More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1778 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1778  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 259 aa  509  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01778  enoyl-CoA hydratase  72.44 
 
 		 259 aa  345  6e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19740  enoyl-CoA hydratase  64.84 
 
 		 256 aa  292  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1006  enoyl-CoA hydratase  66.96 
 
 		 254 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.451958 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1700  enoyl-CoA hydratase  64.84 
 
 		 256 aa  291  5e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183828  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0978  enoyl-CoA hydratase  66.96 
 
 		 254 aa  291  6e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0996  enoyl-CoA hydratase  66.96 
 
 		 254 aa  291  6e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0785  enoyl-CoA hydratase  62.93 
 
 		 274 aa  286  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.460617 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5084  enoyl-CoA hydratase  61.48 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.965441 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0941  enoyl-CoA hydratase  61.02 
 
 		 257 aa  281  6.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32890  enoyl-CoA hydratase  57.87 
 
 		 258 aa  279  3e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0620133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1272  enoyl-CoA hydratase  60.7 
 
 		 265 aa  278  9e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0499602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0491  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.62 
 
 		 260 aa  276  3e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0289  enoyl-CoA hydratase  64.03 
 
 		 257 aa  276  3e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0727939  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3276  enoyl-CoA hydratase  66.4 
 
 		 245 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1456  enoyl-CoA hydratase  61.57 
 
 		 257 aa  273  1.0000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.423076  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1403  enoyl-CoA hydratase  56.27 
 
 		 267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.930333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0701  enoyl-CoA hydratase  56.7 
 
 		 261 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2431  enoyl-CoA hydratase  64.9 
 
 		 292 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.197627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10689  enoyl-CoA hydratase  62.15 
 
 		 263 aa  271  7e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4961  enoyl-CoA hydratase  61.48 
 
 		 253 aa  269  4e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.313807  normal  0.100535 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0151  enoyl-CoA hydratase  57.36 
 
 		 260 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3896  enoyl-CoA hydratase  60.85 
 
 		 274 aa  265  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0387  enoyl-CoA hydratase  54.65 
 
 		 266 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0473  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.78 
 
 		 264 aa  259  3e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3941  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.38 
 
 		 255 aa  256  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0344  enoyl-CoA hydratase  54.41 
 
 		 267 aa  254  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0288  enoyl-CoA hydratase  61.42 
 
 		 255 aa  250  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.977294  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4725  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.61 
 
 		 254 aa  248  7e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0948054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4465  enoyl-CoA hydratase  59.84 
 
 		 252 aa  244  6.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0779435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4447  enoyl-CoA hydratase  64.62 
 
 		 253 aa  241  6e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.175913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2337  enoyl-CoA hydratase  65.22 
 
 		 258 aa  239  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.072463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3498  enoyl-CoA hydratase  55.11 
 
 		 271 aa  235  6e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6226  enoyl-CoA hydratase  56 
 
 		 248 aa  234  8e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00180  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07560)  50.36 
 
 		 296 aa  227  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6186  enoyl-CoA hydratase  58.04 
 
 		 262 aa  216  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4094  enoyl-CoA hydratase  55.47 
 
 		 265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3453  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.39 
 
 		 234 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0188268  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0500  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.21 
 
 		 289 aa  159  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217153  normal  0.956057 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3985  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.32 
 
 		 269 aa  149  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.213719  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1480  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.43 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  37.29 
 
 		 277 aa  129  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.29 
 
 		 259 aa  130  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0882  short chain enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 		 259 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.43 
 
 		 262 aa  128  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 		 270 aa  126  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3960  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.68 
 
 		 273 aa  126  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0107  enoyl-CoA hydratase  35.42 
 
 		 254 aa  125  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0461  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.19 
 
 		 259 aa  125  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.773057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  35.89 
 
 		 264 aa  125  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1529  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.13 
 
 		 259 aa  125  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338476 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.7 
 
 		 659 aa  124  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  38.12 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1773  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.8 
 
 		 256 aa  123  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.287429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.22 
 
 		 259 aa  123  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.03 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  38.01 
 
 		 259 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.7 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  34.6 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.72 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1962  enoyl-CoA hydratase  37.93 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1968  short chain enoyl-CoA hydratase  35.04 
 
 		 266 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4318  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.09 
 
 		 250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0266  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.57 
 
 		 265 aa  119  6e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0235599 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 		 258 aa  119  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.415627  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2872  enoyl-CoA hydratase  34.15 
 
 		 258 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000338858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13549  enoyl-CoA hydratase  33.87 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000434368  hitchhiker  0.00000386498 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4479  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.55 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  34.18 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2726  enoyl-CoA hydratase  35.54 
 
 		 266 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.407003  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1803  short chain enoyl-CoA hydratase  34.21 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  34.03 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3602  enoyl-CoA hydratase  38.73 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1865  enoyl-CoA hydratase  36.07 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0130428  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0648  short chain enoyl-CoA hydratase  33.75 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0972113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4849  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.62 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.47 
 
 		 256 aa  115  6e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00240  enoyl-CoA hydratase, putative  33.33 
 
 		 283 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0589051  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3114  enoyl-CoA hydratase  33.75 
 
 		 258 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000516225  normal  0.042562 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  37.24 
 
 		 257 aa  115  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  34.8 
 
 		 257 aa  115  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.58 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3030  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.59 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.045049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1281  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.41 
 
 		 257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2850  enoyl-CoA hydratase  33.76 
 
 		 258 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.00000000000104318  normal  0.652493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1099  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.74 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0490806  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3662  short chain enoyl-CoA hydratase  38.3 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.745999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0860  short chain enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  32.91 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.86 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1542  enoyl-CoA hydratase  33.9 
 
 		 287 aa  113  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1308  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.06 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000837602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.94 
 
 		 273 aa  112  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3853  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40 
 
 		 256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.307462  normal  0.645815 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0614  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.77 
 
 		 262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.18 
 
 		 261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.28 
 
 		 258 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0153  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.24 
 
 		 257 aa  112  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651497  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3485  enoyl-CoA hydratase  33.9 
 
 		 258 aa  112  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.00000000302611  hitchhiker  0.000530427 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0054  enoyl-CoA hydratase  36.79 
 
 		 270 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>