More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2006 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2006  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 487 aa  959    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1049  AMP-dependent synthetase and ligase  54 
 
 		 495 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4602  AMP-dependent synthetase and ligase  40.83 
 
 		 506 aa  280  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.666881  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2318  AMP-dependent synthetase and ligase  40.62 
 
 		 494 aa  269  7e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1541  AMP-dependent synthetase and ligase  40.62 
 
 		 494 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3330  acyl-CoA synthetase  32.99 
 
 		 559 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.13397  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3380  acyl-CoA synthetase  32.99 
 
 		 559 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000453165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3639  acyl-CoA synthetase  32.78 
 
 		 487 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3314  acyl-CoA synthetase  32.7 
 
 		 487 aa  240  4e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000215254  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3688  acyl-CoA synthetase  32.57 
 
 		 487 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000138735  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3419  acyl-CoA synthetase  32.85 
 
 		 559 aa  239  8e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00837827  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3647  acyl-CoA synthetase  32.43 
 
 		 487 aa  238  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3736  acyl-CoA synthetase  32.15 
 
 		 487 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3658  acyl-CoA synthetase  31.94 
 
 		 487 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0286615  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4735  AMP-dependent synthetase and ligase  35.27 
 
 		 509 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.660645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4677  AMP-dependent synthetase and ligase  35.38 
 
 		 507 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.65065 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1581  acyl-CoA synthetase  31.73 
 
 		 487 aa  229  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000337564  normal  0.0607251 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1851  AMP-dependent synthetase and ligase  34.81 
 
 		 468 aa  209  7e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000851454 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  34.53 
 
 		 468 aa  203  7e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.03963  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0500  AMP-dependent synthetase and ligase  36.44 
 
 		 498 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.178401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2517  AMP-dependent synthetase and ligase  35.68 
 
 		 459 aa  196  6e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.570913  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2789  AMP-dependent synthetase and ligase  36.98 
 
 		 384 aa  184  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.37 
 
 		 514 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4817  AMP-dependent synthetase and ligase  30.2 
 
 		 541 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  26.25 
 
 		 513 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2026  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.4 
 
 		 517 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.342397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.92 
 
 		 500 aa  159  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.72 
 
 		 499 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4848  AMP-dependent synthetase and ligase  32.51 
 
 		 498 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.13 
 
 		 512 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  27.12 
 
 		 518 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3898  AMP-dependent synthetase and ligase  34.41 
 
 		 553 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  31.27 
 
 		 564 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  30.75 
 
 		 561 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4604  AMP-dependent synthetase and ligase  29.87 
 
 		 492 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  28.45 
 
 		 520 aa  154  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3917  AMP-dependent synthetase and ligase  28.79 
 
 		 521 aa  153  5.9999999999999996e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.287192  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  29.38 
 
 		 514 aa  153  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.5 
 
 		 513 aa  153  7e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  28.41 
 
 		 527 aa  153  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3099  AMP-dependent synthetase and ligase  28.99 
 
 		 513 aa  152  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000841335 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0361  acyl-CoA synthetase  29.48 
 
 		 577 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  30.33 
 
 		 557 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6285  AMP-dependent synthetase and ligase  27.29 
 
 		 506 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.586819  normal  0.531753 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0371  acyl-CoA synthetase  29.48 
 
 		 577 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0350  acyl-CoA synthetase  29.48 
 
 		 574 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5455  hypothetical protein  31.86 
 
 		 459 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0861  AMP-dependent synthetase and ligase  28.72 
 
 		 514 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.33 
 
 		 579 aa  152  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  28.71 
 
 		 525 aa  151  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5364  acyl-CoA synthetase  29.63 
 
 		 536 aa  151  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.868662  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  29.94 
 
 		 562 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33180  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.14 
 
 		 509 aa  150  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0193282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0912  AMP-dependent synthetase and ligase  31.02 
 
 		 515 aa  150  7e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.881726 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  29.24 
 
 		 565 aa  149  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  27.54 
 
 		 495 aa  149  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.2 
 
 		 510 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0812  AMP-dependent synthetase and ligase  32.74 
 
 		 508 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.2 
 
 		 510 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.2 
 
 		 510 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.2 
 
 		 510 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.2 
 
 		 510 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1086  AMP-dependent synthetase and ligase  28.27 
 
 		 566 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0209  AMP-dependent synthetase and ligase  30.8 
 
 		 526 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.2 
 
 		 510 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.26 
 
 		 516 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1766  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  27.71 
 
 		 546 aa  148  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.810333  normal  0.381602 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1350  AMP-dependent synthetase and ligase  31.1 
 
 		 507 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.191133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0115  AMP-dependent synthetase and ligase  30.71 
 
 		 526 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0098  AMP-dependent synthetase and ligase  30.16 
 
 		 522 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.690806  normal  0.913632 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3788  acyl-CoA synthetase  29.21 
 
 		 523 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1072  AMP-dependent synthetase and ligase  31.2 
 
 		 532 aa  149  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334483 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  29.94 
 
 		 557 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.61 
 
 		 501 aa  148  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25 
 
 		 510 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.41 
 
 		 503 aa  147  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  26.64 
 
 		 490 aa  147  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.88 
 
 		 519 aa  147  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 		 511 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0404  hypothetical protein  29.29 
 
 		 605 aa  148  3e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.737872  normal  0.0168695 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.2 
 
 		 510 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25 
 
 		 510 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1913  AMP-dependent synthetase and ligase  30.67 
 
 		 515 aa  147  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  27.18 
 
 		 662 aa  147  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10274  acyl-CoA synthetase  30.42 
 
 		 560 aa  147  5e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0406036 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.25 
 
 		 543 aa  147  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4840  AMP-dependent synthetase and ligase  30.11 
 
 		 522 aa  146  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0208185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  31.59 
 
 		 507 aa  147  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1683  AMP-dependent synthetase and ligase  34.73 
 
 		 535 aa  146  7.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  29.45 
 
 		 560 aa  146  9e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  29.89 
 
 		 560 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0219  long chain fatty acid CoA ligase, putative  27.06 
 
 		 453 aa  145  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1971  AMP-binding domain protein  30.38 
 
 		 578 aa  146  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0553  AMP-dependent synthetase and ligase  35.06 
 
 		 527 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  28.26 
 
 		 539 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2438  AMP-dependent synthetase and ligase  30.65 
 
 		 512 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25 
 
 		 510 aa  145  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  30.91 
 
 		 501 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0612  AMP-dependent synthetase and ligase  25.11 
 
 		 458 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2126  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.65 
 
 		 546 aa  146  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>