 
582 aa  259  9e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0421  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.44 
 
 
584 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0407  peptidoglycan glycosyltransferase  32.44 
 
 
584 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0396  peptidoglycan glycosyltransferase  32.44 
 
 
584 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  32.7 
 
 
578 aa  258  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  32.59 
 
 
660 aa  257  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0395  peptidoglycan glycosyltransferase  32.44 
 
 
584 aa  258  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  35.98 
 
 
586 aa  257  4e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  32.3 
 
 
695 aa  257  5e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  33.45 
 
 
657 aa  256  6e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0089  peptidoglycan synthetase FtsI  33.95 
 
 
588 aa  253  9.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679095  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1141  peptidoglycan glycosyltransferase  32.43 
 
 
610 aa  252  1e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.062709  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00085  transpeptidase involved in septal peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 3)  33.78 
 
 
588 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3516  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.78 
 
 
588 aa  251  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0077  peptidoglycan synthetase FtsI  33.78 
 
 
588 aa  251  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0090  peptidoglycan synthetase FtsI  33.95 
 
 
588 aa  252  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13190  Penicilin-binding Protein 3  32.41 
 
 
579 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00084  hypothetical protein  33.78 
 
 
588 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3573  peptidoglycan glycosyltransferase  33.78 
 
 
588 aa  251  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010307 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0086  peptidoglycan synthetase FtsI  33.78 
 
 
588 aa  251  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.67693  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0349  peptidoglycan glycosyltransferase  32.22 
 
 
581 aa  251  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0092  peptidoglycan synthetase FtsI  33.78 
 
 
588 aa  251  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.948544 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.74 
 
 
645 aa  251  3e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3930  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 
570 aa  250  6e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000459011  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0391  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.48 
 
 
594 aa  248  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.206173 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0212  peptidoglycan synthetase FtsI  34.48 
 
 
594 aa  248  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09550  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  33.16 
 
 
581 aa  248  2e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.102088 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1442  stage V sporulation protein D  32.19 
 
 
740 aa  248  3e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.542093  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  32.46 
 
 
657 aa  248  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3775  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.62 
 
 
553 aa  247  4.9999999999999997e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.061336  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0597  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.48 
 
 
614 aa  246  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0134  peptidoglycan synthetase FtsI  33.45 
 
 
588 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0139  peptidoglycan synthetase FtsI  33.45 
 
 
588 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0131  peptidoglycan synthetase FtsI  33.45 
 
 
588 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0138  peptidoglycan synthetase FtsI  33.45 
 
 
588 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.154008 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0134  peptidoglycan synthetase FtsI  33.45 
 
 
588 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000490417 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1614  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.72 
 
 
582 aa  244  3e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0755  peptidoglycan glycosyltransferase  33.45 
 
 
587 aa  244  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0669  stage V sporulation protein D  31.09 
 
 
713 aa  244  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.47 
 
 
582 aa  244  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00896  penicillin-binding protein 3  31.48 
 
 
601 aa  243  5e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>