44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0953 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0953  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  427  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1215  protein of unknown function DUF1109  40.38 
 
 
213 aa  141  9e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.344789  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4812  protein of unknown function DUF1109  43.4 
 
 
214 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.501191  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2572  protein of unknown function DUF1109  44.81 
 
 
214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0108126  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5126  protein of unknown function DUF1109  36.02 
 
 
213 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5017  hypothetical protein  37.85 
 
 
213 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.116462 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5130  protein of unknown function DUF1109  35.35 
 
 
213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4687  hypothetical protein  41.62 
 
 
213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152399  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1032  hypothetical protein  37.79 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4407  hypothetical protein  34.74 
 
 
213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2176  hypothetical protein  39.63 
 
 
236 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1024  protein of unknown function DUF1109  37.61 
 
 
216 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2033  putative transmembrane protein DUF1109  39.63 
 
 
213 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4102  hypothetical protein  37.09 
 
 
211 aa  108  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1521  hypothetical protein  37.95 
 
 
205 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0063  hypothetical protein  36.76 
 
 
208 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.495811 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2181  hypothetical protein  38.51 
 
 
213 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.594787 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1069  protein of unknown function DUF1109  35.21 
 
 
212 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0995  hypothetical protein  38.71 
 
 
213 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554431  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0022  hypothetical protein  36.97 
 
 
211 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.909042  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2589  hypothetical protein  35.05 
 
 
213 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0019  hypothetical protein  36.97 
 
 
211 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4274  hypothetical protein  34.74 
 
 
210 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2035  hypothetical protein  37.79 
 
 
214 aa  97.8  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0955586  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3063  hypothetical protein  37.56 
 
 
213 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.473245  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0957  hypothetical protein  35.35 
 
 
213 aa  95.9  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2667  protein of unknown function DUF1109  42.7 
 
 
213 aa  94.4  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2034  putative transmembrane protein DUF1109  37.96 
 
 
213 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2177  hypothetical protein  37.96 
 
 
213 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5143  protein of unknown function DUF1109  40.58 
 
 
213 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0760  hypothetical protein  38.5 
 
 
215 aa  93.2  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167226  normal  0.389046 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1059  protein of unknown function DUF1109  34.58 
 
 
212 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1911  hypothetical protein  35.05 
 
 
212 aa  92  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2572  protein of unknown function DUF1109  38.53 
 
 
216 aa  91.7  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.677742  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2193  hypothetical protein  39.53 
 
 
213 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2017  protein of unknown function DUF1109  35.21 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3554  hypothetical protein  32.29 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.30328  normal  0.787659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3008  hypothetical protein  33.49 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3134  hypothetical protein  32.09 
 
 
210 aa  63.5  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0306  protein of unknown function DUF1109  34.23 
 
 
210 aa  63.5  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1741  hypothetical protein  38.32 
 
 
214 aa  62  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0488886 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0818  hypothetical protein  36.75 
 
 
128 aa  58.5  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0046  hypothetical protein  54.76 
 
 
81 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2681  hypothetical protein  34.44 
 
 
214 aa  50.4  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.76812 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>