78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0407 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0407  protein of unknown function DUF1680  100 
 
 
633 aa  1262    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2831  protein of unknown function DUF1680  55.61 
 
 
629 aa  608  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01840  hypothetical protein  52.92 
 
 
643 aa  589  1e-167  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3839  hypothetical protein  49.93 
 
 
654 aa  576  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254825  normal  0.0525361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4989  protein of unknown function DUF1680  41.3 
 
 
647 aa  396  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0192762 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2215  protein of unknown function DUF1680  39.53 
 
 
638 aa  394  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4148  protein of unknown function DUF1680  43.26 
 
 
652 aa  392  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.834889  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02820  hypothetical protein  38.21 
 
 
643 aa  382  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.491149  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0057  protein of unknown function DUF1680  38.01 
 
 
643 aa  371  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0839925 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0969  hypothetical protein  35.51 
 
 
634 aa  364  3e-99  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00300565  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1126  protein of unknown function DUF1680  34.18 
 
 
628 aa  353  4e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0643  hypothetical protein  34.98 
 
 
620 aa  352  1e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119693  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0668  hypothetical protein  35.06 
 
 
620 aa  350  5e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0502  protein of unknown function DUF1680  34.08 
 
 
617 aa  349  9e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.171957  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4835  protein of unknown function DUF1680  32.38 
 
 
648 aa  314  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4720  protein of unknown function DUF1680  31.91 
 
 
655 aa  311  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827878  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2242  protein of unknown function DUF1680  31.59 
 
 
652 aa  310  4e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3930  protein of unknown function DUF1680  34.83 
 
 
640 aa  309  9e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0591  hypothetical protein  29.62 
 
 
646 aa  306  8.000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000770924  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4474  protein of unknown function DUF1680  32.82 
 
 
636 aa  305  2.0000000000000002e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3909  hypothetical protein  31.64 
 
 
656 aa  296  7e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4996  protein of unknown function DUF1680  29.77 
 
 
800 aa  293  6e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0292235  normal  0.0722722 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4952  hypothetical protein  31.6 
 
 
656 aa  293  8e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4002  hypothetical protein  30.77 
 
 
651 aa  293  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.563325 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3957  hypothetical protein  31.15 
 
 
651 aa  292  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  0.86497 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3877  hypothetical protein  30.77 
 
 
651 aa  292  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3893  hypothetical protein  30.62 
 
 
651 aa  292  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0635  protein of unknown function DUF1680  31.21 
 
 
656 aa  291  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4064  hypothetical protein  30.62 
 
 
651 aa  290  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03389  hypothetical protein  32.21 
 
 
667 aa  287  4e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03438  conserved hypothetical protein  32.21 
 
 
659 aa  287  5e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3619  protein of unknown function DUF1680  32.62 
 
 
640 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3907  protein of unknown function DUF1680  31.83 
 
 
648 aa  281  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.373018 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4162  hypothetical protein  32.68 
 
 
640 aa  280  5e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.549846 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2720  protein of unknown function DUF1680  32.17 
 
 
640 aa  279  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2907  protein of unknown function DUF1680  32.27 
 
 
659 aa  273  7e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0376366  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1696  hypothetical protein  33.28 
 
 
634 aa  271  2.9999999999999997e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.298068 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2748  protein of unknown function DUF1680  29.84 
 
 
684 aa  266  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0072487  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2738  protein of unknown function DUF1680  29.15 
 
 
680 aa  263  8.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0391777  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0910  hypothetical protein  29.3 
 
 
665 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.027132  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7232  protein of unknown function DUF1680  28.92 
 
 
666 aa  259  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00213031  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4097  hypothetical protein  28.74 
 
 
672 aa  258  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121081  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2143  hypothetical protein  28.77 
 
 
648 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.56985  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6525  protein of unknown function DUF1680  28.75 
 
 
647 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0294245 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2133  protein of unknown function DUF1680  29.12 
 
 
673 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401427  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05305  DUF1680 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G08910)  29.71 
 
 
629 aa  226  7e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1535  hypothetical protein  29.25 
 
 
742 aa  220  5e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1151  protein of unknown function DUF1680  35.61 
 
 
679 aa  213  1e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5347  protein of unknown function DUF1680  26.24 
 
 
686 aa  193  7e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611947  normal  0.22403 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0212  hypothetical protein  31.58 
 
 
397 aa  168  2.9999999999999998e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000517482  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0164  hypothetical protein  26.18 
 
 
602 aa  85.1  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.935603  normal  0.0626406 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0636  protein of unknown function DUF1680  27.17 
 
 
667 aa  77  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0320  hypothetical protein  26.67 
 
 
607 aa  74.7  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.280201  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1938  protein of unknown function DUF1680  28.53 
 
 
711 aa  72.8  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3876  hypothetical protein  20.65 
 
 
765 aa  72  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2035  protein of unknown function DUF1680  22.66 
 
 
678 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337709 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1342  hypothetical protein  27.73 
 
 
669 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3214  hypothetical protein  25.11 
 
 
844 aa  68.6  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.77483  normal  0.454399 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3545  hypothetical protein  26.92 
 
 
663 aa  68.2  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1480  protein of unknown function DUF1680  30.22 
 
 
632 aa  67.4  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311718  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  26.97 
 
 
963 aa  67.4  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0062  protein of unknown function DUF1680  29.07 
 
 
596 aa  67.4  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.560227 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2967  protein of unknown function DUF1680  27.11 
 
 
838 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000186086  hitchhiker  0.000639223 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4712  protein of unknown function DUF1680  28.53 
 
 
881 aa  65.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0089  protein of unknown function DUF1680  26.05 
 
 
677 aa  65.1  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2080  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  21.35 
 
 
795 aa  60.5  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.254608  hitchhiker  0.00000268125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4617  protein of unknown function DUF1680  23.16 
 
 
1025 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602011  normal  0.370298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  26.03 
 
 
771 aa  60.1  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1254  protein of unknown function DUF1680  20.92 
 
 
684 aa  59.3  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.831647  normal  0.201869 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1993  hypothetical protein  20.93 
 
 
795 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0573537  hitchhiker  0.00434895 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1422  protein of unknown function DUF1680  21.81 
 
 
760 aa  57.8  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428296  normal  0.497833 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1982  hypothetical protein  20.98 
 
 
795 aa  57.4  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0591519  hitchhiker  0.000518937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1728  protein of unknown function DUF1680  24.17 
 
 
675 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.670849  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01470  hypothetical protein  26.36 
 
 
783 aa  56.2  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  22.65 
 
 
955 aa  56.2  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0778  Acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  21.94 
 
 
803 aa  52  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.163489 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0478  protein of unknown function DUF1680  23.92 
 
 
641 aa  50.8  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2836  protein of unknown function DUF1680  23.12 
 
 
614 aa  45.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>