More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001478 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001478  SAM-dependent methyltransferase  100 
 
 		 191 aa  389  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.544466  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  83.25 
 
 		 232 aa  329  1e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0403  putative methyltransferase  58.33 
 
 		 210 aa  235  3e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00297063  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4055  putative methyltransferase  39.38 
 
 		 194 aa  151  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  31.68 
 
 		 203 aa  98.6  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34303  predicted protein  32.8 
 
 		 252 aa  81.3  0.000000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.294482  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1392  putative S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  29.1 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0586874  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  25.96 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0864  methyltransferase type 12  26.13 
 
 		 204 aa  72  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000143474  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  29.65 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2029  Methyltransferase type 12  27.13 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1055  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  30.21 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.265378 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  28.76 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  30.26 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  28.76 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0591  methyltransferase  32.73 
 
 		 326 aa  65.9  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02405  methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14390)  28.99 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4039  methyltransferase type 12  26.7 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.668919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1449  methyltransferase, putative  27.84 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.37 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 258 aa  57.8  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1466  Methyltransferase type 12  25.54 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.66 
 
 		 250 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0825  Methyltransferase type 12  26.06 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  29.01 
 
 		 253 aa  57  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2544  methyltransferase type 12  30.09 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  29.01 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3983  hypothetical protein  29.79 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.117251  normal  0.595141 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  28.06 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  30.97 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3896  methyltransferase type 11  30.22 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.744662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  26.15 
 
 		 263 aa  55.1  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  33.57 
 
 		 252 aa  54.7  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  29.58 
 
 		 255 aa  55.1  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.66 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4215  methyltransferase type 12  28.78 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.515794  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0872  Methyltransferase type 11  26.35 
 
 		 311 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0115679  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 259 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  26.73 
 
 		 270 aa  53.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  23.72 
 
 		 253 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 259 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4887  methyltransferase type 11  31.11 
 
 		 236 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  29.05 
 
 		 284 aa  52.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4321  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.5 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701577  normal  0.237369 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  34.34 
 
 		 268 aa  52.8  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 327 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  29.93 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  32.14 
 
 		 294 aa  52.4  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  28.23 
 
 		 241 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  28.23 
 
 		 241 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  27.17 
 
 		 218 aa  52  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  28.8 
 
 		 349 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  28.8 
 
 		 354 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1703  hypothetical protein  28.21 
 
 		 234 aa  51.6  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2407  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.48 
 
 		 250 aa  51.6  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  30.34 
 
 		 342 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 339 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3590  methyltransferase type 12  33.01 
 
 		 253 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.698799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  28.65 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1029  methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  33.03 
 
 		 249 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1345  methyltransferase type 12  26.81 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0930798  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4310  hypothetical protein  30.99 
 
 		 261 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  30.88 
 
 		 260 aa  49.7  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  26.61 
 
 		 220 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  26.61 
 
 		 220 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  26.61 
 
 		 220 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  26.61 
 
 		 220 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 254 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1296  hypothetical protein  29.05 
 
 		 248 aa  50.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0615608  normal  0.430138 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.56 
 
 		 250 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2810  methyltransferase type 12  26.82 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  26.38 
 
 		 328 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  26.61 
 
 		 220 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  31.11 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  26.21 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4660  methyltransferase type 12  30.15 
 
 		 250 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2180  putative methyltransferase  30.16 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  26.61 
 
 		 220 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  26.61 
 
 		 220 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3703  methyltransferase type 12  30.15 
 
 		 250 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.919771  normal  0.170372 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1576  hypothetical protein  33.64 
 
 		 256 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362024  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1997  putative methyltransferase UbiE  33.64 
 
 		 256 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1136  hypothetical protein  33.64 
 
 		 256 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051609  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3089  putative methyltransferase  29.27 
 
 		 241 aa  49.7  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.64 
 
 		 256 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0236  hypothetical protein  33.64 
 
 		 256 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325524  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3858  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.41 
 
 		 260 aa  49.7  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3818  methyltransferase type 12  30.15 
 
 		 250 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.329874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3471  methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 207 aa  49.3  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  29.41 
 
 		 284 aa  49.3  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1978  putative methyltransferase UbiE  33.64 
 
 		 256 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  31.4 
 
 		 213 aa  48.9  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3814  Methyltransferase type 11  28.17 
 
 		 230 aa  48.9  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212556  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 328 aa  49.3  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  29.56 
 
 		 250 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5435  methyltransferase type 12  31.78 
 
 		 253 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  30.94 
 
 		 241 aa  48.9  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>