61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3413 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3413  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  659    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0531  hypothetical protein  51.15 
 
 		 345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8068  hypothetical protein  49.5 
 
 		 341 aa  301  9e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6752  hypothetical protein  48.86 
 
 		 337 aa  300  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00609082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1191  hypothetical protein  50 
 
 		 350 aa  296  3e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5144  hypothetical protein  46.08 
 
 		 331 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2404  hypothetical protein  44.12 
 
 		 329 aa  252  6e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.147622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3122  hypothetical protein  36.91 
 
 		 326 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2795  hypothetical protein  36.09 
 
 		 327 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2975  hypothetical protein  31.27 
 
 		 331 aa  145  9e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2203  hypothetical protein  32.39 
 
 		 349 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0598  hypothetical protein  30.92 
 
 		 364 aa  133  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2732  hypothetical protein  31.21 
 
 		 301 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.206778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3305  MetA-pathway phenol degradation-like protein  29.45 
 
 		 299 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2982  hypothetical protein  29.7 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000220614  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5460  hypothetical protein  31.42 
 
 		 296 aa  99  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0883  hypothetical protein  28.17 
 
 		 309 aa  96.3  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00462477  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3482  meta-pathway phenol degradation-like protein  29.39 
 
 		 318 aa  95.1  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08780  hypothetical protein  28.47 
 
 		 268 aa  92.8  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299934  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3157  meta-pathway phenol degradation-like protein  30.25 
 
 		 295 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4501  MetA-pathway phenol degradation-like protein  29.57 
 
 		 295 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1833  putative signal peptide protein  29.49 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30840  hypothetical protein  26.49 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.856206  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32260  signal peptide protein  27.3 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1588  hypothetical protein  26.9 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232894  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2107  putative signal peptide protein  27.64 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4267  hypothetical protein  30.69 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1676  hypothetical protein  28.94 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275603  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0190  hypothetical protein  25.61 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4527  hypothetical protein  25.9 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1838  phenol metabolism protein  25.42 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394031  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6970  hypothetical protein  26.67 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000157214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0368  hypothetical protein  29.07 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3846  hypothetical protein  27.8 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0341  hypothetical protein  28.9 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.225999  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2955  meta-pathway phenol degradation-like protein  25.61 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3168  hypothetical protein  24.54 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0092  hypothetical protein  28.14 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672977  normal  0.778879 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6407  hypothetical protein  27.61 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4488  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  24.84 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0355  hypothetical protein  27.8 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6101  putative lipoprotein  28.66 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70300  putative enzyme  28.66 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4536  phenol degradation protein  26.25 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375555  normal  0.225823 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3195  hypothetical protein  25.43 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5224  hypothetical protein  27.13 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0632  meta-pathway phenol degradation-like protein  24.63 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6119  hypothetical protein  27.38 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03076  putative signal peptide protein  25.77 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2098  hypothetical protein  25.62 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.591796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2127  phenol degradation-like protein  24.6 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1728  hypothetical protein  24.92 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000180313 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6917  hypothetical protein  26.56 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4890  hypothetical protein  26.25 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3274  hypothetical protein  26.25 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2845  phenol degradation-like protein  23.23 
 
 		 306 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1272  meta-pathway phenol degradation-like protein  25 
 
 		 325 aa  52.8  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1377  MetA-pathway phenol degradation-like protein  25.87 
 
 		 324 aa  49.3  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.351343  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2388  hypothetical protein  33.02 
 
 		 310 aa  47.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32640  hypothetical protein  26.71 
 
 		 303 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00101125  hitchhiker  0.00152263 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2763  hypothetical protein  26.71 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>