More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002123 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  100 
 
 
205 aa  409  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  94.12 
 
 
204 aa  386  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  75.61 
 
 
205 aa  319  1.9999999999999998e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  51.96 
 
 
206 aa  226  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  51.96 
 
 
206 aa  224  8e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  52.15 
 
 
206 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  52.15 
 
 
206 aa  224  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  52.15 
 
 
206 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  52.15 
 
 
206 aa  224  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  52.15 
 
 
206 aa  224  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  52.15 
 
 
206 aa  224  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  52.15 
 
 
206 aa  224  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  51.67 
 
 
206 aa  222  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3972  homoserine/homoserine lactone efflux protein  51.71 
 
 
206 aa  216  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.422052  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0220  homoserine/homoserine lactone efflux protein  52.69 
 
 
206 aa  210  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3996  homoserine/homoserine lactone efflux protein  52.69 
 
 
206 aa  209  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0557  homoserine/homoserine lactone efflux protein  52.69 
 
 
206 aa  209  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  54.3 
 
 
206 aa  207  8e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4287  homoserine/homoserine lactone efflux protein  50.49 
 
 
206 aa  204  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.414866 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4347  homoserine/homoserine lactone efflux protein  50.49 
 
 
206 aa  204  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499409  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4189  homoserine/homoserine lactone efflux protein  50.49 
 
 
206 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4168  homoserine/homoserine lactone efflux protein  50.49 
 
 
206 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  52.69 
 
 
206 aa  202  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.476612  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4240  homoserine/homoserine lactone efflux protein  50 
 
 
206 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119305  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0195  homoserine/homoserine lactone efflux protein  52.94 
 
 
206 aa  201  9e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3290  lysine exporter protein LysE/YggA  45.41 
 
 
206 aa  186  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.76234  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3962  homoserine/homoserine lactone efflux protein  53.76 
 
 
206 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.149154  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5476  lysine exporter protein LysE/YggA  41.55 
 
 
210 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5994  hypothetical protein  41.46 
 
 
209 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69310  LysE family efflux protein  41.95 
 
 
209 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0266  lysine exporter protein LysE/YggA  41.26 
 
 
210 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06368  putative threonine efflux protein  44.55 
 
 
207 aa  172  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0593  lysine exporter protein LysE/YggA  41.38 
 
 
210 aa  167  8e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.75 
 
 
207 aa  164  9e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3462  lysine exporter protein LysE/YggA  40.29 
 
 
209 aa  160  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0219  lysine exporter protein LysE/YggA  40.78 
 
 
210 aa  157  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581325  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0198  amino acid transporter LysE  40.29 
 
 
210 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0222  lysine exporter protein LysE/YggA  40.29 
 
 
210 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0050  lysine exporter protein LysE/YggA  41.38 
 
 
210 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0140  homoserine/homoserine lactone efflux protein  39.9 
 
 
210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.1 
 
 
213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2802  lysine exporter protein LysE/YggA  38.74 
 
 
212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2512  LysE family efflux protein  41.26 
 
 
209 aa  151  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77155  normal  0.629376 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0303  lysine exporter protein LysE/YggA  41.29 
 
 
205 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.85144e-16  normal  0.0852573 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.32 
 
 
213 aa  151  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1667  lysine exporter protein LysE/YggA  41.92 
 
 
209 aa  150  8.999999999999999e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.931902  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0287  lysine exporter protein LysE/YggA  42.72 
 
 
214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167258  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0291  lysine exporter protein LysE/YggA  44.44 
 
 
224 aa  142  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2660  lysine exporter protein LysE/YggA  37.56 
 
 
217 aa  143  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0329872  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3915  lysine exporter protein LysE/YggA  42.08 
 
 
212 aa  138  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.652927 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0918  lysine exporter protein LysE/YggA  38.83 
 
 
209 aa  137  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3615  lysine exporter protein LysE/YggA  35.64 
 
 
208 aa  137  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0587499  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0236  lysine exporter protein LysE/YggA  40.78 
 
 
214 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2041  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.59 
 
 
207 aa  137  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3544  lysine exporter protein LysE/YggA  39.5 
 
 
212 aa  137  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0116705  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2867  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39 
 
 
212 aa  135  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  36.1 
 
 
206 aa  134  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.92 
 
 
208 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3633  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.76 
 
 
207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  39.22 
 
 
207 aa  132  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.957378  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0891  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.12 
 
 
209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.98 
 
 
208 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  34.83 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0092  lysine exporter protein LysE/YggA  36.6 
 
 
211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.98 
 
 
208 aa  122  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  33.33 
 
 
211 aa  122  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 
211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  33.18 
 
 
212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1323  lysine exporter protein LysE/YggA  33.01 
 
 
211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.848324 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  37 
 
 
203 aa  118  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 
203 aa  118  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.38 
 
 
212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 
208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  33.81 
 
 
210 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  32.37 
 
 
211 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  35.2 
 
 
203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  31.78 
 
 
218 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  34.63 
 
 
205 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  31.34 
 
 
204 aa  115  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0113  lysine exporter protein LysE/YggA  31.03 
 
 
207 aa  115  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.894147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  31.22 
 
 
208 aa  114  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  35.2 
 
 
203 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  30.54 
 
 
207 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.161757 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0122  amino acid transporter LysE  30.54 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.44 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  32.37 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  32.37 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0118  lysine exporter protein LysE/YggA  30.05 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934187 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0086  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.7 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  30.77 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  35.18 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  34.47 
 
 
206 aa  112  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  34.5 
 
 
211 aa  112  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0815  lysine exporter protein LysE/YggA  36.14 
 
 
204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  34.18 
 
 
203 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2172  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.46 
 
 
201 aa  111  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  31.73 
 
 
207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1394  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.71 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0123  lysine exporter protein LysE/YggA  29.56 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>