131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1132 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1132  protein of unknown function DUF125 transmembrane  100 
 
 
196 aa  367  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.44002  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0327  protein of unknown function DUF125 transmembrane  56.19 
 
 
208 aa  164  9e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0401159 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1411  hypothetical protein  48.44 
 
 
243 aa  162  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0652587  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1741  protein of unknown function DUF125 transmembrane  45.57 
 
 
229 aa  154  6e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1182  protein of unknown function DUF125 transmembrane  58.96 
 
 
203 aa  144  9e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.127344  normal  0.220028 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2210  protein of unknown function DUF125 transmembrane  43.64 
 
 
246 aa  141  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.303449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1833  protein of unknown function DUF125 transmembrane  42.01 
 
 
242 aa  140  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0431  protein of unknown function DUF125 transmembrane  51.17 
 
 
254 aa  136  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.748606  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19590  uncharacterized membrane protein  43.06 
 
 
232 aa  133  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.927854  normal  0.04221 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0592  hypothetical protein  34.23 
 
 
227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000251129  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1509  hypothetical protein  34.98 
 
 
227 aa  128  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0134552  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0211  protein of unknown function DUF125 transmembrane  50.45 
 
 
240 aa  126  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5552  hypothetical protein  42.73 
 
 
237 aa  122  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0482  hypothetical protein  33.93 
 
 
226 aa  122  5e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0454361  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1793  hypothetical protein  33.93 
 
 
226 aa  122  5e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0493  hypothetical protein  34.25 
 
 
228 aa  122  5e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000147965  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5110  protein of unknown function DUF125 transmembrane  40.64 
 
 
238 aa  121  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36050  uncharacterized membrane protein  41.94 
 
 
240 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.787149  normal  0.459993 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1567  hypothetical protein  31.36 
 
 
229 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.537256  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1566  hypothetical protein  31.56 
 
 
226 aa  114  6e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.332495  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2446  hypothetical protein  41.1 
 
 
228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0274755  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0798  hypothetical protein  33.78 
 
 
226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00535616  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0525  hypothetical protein  48.56 
 
 
250 aa  112  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.453815  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0272  hypothetical protein  42.4 
 
 
243 aa  112  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.2315  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1290  integral membrane protein  34.98 
 
 
233 aa  109  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.703645  normal  0.502093 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3927  hypothetical protein  38.74 
 
 
233 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3035  hypothetical protein  39.42 
 
 
263 aa  102  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.644185 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0494  hypothetical protein  33.18 
 
 
227 aa  102  4e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.167313  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1938  hypothetical protein  38.81 
 
 
239 aa  102  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0601853  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3717  hypothetical protein  41.45 
 
 
233 aa  101  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752058  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1040  hypothetical protein  38.43 
 
 
233 aa  101  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.390352  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2089  hypothetical protein  39.66 
 
 
235 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.457798  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0698  hypothetical protein  36.6 
 
 
233 aa  100  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4657  hypothetical protein  36.61 
 
 
231 aa  99.8  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262976  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3399  protein of unknown function DUF125 transmembrane  41.23 
 
 
234 aa  99.8  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.233589 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0169  hypothetical protein  39.3 
 
 
230 aa  99.4  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1508  hypothetical protein  29.26 
 
 
230 aa  98.2  6e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00139077  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0273  hypothetical protein  40.55 
 
 
231 aa  98.2  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2082  hypothetical protein  35.62 
 
 
233 aa  97.4  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00637879  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4471  hypothetical protein  31.96 
 
 
229 aa  97.4  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0802  protein of unknown function DUF125 transmembrane  37.9 
 
 
236 aa  97.1  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3654  putative nodulin-related protein  37.28 
 
 
233 aa  96.7  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1084  hypothetical protein  40.45 
 
 
241 aa  97.1  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0429154  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3122  protein of unknown function DUF125 transmembrane  38.73 
 
 
231 aa  94.7  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04429  conserved mebrane associated protein  39.91 
 
 
231 aa  94  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1963  hypothetical protein  39.57 
 
 
233 aa  93.2  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1253  hypothetical protein  40.55 
 
 
235 aa  93.6  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0481  hypothetical protein  33.78 
 
