43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4849 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4849  methyltransferase type 12  100 
 
 
253 aa  518  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.696517  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
246 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2164  methyltransferase type 12  26.07 
 
 
232 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00394597  normal  0.509385 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0912  Methyltransferase type 12  26.19 
 
 
224 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.734519 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 
675 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  26.48 
 
 
300 aa  49.3  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1102  methyltransferase type 11  28.66 
 
 
249 aa  47.4  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  27.83 
 
 
317 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1006  Methyltransferase type 11  25.68 
 
 
244 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0629  hypothetical protein  22.38 
 
 
239 aa  47  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.41007  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4608  methyltransferase type 11  29.26 
 
 
242 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.58 
 
 
259 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0388  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
226 aa  45.8  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  28.21 
 
 
663 aa  45.4  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3337  methyltransferase type 12  31.62 
 
 
228 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  31.85 
 
 
246 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  27.49 
 
 
1523 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0734  hypothetical protein  27.36 
 
 
330 aa  45.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69115  normal  0.886501 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2149  hypothetical protein  24.74 
 
 
223 aa  44.3  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  24.18 
 
 
250 aa  44.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  29.76 
 
 
269 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5435  methyltransferase type 12  32.08 
 
 
253 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01393  hypothetical protein  31.46 
 
 
535 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2925  methyltransferase type 11  24.58 
 
 
585 aa  43.5  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2535  Methyltransferase type 11  26.83 
 
 
225 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2265  methyltransferase type 12  31.72 
 
 
228 aa  43.5  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  29.63 
 
 
201 aa  43.1  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6845  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 
240 aa  43.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.613911  normal  0.262077 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004080  hypothetical protein  29.05 
 
 
522 aa  43.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  32.85 
 
 
243 aa  43.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5532  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.33 
 
 
440 aa  42.7  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3818  methyltransferase type 12  31.58 
 
 
250 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.329874  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3655  SAM binding protein  28.15 
 
 
221 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1055  Methyltransferase type 11  23.63 
 
 
248 aa  42.7  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5330  Methyltransferase type 12  29.46 
 
 
221 aa  42.4  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.918078  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  27.45 
 
 
296 aa  42  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1283  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.57 
 
 
440 aa  42.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.204658  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  27.5 
 
 
251 aa  42.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5031  methyltransferase type 12  31.43 
 
 
255 aa  42  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.038872  normal  0.858549 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3590  methyltransferase type 12  33.02 
 
 
253 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.698799  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  32.11 
 
 
298 aa  42  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  28.69 
 
 
246 aa  42  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  25.66 
 
 
286 aa  42  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>