113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0806 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0806  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  506  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3149  hypothetical protein  93.88 
 
 		 318 aa  458  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1544  hypothetical protein  86.99 
 
 		 320 aa  445  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0398449 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3038  hypothetical protein  83.47 
 
 		 248 aa  421  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.502254 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2121  antirestriction protein; ArdC  81.3 
 
 		 317 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1223  hypothetical protein  83.95 
 
 		 320 aa  410  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.909972  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3512  hypothetical protein  83.95 
 
 		 320 aa  410  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.126742  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7703  putative ardC antirestriction protein  79.67 
 
 		 317 aa  408  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.166875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7394  putative ardC antirestriction protein  82.85 
 
 		 319 aa  397  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3059  protein of unknown function DUF1738  85.37 
 
 		 316 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0539  hypothetical protein  76.02 
 
 		 322 aa  394  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3814  hypothetical protein  78.37 
 
 		 321 aa  389  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0877775  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3921  antirestriction protein; ArdC  73.17 
 
 		 316 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2282  antirestriction protein; ArdC  79.4 
 
 		 313 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3326  putative ardC antirestriction protein  70.78 
 
 		 318 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3568  antirestriction protein; ArdC  74.58 
 
 		 316 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.883646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8295  domain of unknown function DUF1738  62.23 
 
 		 315 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399219  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1814  hypothetical protein  63.09 
 
 		 311 aa  300  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5558  domain of unknown function DUF1738  58.8 
 
 		 338 aa  290  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0470037 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6049  hypothetical protein  59.23 
 
 		 326 aa  289  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0381  putative ArdC antirestriction protein  58.68 
 
 		 312 aa  280  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2005  hypothetical protein  63.55 
 
 		 258 aa  263  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.146058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0128  antirestriction protein  40.98 
 
 		 321 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0527  hypothetical protein  45.83 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.989296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_19  putative antirestriction protein  39.91 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366429  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3793  hypothetical protein  44.49 
 
 		 301 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0255  antirestriction protein  42.19 
 
 		 299 aa  178  5.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9909  antirestriction protein  43.59 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9564  antirestriction protein  42.98 
 
 		 308 aa  177  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0574  antirestriction protein  42.13 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0021  antirestriction protein  39.91 
 
 		 319 aa  174  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4058  hypothetical protein  39.46 
 
 		 336 aa  172  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4426  hypothetical protein  40.52 
 
 		 332 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000360955  normal  0.236857 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4545  hypothetical protein  40.6 
 
 		 295 aa  169  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4610  hypothetical protein  40.52 
 
 		 332 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939593  normal  0.41393 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4401  domain of unknown function DUF1738  40.52 
 
 		 332 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505635  normal  0.161946 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4029  peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site  41.53 
 
 		 301 aa  169  5e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0395  hypothetical protein  38.38 
 
 		 344 aa  168  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.877999  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4757  hypothetical protein  40.81 
 
 		 308 aa  168  9e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4587  hypothetical protein  40.52 
 
 		 434 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_25  antirestriction protein ArdC  38.56 
 
 		 333 aa  167  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0306  antirestriction protein  39.48 
 
 		 288 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4123  hypothetical protein  37.36 
 
 		 335 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4483  ArdC gene in pSa(IncW plasmid)-like  41.1 
 
 		 308 aa  162  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00889579  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4322  hypothetical protein  41.53 
 
 		 308 aa  162  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4521  domain of unknown function DUF1738  39.91 
 
 		 326 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000111703  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4417  domain of unknown function DUF1738  39.91 
 
 		 326 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000308922  normal  0.463356 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4983  hypothetical protein  40.25 
 
 		 241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9173  antirestriction protein  40.34 
 
 		 310 aa  162  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12033  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1473  domain of unknown function DUF1738  36.63 
 
 		 314 aa  161  8.000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1960  domain of unknown function DUF1738  39.24 
 
 		 299 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1972  domain of unknown function DUF1738  39.02 
 
 		 362 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0738445  normal  0.0525568 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5261  hypothetical protein  41.44 
 
 		 311 aa  159  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0279  putative conjugal transfer antirestriction protein  41.18 
 
 		 308 aa  158  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8099  antirestriction protein  40.99 
 
 		 308 aa  155  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1780  antirestriction protein  35.38 
 
 		 322 aa  155  8e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.114291  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3690  antirestriction protein  35.69 
 
 		 323 aa  154  9e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2959  hypothetical protein  37.86 
 
 		 312 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409787  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6561  domain of unknown function DUF1738  38.62 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5543  domain of unknown function DUF1738  39.02 
 
 		 306 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234849  hitchhiker  0.00000802915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0427  antirestriction protein  40.26 
 
 		 313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5920  domain of unknown function DUF1738  40.91 
 
 		 311 aa  151  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4973  domain of unknown function DUF1738  37.65 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1648  domain of unknown function DUF1738  37.9 
 
 		 410 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6816  domain of unknown function DUF1738  37.8 
 
 		 306 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232152  normal  0.435368 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3336  hypothetical protein  36.89 
 
 		 312 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2529  hypothetical protein  34.52 
 
 		 384 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3033  DNA primase  36.73 
 
 		 320 aa  144  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828057 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3779  hypothetical protein  37.82 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.694827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1162  domain of unknown function DUF1738  35.19 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4749  domain of unknown function DUF1738  38.56 
 
 		 327 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.778127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0801  hypothetical protein  37.45 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.957883 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3581  hypothetical protein  36.71 
 
 		 284 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1844  protein of unknown function DUF1738  37.82 
 
 		 285 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.779395 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  38.02 
 
 		 1580 aa  135  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5409  hypothetical protein  39.13 
 
 		 260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.861263  normal  0.17576 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1461  domain of unknown function DUF1738  35.8 
 
 		 297 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  35.95 
 
 		 1448 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4018  hypothetical protein  35.9 
 
 		 312 aa  132  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.366526  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  36.03 
 
 		 1448 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  33.87 
 
 		 986 aa  132  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3034  hypothetical protein  34.58 
 
 		 300 aa  131  9e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2664  replication primases  36.21 
 
 		 300 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3932  hypothetical protein  35.63 
 
 		 300 aa  129  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1304  domain of unknown function DUF1738  34.71 
 
 		 1457 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000590213 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1615  DNA primase TraC  35.39 
 
 		 1449 aa  126  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  33.73 
 
 		 1077 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2363  domain of unknown function DUF1738  34.89 
 
 		 275 aa  124  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6336  domain of unknown function DUF1738  32.1 
 
 		 297 aa  124  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4265  antirestriction protein  38.42 
 
 		 169 aa  124  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.963524  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4138  hypothetical protein  36.21 
 
 		 320 aa  122  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4588  hypothetical protein  33.61 
 
 		 304 aa  122  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3741  hypothetical protein  34.89 
 
 		 310 aa  122  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6717  domain of unknown function DUF1738  33.88 
 
 		 319 aa  121  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323608  normal  0.58549 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0235  domain of unknown function DUF1738  33.88 
 
 		 1716 aa  116  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  32.78 
 
 		 1495 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5351  hypothetical protein  36.71 
 
 		 220 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.666575 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0639  hypothetical protein  32.91 
 
 		 276 aa  108  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6843  domain of unknown function DUF1738  30.83 
 
 		 296 aa  105  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.896751  normal  0.17936 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5500  domain of unknown function DUF1738  29.49 
 
 		 297 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348911 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>