More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1985 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6164  argininosuccinate lyase  73.78 
 
 
477 aa  674    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6457  argininosuccinate lyase  73.36 
 
 
477 aa  669    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1985  argininosuccinate lyase  100 
 
 
480 aa  968    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290932  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2852  argininosuccinate lyase  66.24 
 
 
475 aa  621  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3518  argininosuccinate lyase  64.88 
 
 
476 aa  598  1e-170  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4987  argininosuccinate lyase  59.92 
 
 
488 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718333 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2158  argininosuccinate lyase  55.67 
 
 
472 aa  508  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000750754  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2024  argininosuccinate lyase  54.87 
 
 
482 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0998023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6070  argininosuccinate lyase  53.75 
 
 
472 aa  503  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.566647  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1118  argininosuccinate lyase  54.64 
 
 
474 aa  501  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.542068 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3168  argininosuccinate lyase  56.37 
 
 
464 aa  499  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0440728 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3069  argininosuccinate lyase  56.52 
 
 
470 aa  501  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5465  argininosuccinate lyase  54.31 
 
 
472 aa  499  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559884  hitchhiker  0.0094933 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1888  argininosuccinate lyase  56.93 
 
 
487 aa  497  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0738965  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22260  argininosuccinate lyase  53.19 
 
 
500 aa  493  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1256  argininosuccinate lyase  57.33 
 
 
489 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.114721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5449  argininosuccinate lyase  54.34 
 
 
463 aa  486  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1744  argininosuccinate lyase  55.51 
 
 
511 aa  486  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814038 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2051  argininosuccinate lyase  54.49 
 
 
476 aa  476  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1895  argininosuccinate lyase  57.14 
 
 
487 aa  473  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.329316  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1504  argininosuccinate lyase  52.97 
 
 
480 aa  474  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000851302 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1503  argininosuccinate lyase  52.62 
 
 
479 aa  473  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2475  argininosuccinate lyase  54.42 
 
 
470 aa  473  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3022  argininosuccinate lyase  55.36 
 
 
486 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3155  argininosuccinate lyase  53.04 
 
 
481 aa  470  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3055  argininosuccinate lyase  52.97 
 
 
472 aa  467  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.097869  normal  0.940422 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14330  argininosuccinate lyase  51.96 
 
 
486 aa  462  1e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00125191  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25560  argininosuccinate lyase  54.01 
 
 
465 aa  463  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1333  argininosuccinate lyase  54.13 
 
 
484 aa  461  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279434  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2366  argininosuccinate lyase  53.15 
 
 
476 aa  456  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23929  decreased coverage  0.0035121 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10100  argininosuccinate lyase  52.23 
 
 
478 aa  449  1e-125  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4124  argininosuccinate lyase  54.78 
 
 
485 aa  448  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.826501  hitchhiker  0.0000576183 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1648  argininosuccinate lyase  52.53 
 
 
471 aa  443  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0809  argininosuccinate lyase  51.2 
 
 
490 aa  444  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2396  argininosuccinate lyase  49.35 
 
 
482 aa  441  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0675  argininosuccinate lyase  50.11 
 
 
505 aa  432  1e-120  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3523  argininosuccinate lyase  52.35 
 
 
470 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.286619 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2834  argininosuccinate lyase  51.23 
 
 
495 aa  415  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11677  argininosuccinate lyase  51.68 
 
 
470 aa  409  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480026  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21670  argininosuccinate lyase  51.11 
 
 
502 aa  411  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335342  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3307  argininosuccinate lyase  51.56 
 
 
470 aa  402  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2980  argininosuccinate lyase  51.9 
 
 
470 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0620413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2965  argininosuccinate lyase  51.9 
 
 
470 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3009  argininosuccinate lyase  51.9 
 
 
470 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  43.36 
 
 
459 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  43.14 
 
 
462 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  43.14 
 
 
462 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  42.92 
 
 
462 aa  385  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  45.12 
 
 
459 aa  382  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  42.92 
 
 
462 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  43.14 
 
 
463 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  43.64 
 
 
462 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3211  argininosuccinate lyase  45.21 
 
 
455 aa  383  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.575771 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1602  argininosuccinate lyase  42.92 
 
 
460 aa  384  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715259  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  42.92 
 
 
462 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1123  argininosuccinate lyase ArgH-like protein  41.67 
 
 
458 aa  383  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.168929 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  42.79 
 
 
458 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  42.7 
 
 
463 aa  382  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  42.98 
 
 
462 aa  382  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  42.48 
 
 
462 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0397  argininosuccinate lyase  44.92 
 
 
478 aa  381  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0817462  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  43.14 
 
 
462 aa  379  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  43.17 
 
 
458 aa  375  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  42.79 
 
 
462 aa  376  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  42.24 
 
 
481 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  42.79 
 
 
458 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  42.95 
 
 
456 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  41.06 
 
 
461 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  41.85 
 
 
458 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0275  argininosuccinate lyase  39.78 
 
 
466 aa  374  1e-102  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  42.58 
 
 
468 aa  372  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1981  argininosuccinate lyase  41.24 
 
 
466 aa  370  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  42.7 
 
 
458 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  41.14 
 
 
458 aa  371  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4504  argininosuccinate lyase  43.6 
 
 
459 aa  371  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961173  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  44.52 
 
 
459 aa  369  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3741  argininosuccinate lyase  42.79 
 
 
464 aa  369  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1906  argininosuccinate lyase  41.24 
 
 
493 aa  370  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0684  argininosuccinate lyase  41.58 
 
 
460 aa  371  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.586592  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  44.49 
 
 
469 aa  369  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1738  argininosuccinate lyase  44.25 
 
 
462 aa  366  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.44445  normal  0.823311 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0497  argininosuccinate lyase  42.64 
 
 
476 aa  365  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0126  argininosuccinate lyase  41.87 
 
 
459 aa  365  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.900188  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  43.61 
 
 
458 aa  368  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  43.68 
 
 
464 aa  365  1e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  43.96 
 
 
464 aa  365  1e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2264  argininosuccinate lyase  41.47 
 
 
491 aa  365  1e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  38.9 
 
 
461 aa  365  1e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0095  argininosuccinate lyase  42.73 
 
 
457 aa  364  2e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3612  argininosuccinate lyase  43.88 
 
 
463 aa  364  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3489  argininosuccinate lyase  43.38 
 
 
463 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1791  argininosuccinate lyase  39.3 
 
 
461 aa  363  5.0000000000000005e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3289  argininosuccinate lyase  43.46 
 
 
463 aa  362  6e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.52202  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  42.28 
 
 
461 aa  362  8e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0126  argininosuccinate lyase  39.91 
 
 
462 aa  362  9e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.013786  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0999  argininosuccinate lyase  40.8 
 
 
466 aa  362  9e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2328  argininosuccinate lyase  42.61 
 
 
476 aa  362  1e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.306722  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3038  argininosuccinate lyase  41.3 
 
 
473 aa  362  1e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2864  argininosuccinate lyase  40.83 
 
 
458 aa  362  1e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15683  normal  0.0573198 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  40.22 
 
 
459 aa  361  2e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>