 
227 aa  92.4  4e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00758654  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1792  hypothetical protein  33.78 
 
 
227 aa  92.4  4e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4967  hypothetical protein  55.06 
 
 
231 aa  92  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794952  normal  0.952404 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1998  hypothetical protein  34.58 
 
 
242 aa  91.3  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0347825  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5214  hypothetical protein  40.18 
 
 
231 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4169  protein of unknown function DUF125 transmembrane  40.18 
 
 
231 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1569  hypothetical protein  36.07 
 
 
229 aa  89  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00144859  normal  0.688354 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2119  hypothetical protein  37.05 
 
 
229 aa  88.6  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00934524  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0163  protein of unknown function DUF125 transmembrane  37.95 
 
 
232 aa  88.2  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2462  hypothetical protein  53.76 
 
 
230 aa  87.8  9e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2740  hypothetical protein  51.65 
 
 
233 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2425  hypothetical protein  39.55 
 
 
231 aa  85.1  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.222934  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2712  hypothetical protein  36.1 
 
 
235 aa  84.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.808274  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4695  hypothetical protein  57.83 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635203  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3014  hypothetical protein  35.68 
 
 
235 aa  82.4  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00253344 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19200  uncharacterized membrane protein  42.94 
 
 
323 aa  78.6  0.00000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.243725  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1618  hypothetical protein  31.05 
 
 
376 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524945  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1537  hypothetical protein  56.96 
 
 
235 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5039  protein of unknown function DUF125 transmembrane  31.96 
 
 
376 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.144378 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14200  hypothetical protein  31.94 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0969777 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5770  hypothetical protein  30 
 
 
357 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0236  hypothetical protein  40.83 
 
 
343 aa  72.4  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0710  hypothetical protein  30.91 
 
 
372 aa  72.4  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.441987  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4534  hypothetical protein  33.94 
 
 
249 aa  72  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0182642 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3434  hypothetical protein  32.87 
 
 
245 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.195788  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3497  hypothetical protein  32.87 
 
 
245 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.382938 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3445  hypothetical protein  32.87 
 
 
245 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.997991  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5265  hypothetical protein  30.59 
 
 
374 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716255  normal  0.0847369 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0746  protein of unknown function DUF125 transmembrane  30.45 
 
 
372 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0747  protein of unknown function DUF125 transmembrane  30.45 
 
 
372 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0141065  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0025  hypothetical protein  32.91 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6021  hypothetical protein  50 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  normal  0.534904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5704  protein of unknown function DUF125 transmembrane  31.67 
 
 
265 aa  68.2  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0099  putative nodulin-related protein  53.62 
 
 
160 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3365  hypothetical protein  36.53 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.625585 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0752  hypothetical protein  30.56 
 
 
371 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.575838  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4424  hypothetical protein  32.29 
 
 
368 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1077  hypothetical protein  31.3 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.040986  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4376  hypothetical protein  47.12 
 
 
211 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2727  hypothetical protein  32.26 
 
 
244 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.84111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2869  protein of unknown function DUF125 transmembrane  32.88 
 
 
235 aa  63.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04290  uncharacterized membrane protein  28.38 
 
 
376 aa  64.3  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0332  protein of unknown function DUF125 transmembrane  54.88 
 
 
230 aa  62.8  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.361315  normal  0.131198 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0153  integral membrane protein  54.88 
 
 
230 aa  62.8  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.679008  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3979  protein of unknown function DUF125 transmembrane  33.33 
 
 
238 aa  62.4  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1363  hypothetical protein  33.78 
 
 
237 aa  62  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4934  hypothetical protein  50 
 
 
270 aa  62  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0131166  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1872  hypothetical protein  44.64 
 
 
231 aa  61.6  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00204012  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01320  uncharacterized membrane protein  30.94 
 
 
365 aa  60.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0254  protein of unknown function DUF125 transmembrane  31.41 
 
 
360 aa  61.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0836  protein of unknown function DUF125 transmembrane  32.3 
 
 
233 aa  59.7  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.30782  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0962  protein of unknown function DUF125 transmembrane  50 
 
 
396 aa  59.3  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2945  hypothetical protein  33.93 
 
 
239 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731453  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>