More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1191 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1191  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 336 aa  653    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.218553  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10110  transcriptional regulator  62.61 
 
 		 342 aa  385  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.625648 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1083  transcriptional regulator, LacI family  61.63 
 
 		 335 aa  380  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0310257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1322  transcriptional regulator, LacI family  59.4 
 
 		 336 aa  368  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1766  transcriptional regulator, LacI family  53.45 
 
 		 340 aa  348  7e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0293304  normal  0.0298236 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2405  LacI family transcriptional regulator  51.98 
 
 		 333 aa  299  5e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.475476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1296  LacI family transcription regulator  51.37 
 
 		 334 aa  296  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5557  transcriptional regulator, LacI family  52.44 
 
 		 327 aa  295  9e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.634318 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2988  transcriptional regulator, LacI family  51.66 
 
 		 328 aa  293  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.922053  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4934  transcriptional regulator, LacI family  49.85 
 
 		 336 aa  286  5e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.129155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2169  transcriptional regulator, LacI family  50 
 
 		 337 aa  284  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1317  transcriptional regulator, LacI family  51.17 
 
 		 353 aa  276  5e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0414  regulatory protein LacI  51.34 
 
 		 333 aa  270  2.9999999999999997e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4675  transcriptional regulator, LacI family  45.99 
 
 		 335 aa  246  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1842  transcriptional regulator, LacI family  44.71 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13620  transcriptional regulator  42.3 
 
 		 333 aa  229  7e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2612  transcriptional regulator, LacI family  41.34 
 
 		 342 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.109106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3464  LacI family transcription regulator  41.47 
 
 		 340 aa  217  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01800  transcriptional regulator  38.69 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0384  regulatory protein LacI  36.8 
 
 		 339 aa  185  9e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.899866  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1242  LacI family transcription regulator  35.14 
 
 		 340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3601  transcriptional regulator, LacI family  35.26 
 
 		 358 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0229751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4925  transcriptional regulator, LacI family  35.26 
 
 		 358 aa  166  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6905  transcriptional regulator, LacI family  35 
 
 		 334 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00908765  hitchhiker  0.00367965 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0183  transcriptional regulator, LacI family  32.31 
 
 		 344 aa  149  8e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3594  transcriptional regulator, LacI family  35.87 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17790  transcriptional regulator  50.91 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255976  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1061  LacI family response repressor  31.16 
 
 		 328 aa  135  7.000000000000001e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.023904  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4931  transcriptional regulator, LacI family  34.5 
 
 		 340 aa  136  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.699714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01470  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 351 aa  129  8.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  31.98 
 
 		 338 aa  123  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  31.3 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0967  LacI family transcription regulator  30.97 
 
 		 352 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  26.49 
 
 		 333 aa  115  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4583  transcriptional regulator, LacI family  32.09 
 
 		 343 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0718425  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  31.38 
 
 		 340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  31.38 
 
 		 340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1119  LacI family transcription regulator  35.33 
 
 		 347 aa  113  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140598 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  28.53 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  31.38 
 
 		 340 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  31.47 
 
 		 340 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4095  LacI family transcription regulator  30.31 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.765515  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4271  LacI family transcription regulator  30.31 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.94658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3513  LacI family transcriptional regulator  34.49 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4592  LacI family transcription regulator  31.13 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  30.21 
 
 		 339 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2354  LacI family transcription regulator  32.08 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0756754  normal  0.112701 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  28.28 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  24.25 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3246  LacI family transcription regulator  30.31 
 
 		 342 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.759172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0495  LacI family transcription regulator  31.99 
 
 		 354 aa  106  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4929  LacI family transcription regulator  31.35 
 
 		 346 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33528  normal  0.200034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5637  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339737  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5484  LacI family transcription regulator  31.35 
 
 		 345 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238485 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0275  transcriptional regulator, LacI family  32.17 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.555598 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0909  LacI family transcription regulator  29.88 
 
 		 338 aa  103  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6733  transcriptional regulator, LacI family  29.2 
 
 		 354 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.564836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0617  transcriptional regulator, LacI family  31.38 
 
 		 334 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0544  LacI family transcription regulator  27.43 
 
 		 335 aa  103  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0905  LacI family transcription regulator  28.26 
 
 		 340 aa  103  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.153001  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  28.86 
 
 		 333 aa  103  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  28.28 
 
 		 337 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29360  transcriptional regulator  29.91 
 
 		 359 aa  103  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05320  transcriptional regulator  33.44 
 
 		 371 aa  103  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0941  alanine racemase  27.35 
 
 		 328 aa  103  5e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00393533  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13170  transcriptional regulator  31.96 
 
 		 359 aa  102  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.362617  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  27.41 
 
 		 334 aa  102  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2275  transcriptional regulator, LacI family  31.5 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0848  transcriptional regulator, LacI family  31.03 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0686  LacI family transcription regulator  27.91 
 
 		 334 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002440  transcriptional regulator LacI family  26.4 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0100228  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3896  LacI family transcription regulator  30.41 
 
 		 339 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4172  LacI family transcription regulator  31.46 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0578357  normal  0.922561 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3709  galactose operon repressor  27.91 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.536559  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0240  LacI family transcription regulator  31.69 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3711  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  31.69 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3721  transcriptional regulator  28.2 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.940328  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3952  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  31.69 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  28.32 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  29.57 
 
 		 353 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  28.2 
 
 		 332 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1883  LacI family transcription regulator  26.45 
 
 		 351 aa  100  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7709  LacI family transcription regulator  27.33 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  27.88 
 
 		 341 aa  99.8  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1871  raffinose repressor, putative  31.58 
 
 		 336 aa  99.4  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0467  putative raffinose repressor  31.84 
 
 		 336 aa  99.4  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3699  LacI family transcription regulator  31.46 
 
 		 344 aa  99.4  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5761  transcriptional regulator, LacI family  31.36 
 
 		 363 aa  99  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.230872  normal  0.079116 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0713  putative raffinose repressor  31.84 
 
 		 338 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1009  putative raffinose repressor  31.84 
 
 		 338 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1982  putative raffinose repressor  31.84 
 
 		 338 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.71 
 
 		 328 aa  99.4  9e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  27.36 
 
 		 337 aa  98.6  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  28.74 
 
 		 339 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2103  LacI family regulatory protein  31.84 
 
 		 336 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  27.17 
 
 		 336 aa  98.6  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  25.8 
 
 		 340 aa  98.6  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.22 
 
 		 336 aa  98.6  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3313  transcriptional regulator, LacI family  33.81 
 
 		 358 aa  98.6  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0187548 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0634  transcriptional regulator, LacI family  32.04 
 
 		 334 aa  99  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>