More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4824 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4824  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
210 aa  415  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.322328  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2168  lysine exporter protein LysE/YggA  38.76 
 
 
208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2562  lysine exporter protein LysE/YggA  38.1 
 
 
211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003627  putative threonine efflux protein  30.81 
 
 
231 aa  123  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  31.9 
 
 
211 aa  121  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  32.65 
 
 
213 aa  120  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2459  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 
215 aa  117  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.593208  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  31.6 
 
 
211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1031  hypothetical protein  35.55 
 
 
212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332162  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1333  lysine exporter protein LysE/YggA  32.39 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  35.15 
 
 
215 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2500  lysine exporter protein LysE/YggA  32.18 
 
 
213 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106725  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2786  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.51 
 
 
206 aa  106  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  36.41 
 
 
210 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  37.5 
 
 
210 aa  104  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  35.55 
 
 
210 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  36.04 
 
 
210 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  36.04 
 
 
210 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2043  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.7 
 
 
208 aa  103  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000125036  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02483  hypothetical protein  33.17 
 
 
209 aa  102  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1388  amino acid transporter LysE  34.66 
 
 
228 aa  102  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0501572  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3663  lysine exporter protein LysE/YggA  34.52 
 
 
209 aa  101  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  32.24 
 
 
217 aa  101  8e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  31.58 
 
 
217 aa  100  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.66 
 
 
218 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.17 
 
 
218 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  35.9 
 
 
210 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1483  lysine exporter protein LysE/YggA  32.12 
 
 
215 aa  99.4  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  25 
 
 
209 aa  98.6  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.22 
 
 
213 aa  98.2  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295219  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4180  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.88 
 
 
207 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4465  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.4 
 
 
207 aa  96.7  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.17 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  24.64 
 
 
209 aa  97.1  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4548  lysine exporter protein LysE/YggA  31.4 
 
 
212 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.86 
 
 
219 aa  95.5  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0333  lysine exporter protein LysE/YggA  35.2 
 
 
210 aa  94.7  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.547717  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  24.35 
 
 
210 aa  94.7  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1147  transporter, LysE family  31 
 
 
210 aa  94  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  36.23 
 
 
211 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  24.87 
 
 
210 aa  94  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  24.35 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  24.35 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  24.35 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  24.35 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3097  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.82 
 
 
206 aa  92.8  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179524  hitchhiker  0.00000160159 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  24.35 
 
 
210 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  24.48 
 
 
210 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.36 
 
 
208 aa  92.4  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  31.36 
 
 
208 aa  92.4  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4075  LysE family efflux protein  33.18 
 
 
221 aa  92.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  35.12 
 
 
208 aa  92.4  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4719  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.34 
 
 
212 aa  92.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.41 
 
 
208 aa  92  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.78 
 
 
211 aa  92  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 
210 aa  92  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0476  lysine exporter protein LysE/YggA  30.12 
 
 
209 aa  92  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2383  homoserine/threonine efflux protein, putative  24.87 
 
 
210 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.02 
 
 
210 aa  91.7  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  30.73 
 
 
217 aa  91.7  8e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4224  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.5 
 
 
211 aa  91.7  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.59284  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5694  lysine exporter protein LysE/YggA  32.54 
 
 
205 aa  91.3  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  26.54 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3141  lysine exporter protein LysE/YggA  37.2 
 
 
213 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.514565  normal  0.554318 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  31.36 
 
 
208 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3063  lysine exporter protein LysE/YggA  36.71 
 
 
213 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6040  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.03 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0839  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.41 
 
 
211 aa  90.5  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.889262  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  32.88 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.03 
 
 
211 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4710  lysine exporter protein LysE/YggA  27.92 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1341  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.39 
 
 
245 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40784 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3180  lysine exporter protein LysE/YggA  36.71 
 
 
213 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.920743  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3976  lysine exporter protein LysE/YggA  33.52 
 
 
205 aa  90.5  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  35.03 
 
 
211 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0208  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.8 
 
 
211 aa  90.5  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0814  hypothetical protein  32.54 
 
 
210 aa  89.7  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6503  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.76 
 
 
210 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  34.44 
 
 
211 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2495  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.1 
 
 
211 aa  89.4  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000331121  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  34.44 
 
 
211 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2711  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.43 
 
 
210 aa  89.7  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.223328  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  34.44 
 
 
211 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.56 
 
 
211 aa  89.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  34.44 
 
 
211 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  35.03 
 
 
211 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  35.78 
 
 
213 aa  89.4  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.05 
 
 
208 aa  89  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2019  lysine exporter protein LysE/YggA  31.03 
 
 
248 aa  89.4  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.318946 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2511  lysine exporter protein LysE/YggA  36.71 
 
 
213 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2555  lysine exporter protein LysE/YggA  33.51 
 
 
210 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3125  lysine exporter protein LysE/YggA  36.71 
 
 
213 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.298747  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3404  lysine exporter protein LysE/YggA  31.32 
 
 
211 aa  89  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325379  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0699  amino acid transporter LysE  31.63 
 
 
204 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0691811  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0051  amino acid transporter LysE  28.79 
 
 
210 aa  88.6  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.39 
 
 
208 aa  88.6  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2078  lysine exporter protein LysE/YggA  31.36 
 
 
213 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 
207 aa  88.6  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  26.54 
 
 
208 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1558  hypothetical protein  38.13 
 
 
206 aa  88.2  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>