177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4268 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4268  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 
454 aa  894    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  36.97 
 
 
500 aa  231  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  33.11 
 
 
490 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  36.6 
 
 
462 aa  209  6e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  35.89 
 
 
451 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  37.02 
 
 
462 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0329422 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  31.5 
 
 
449 aa  199  1.0000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  33.41 
 
 
453 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  33.75 
 
 
457 aa  196  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  33.41 
 
 
463 aa  192  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  39.81 
 
 
458 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5175  hypothetical protein  35.56 
 
 
453 aa  185  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  30.75 
 
 
457 aa  182  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0113  MmgE/PrpD family protein  35.22 
 
 
465 aa  180  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  35.63 
 
 
451 aa  179  9e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  35.88 
 
 
456 aa  179  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3094  MmgE/PrpD family protein  31.91 
 
 
453 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  34.44 
 
 
463 aa  177  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4177  MmgE/PrpD family protein  31.69 
 
 
441 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  31.92 
 
 
482 aa  173  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  30.92 
 
 
481 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3986  MmgE/PrpD family protein  31.16 
 
 
441 aa  169  8e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  30.92 
 
 
483 aa  169  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  30.18 
 
 
488 aa  169  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  36.39 
 
 
482 aa  165  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  33.33 
 
 
455 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  31.63 
 
 
471 aa  162  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3745  MmgE/PrpD family protein  37.08 
 
 
442 aa  155  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  33.04 
 
 
450 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0638  MmgE/PrpD family protein  38.79 
 
 
443 aa  153  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  29.57 
 
 
501 aa  152  8.999999999999999e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  31.4 
 
 
461 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  34.81 
 
 
456 aa  149  9e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  32.71 
 
 
450 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3559  MmgE/PrpD family protein  36.19 
 
 
442 aa  147  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.595946  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  27.92 
 
 
456 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  28.86 
 
 
451 aa  146  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2365  MmgE/PrpD family protein  36.28 
 
 
439 aa  145  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2428  MmgE/PrpD  35.64 
 
 
404 aa  144  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0639632  normal  0.19006 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  42.44 
 
 
458 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4091  hypothetical protein  33.09 
 
 
451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42622  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  31.41 
 
 
450 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  30.83 
 
 
453 aa  137  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0678  MmgE/PrpD family protein  34.47 
 
 
444 aa  136  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  31.92 
 
 
458 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  32.14 
 
 
458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4176  MmgE/PrpD family protein  31.89 
 
 
450 aa  133  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  32.96 
 
 
459 aa  133  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  30.4 
 
 
443 aa  133  7.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6206  MmgE/PrpD family protein  31.77 
 
 
451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  24.88 
 
 
449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  26.85 
 
 
460 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  33.02 
 
 
460 aa  130  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  32.15 
 
 
462 aa  128  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  31.99 
 
 
453 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  34.8 
 
 
456 aa  126  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  31.58 
 
 
457 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  36.59 
 
 
458 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0288  putative MmgE/PrpD family protein  32.28 
 
 
456 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  24.48 
 
 
446 aa  124  3e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  27.41 
 
 
481 aa  124  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  24.24 
 
 
446 aa  124  5e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0108  propionate catabolism protein  25.13 
 
 
444 aa  123  6e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  35.87 
 
 
454 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  32.64 
 
 
467 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  24 
 
 
446 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  36.23 
 
 
457 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1511  MmgE/PrpD  27.1 
 
 
472 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  31.03 
 
 
445 aa  120  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  36.53 
 
 
455 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  29.93 
 
 
476 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  31.45 
 
 
503 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  28.94 
 
 
468 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  31.45 
 
 
503 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  27.16 
 
 
449 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  29.08 
 
 
447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  29.73 
 
 
470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  29.84 
 
 
470 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  30.96 
 
 
503 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  30.79 
 
 
450 aa  114  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  27.68 
 
 
481 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  32.46 
 
 
461 aa  113  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  28.9 
 
 
449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  26.51 
 
 
460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  31.08 
 
 
486 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1089  MmgE/PrpD family protein  31.9 
 
 
441 aa  111  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  28.2 
 
 
461 aa  111  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  31.73 
 
 
454 aa  110  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  31.2 
 
 
468 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1228  MmgE/PrpD family protein  28.87 
 
 
485 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  32.79 
 
 
465 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  29.47 
 
 
462 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  33.6 
 
 
447 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  28.74 
 
 
442 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  30.14 
 
 
454 aa  107  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001534  MmgE/PrpD family protein  25.62 
 
 
453 aa  107  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4102  hypothetical protein  28.71 
 
 
461 aa  106  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  34.44 
 
 
468 aa  106  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1723  hypothetical protein  27.13 
 
 
489 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116764  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43263  hypothetical protein  26.05 
 
 
481 aa  103  7e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>