More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1125 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0963  valyl-tRNA synthetase  70.92 
 
 		 901 aa  1249    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3508  valyl-tRNA synthetase  65.28 
 
 		 877 aa  1098    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0019  valyl-tRNA synthetase  60.65 
 
 		 862 aa  1014    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.661225 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0015  valyl-tRNA synthetase  61.34 
 
 		 860 aa  1054    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139403  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1936  valyl-tRNA synthetase  65.57 
 
 		 881 aa  1113    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5200  valyl-tRNA synthetase  65 
 
 		 876 aa  1091    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725067  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2292  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  63.83 
 
 		 836 aa  1075    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.436685  normal  0.164077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6767  valyl-tRNA synthetase  64.21 
 
 		 845 aa  1066    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0832206 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1125  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  100 
 
 		 916 aa  1856    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1197  valyl-tRNA synthetase  64.98 
 
 		 911 aa  1195    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1701  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  64.23 
 
 		 846 aa  1081    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000331073  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0192  valine--tRNA ligase  63.33 
 
 		 925 aa  1160    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1314  valyl-tRNA synthetase  61.69 
 
 		 903 aa  1035    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.558712 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09130  valyl-tRNA synthetase  64.42 
 
 		 885 aa  1103    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0788672 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24280  valyl-tRNA synthetase  74.78 
 
 		 906 aa  1367    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2593  valyl-tRNA synthetase  69.82 
 
 		 902 aa  1241    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2881  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  65.82 
 
 		 858 aa  1080    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0307  valyl-tRNA synthetase  52.39 
 
 		 855 aa  850    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09690  valyl-tRNA synthetase  61.32 
 
 		 895 aa  1089    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1403  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  73.16 
 
 		 886 aa  1308    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00382029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2155  valyl-tRNA synthetase  61.13 
 
 		 872 aa  1034    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123734 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09930  valyl-tRNA synthetase  60.22 
 
 		 894 aa  1060    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2401  valyl-tRNA synthetase  60.19 
 
 		 873 aa  1015    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1581  aminoacyl-tRNA synthetase class Ia  61.2 
 
 		 861 aa  1043    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3473  valyl-tRNA synthetase  61.08 
 
 		 871 aa  1042    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560604  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0464  valyl-tRNA synthetase  36.96 
 
 		 864 aa  567  1e-160  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0136  valyl-tRNA synthetase  36.77 
 
 		 808 aa  558  1e-157  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0088  valyl-tRNA synthetase  37.21 
 
 		 802 aa  553  1e-156  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1241  valyl-tRNA synthetase  36.01 
 
 		 896 aa  493  9.999999999999999e-139  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3319  valyl-tRNA synthetase  35.32 
 
 		 928 aa  486  1e-136  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1536  valyl-tRNA synthetase  33.84 
 
 		 908 aa  474  1e-132  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0018  valyl-tRNA synthetase  36.62 
 
 		 892 aa  475  1e-132  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.910453  normal  0.161561 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0205  valyl-tRNA synthetase  34.17 
 
 		 905 aa  456  1e-127  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1721  valyl-tRNA synthetase  33.49 
 
 		 864 aa  445  1e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  32.88 
 
 		 855 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2626  valyl-tRNA synthetase  32.18 
 
 		 865 aa  435  1e-120  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  29.12 
 
 		 906 aa  432  1e-119  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  33.13 
 
 		 863 aa  432  1e-119  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  30.54 
 
 		 886 aa  431  1e-119  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  30.42 
 
 		 886 aa  429  1e-118  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  29.95 
 
 		 886 aa  427  1e-118  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  32.27 
 
 		 865 aa  427  1e-118  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  32.91 
 
 		 869 aa  426  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2064  valyl-tRNA synthetase  33.45 
 
 		 863 aa  425  1e-117  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  29.45 
 
 		 886 aa  420  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0403  valyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 		 865 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.52584  normal  0.0399554 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  32.43 
 
 		 858 aa  416  1e-114  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  30.8 
 
 		 809 aa  394  1e-108  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1019  valyl-tRNA synthetase  33.22 
 
 		 799 aa  386  1e-106  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000648947 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1456  valyl-tRNA synthetase  33.61 
 
