More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3925 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3925  NUDIX hydrolase  100 
 
 
155 aa  311  2.9999999999999996e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0241724  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3686  NUDIX hydrolase  81.88 
 
 
151 aa  239  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0799  NUDIX hydrolase  80.27 
 
 
148 aa  233  5.0000000000000005e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.428384 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0762  NUDIX hydrolase  79.59 
 
 
148 aa  231  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  73.1 
 
 
172 aa  218  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4229  NUDIX hydrolase  75 
 
 
150 aa  210  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0351267  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2908  NUDIX hydrolase  66.18 
 
 
159 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  63.38 
 
 
151 aa  179  9.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0431808 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0544  NUDIX hydrolase  64.29 
 
 
166 aa  174  5e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0831  NUDIX hydrolase  63.43 
 
 
166 aa  173  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.556383  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  61.83 
 
 
149 aa  167  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  61.83 
 
 
149 aa  167  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  59.4 
 
 
153 aa  166  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  56.43 
 
 
142 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  62.2 
 
 
137 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  60.15 
 
 
149 aa  160  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  59.85 
 
 
334 aa  159  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  60.31 
 
 
149 aa  159  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  61.54 
 
 
147 aa  159  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  59.4 
 
 
149 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  59.4 
 
 
149 aa  158  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  59.4 
 
 
149 aa  158  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  59.4 
 
 
149 aa  158  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  54.61 
 
 
141 aa  158  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  59.4 
 
 
149 aa  158  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  58.02 
 
 
147 aa  157  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  58.02 
 
 
147 aa  155  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  58.02 
 
 
147 aa  155  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  58.02 
 
 
147 aa  155  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  56.93 
 
 
142 aa  152  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  57.03 
 
 
147 aa  148  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2824  NUDIX hydrolase  52.74 
 
 
153 aa  148  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.852185  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0500  NUDIX hydrolase  55.15 
 
 
152 aa  147  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0475  NUDIX hydrolase  55.15 
 
 
152 aa  147  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.573491  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  55.04 
 
 
138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  54.03 
 
 
137 aa  124  7e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  48.72 
 
 
312 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  49.22 
 
 
314 aa  110  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  45.97 
 
 
325 aa  111  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  49.21 
 
 
316 aa  108  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  47.46 
 
 
310 aa  102  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  51.52 
 
 
329 aa  99.4  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  51.52 
 
 
329 aa  99.4  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  49.19 
 
 
169 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  43.33 
 
 
315 aa  92  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  45.24 
 
 
133 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  44.66 
 
 
130 aa  86.3  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.83 
 
 
128 aa  86.7  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.83 
 
 
128 aa  86.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.83 
 
 
128 aa  86.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  41.46 
 
 
130 aa  86.3  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  45.16 
 
 
347 aa  85.9  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  40.65 
 
 
130 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  44.66 
 
 
132 aa  86.3  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  44.66 
 
 
132 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  44.55 
 
 
313 aa  85.1  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  44.66 
 
 
132 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  48.08 
 
 
151 aa  85.1  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  44.66 
 
 
130 aa  85.1  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  45.63 
 
 
130 aa  84.3  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03249  mutator mutT protein  37.6 
 
 
127 aa  83.6  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  43.69 
 
 
130 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  37.6 
 
 
129 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  42.72 
 
 
129 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  38.4 
 
 
134 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.78 
 
 
134 aa  81.6  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  41.6 
 
 
319 aa  82  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  39.26 
 
 
322 aa  80.9  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  32.56 
 
 
132 aa  80.1  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1102  NUDIX hydrolase  39.1 
 
 
136 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.142351  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  42.72 
 
 
316 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  41.88 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2605  mutator MutT protein  44.44 
 
 
128 aa  79.7  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.402694  hitchhiker  0.00000000101323 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  43.64 
 
 
142 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  43.64 
 
 
137 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  39.32 
 
 
317 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  44.86 
 
 
136 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  39.83 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  46.6 
 
 
128 aa  79.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  43.69 
 
 
313 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  40 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  42.72 
 
 
316 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  40.78 
 
 
314 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  44.66 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  43.93 
 
 
133 aa  78.2  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 
141 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  39.62 
 
 
134 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  42.28 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  35.51 
 
 
306 aa  77.8  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  45.63 
 
 
334 aa  77.8  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  44.68 
 
 
135 aa  77.8  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  32.06 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.38 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  47.57 
 
 
129 aa  77.8  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  40.78 
 
 
314 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  40.78 
 
 
314 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  41.44 
 
 
138 aa  77.4  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  40.78 
 
 
314 aa  77.4  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  44.23 
 
 
138 aa  77  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 
131 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>