More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06171 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06171  hypothetical protein  100 
 
 		 555 aa  1143    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1176  response regulator receiver protein  47.2 
 
 		 540 aa  550  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1257  response regulator VieB  46.69 
 
 		 553 aa  522  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00784807  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0359  putative PAS/PAC sensor protein  29.07 
 
 		 560 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2074  response regulator receiver domain-containing protein  29.77 
 
 		 551 aa  137  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3496  TPR repeat-containing response regulator  31.72 
 
 		 533 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4101  response regulator receiver:tetratricopeptide TPR_4  28.8 
 
 		 572 aa  134  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1911  response regulator/TPR domain protein  31.38 
 
 		 533 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.014975  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4421  response regulator receiver protein  28.98 
 
 		 535 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4261  response regulator receiver domain-containing protein  30.34 
 
 		 534 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.143411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0477  response regulator receiver domain-containing protein  32.31 
 
 		 537 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0768  response regulator/TPR domain-containing protein  29.3 
 
 		 535 aa  123  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0795  response regulator receiver protein  29.3 
 
 		 535 aa  123  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184844 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0809  response regulator receiver protein  29.3 
 
 		 535 aa  123  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2579  response regulator receiver protein  27.3 
 
 		 547 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2920  response regulator receiver protein  25.82 
 
 		 538 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0284416  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02197  response regulator receiver protein  29.39 
 
 		 540 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00179351  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01935  Response regulator with TPR repeat  31.03 
 
 		 546 aa  118  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0897  response regulator receiver protein  29.82 
 
 		 546 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2318  response regulator receiver protein  26.39 
 
 		 403 aa  116  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1854  response regulator receiver domain-containing protein  28.07 
 
 		 549 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.274781 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1169  two component transcriptional regulator, AraC family  28.63 
 
 		 549 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2578  response regulator receiver protein  26.79 
 
 		 577 aa  110  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000176794 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0145  response regulator receiver:tetratricopeptide TPR_4  29.53 
 
 		 449 aa  107  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0041  response regulator  29.11 
 
 		 535 aa  99  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01769  response regulator receiver protein  25.16 
 
 		 561 aa  98.2  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.4688  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1458  response regulator receiver protein  28.91 
 
 		 416 aa  96.7  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.893415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1420  response regulator receiver domain-containing protein  28.45 
 
 		 561 aa  95.5  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0947  response regulator receiver protein  27.07 
 
 		 539 aa  92.4  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00824863  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1457  response regulator receiver protein  26.37 
 
 		 421 aa  87.4  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3634  response regulator receiver  29.67 
 
 		 587 aa  86.7  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.351597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1860  putative response regulator  23.4 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.436307  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.33 
 
 		 900 aa  67.4  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269875  normal  0.342346 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1440  response regulator  34.17 
 
 		 391 aa  66.6  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2223  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 127 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1268  response regulator receiver protein  20.15 
 
 		 513 aa  62  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 204 aa  62.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0315  putative response regulator  25.95 
 
 		 576 aa  62  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.601639  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2015  two component hybrid sensor response regulator  33.33 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0388  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 127 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1366  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 131 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280194  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0897  response regulator receiver domain-containing protein  32.77 
 
 		 131 aa  58.9  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.13034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3762  putative adenylate/guanylate cyclase  36.63 
 
 		 520 aa  58.9  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.978534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0419  response regulator receiver  31.93 
 
 		 127 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487855  normal  0.449259 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0489  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 127 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514722 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0452  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 127 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0577794  normal  0.205923 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1662  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  30.89 
 
 		 131 aa  57.8  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0518  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  30.25 
 
 		 129 aa  57.8  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150153  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1285  response regulator receiver  31.67 
 
 		 131 aa  57.4  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0521811 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2526  two component transcriptional regulator  32 
 
 		 221 aa  57  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  30 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1181  response regulator receiver domain-containing protein  31.67 
 
 		 131 aa  57  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125402 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2540  response regulator receiver  31.67 
 
 		 131 aa  56.6  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2825  Fis family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 589 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208492  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3160  response regulator receiver domain-containing protein  31.67 
 
 		 131 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2803  DNA-binding transcriptional regulator TorR  30.97 
 
 		 241 aa  55.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0576  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  31.97 
 
 		 435 aa  55.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0478  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.33 
 
 		 422 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.60604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2551  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 396 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14529e-19 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3367  DNA-binding transcriptional regulator TorR  31.11 
 
 		 236 aa  55.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0610  response regulator receiver protein  28.1 
 
 		 128 aa  55.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.667708  normal  0.178716 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0766  two component signal transduction response regulator  31.15 
 
 		 121 aa  55.5  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 127 aa  55.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3589  two component transcriptional regulator  31.2 
 
 		 221 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0885  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 127 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123702  hitchhiker  0.00202919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2810  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 998 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3999  adenylate/guanylate cyclase  33.86 
 
 		 351 aa  54.7  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  28.21 
 
 		 126 aa  54.7  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1830  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 		 1165 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0905  two component transcriptional regulator  27.41 
 
 		 238 aa  54.3  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0160  response regulator receiver protein  27.35 
 
 		 126 aa  53.9  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0080  two component transcriptional regulator  31.34 
 
 		 257 aa  53.9  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.479264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  28.21 
 
 		 474 aa  53.9  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0748  response regulator receiver domain-containing protein  29.84 
 
 		 137 aa  53.9  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.927301  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  29.27 
 
 		 131 aa  53.9  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3467  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 126 aa  53.9  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  26.75 
 
 		 239 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1402  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  27.87 
 
 		 133 aa  53.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  26.75 
 
 		 239 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.57 
 
 		 313 aa  53.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  26.75 
 
 		 239 aa  53.5  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  26.75 
 
 		 239 aa  53.5  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0251  response regulator receiver protein  29.6 
 
 		 126 aa  53.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.102048 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  26.75 
 
 		 239 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0268  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  25.93 
 
 		 456 aa  53.5  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540037 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  26.75 
 
 		 239 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.41 
 
 		 391 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 130 aa  53.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0384  response regulator receiver domain-containing protein  28.21 
 
 		 126 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.726249  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  26.75 
 
 		 239 aa  53.5  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0919  two component AraC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 356 aa  53.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  26.75 
 
 		 239 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 472 aa  53.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3087  ATP-binding region, ATPase-like  34.17 
 
 		 847 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.373882  normal  0.0754896 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0283  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  25.93 
 
 		 456 aa  53.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2746  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 		 1096 aa  53.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.455726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  27.21 
 
 		 229 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  26.98 
 
 		 133 aa  53.5  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  26.98 
 
 		 133 aa  53.5  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>