 		 799 aa  380  1e-104  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1649  valyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 		 799 aa  379  1e-103  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.737664 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1497  valyl-tRNA synthetase  34.37 
 
 		 799 aa  377  1e-103  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.702651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0166  valyl-tRNA synthetase  31.67 
 
 		 806 aa  370  1e-101  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000560387  normal  0.070078 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1878  valyl-tRNA synthetase  29.83 
 
 		 816 aa  357  5e-97  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0603  putative valyl-tRNA synthetase  35.44 
 
 		 877 aa  357  5.999999999999999e-97  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1683  valyl-tRNA synthetase  30.69 
 
 		 808 aa  357  7.999999999999999e-97  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0962202  normal  0.0485293 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1477  valyl-tRNA synthetase  29.68 
 
 		 771 aa  347  8e-94  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  27.85 
 
 		 882 aa  303  1e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  27.9 
 
 		 881 aa  298  3e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  27.67 
 
 		 881 aa  297  6e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  27.67 
 
 		 881 aa  297  6e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  27.67 
 
 		 881 aa  297  6e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  27.56 
 
 		 881 aa  296  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  27.64 
 
 		 881 aa  294  6e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  27.53 
 
 		 881 aa  293  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  27.53 
 
 		 881 aa  293  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  27.64 
 
 		 881 aa  292  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  27.45 
 
 		 881 aa  291  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  27.22 
 
 		 881 aa  290  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0587  valyl-tRNA synthetase  31.16 
 
 		 909 aa  288  2.9999999999999996e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235992  normal  0.435222 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2573  valyl-tRNA synthetase  28.31 
 
 		 880 aa  286  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  28.02 
 
 		 911 aa  286  2.0000000000000002e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  26.49 
 
 		 885 aa  283  7.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  28.72 
 
 		 881 aa  283  1e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1828  valyl-tRNA synthetase  29.1 
 
 		 954 aa  283  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.242328  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1165  valyl-tRNA synthetase  28.67 
 
 		 877 aa  283  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12474  valyl-tRNA synthetase  28.64 
 
 		 876 aa  282  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12260  valyl-tRNA synthetase  28.12 
 
 		 882 aa  282  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1928  valyl-tRNA synthetase  28.27 
 
 		 893 aa  281  3e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3947  valyl-tRNA synthetase  29.26 
 
 		 955 aa  280  8e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.14713 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0879  valyl-tRNA synthetase  27.84 
 
 		 880 aa  280  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1436  valyl-tRNA synthetase  29.05 
 
 		 952 aa  278  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.571959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1831  valyl-tRNA synthetase  29.22 
 
 		 881 aa  279  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0410147  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7287  valyl-tRNA synthetase  29.38 
 
 		 861 aa  279  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.429256 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3872  valyl-tRNA synthetase  29.54 
 
 		 872 aa  279  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0445  valyl-tRNA synthetase  26.91 
 
 		 883 aa  278  3e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.262089  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2570  valyl-tRNA synthetase  28.04 
 
 		 952 aa  278  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.252314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4237  valyl-tRNA synthetase  28.21 
 
 		 930 aa  278  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.19671  normal  0.989502 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0741  valyl-tRNA synthetase  29.4 
 
 		 888 aa  278  4e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0469934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0513  valyl-tRNA synthetase  26.55 
 
 		 883 aa  277  5e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  26.84 
 
 		 881 aa  277  7e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2239  valyl-tRNA synthetase  30.23 
 
 		 868 aa  277  8e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.659246  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0472  valyl-tRNA synthetase  27.2 
 
 		 892 aa  276  9e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7290  valyl-tRNA synthetase  30.73 
 
 		 882 aa  276  9e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0570872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1796  valyl-tRNA synthetase  27.82 
 
 		 879 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0322  valyl-tRNA synthetase  27.7 
 
 		 894 aa  276  2.0000000000000002e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5994  valyl-tRNA synthetase  28.42 
 
 		 874 aa  274  5.000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298309  normal  0.0937262 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2474  valyl-tRNA synthetase  28.89 
 
 		 891 aa  274  6e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3951  valyl-tRNA synthetase  28.19 
 
 		 897 aa  273  8.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4227  valyl-tRNA synthetase  29.26 
 
 		 909 aa  273  9e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>