More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000934 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000934  predicted hydrolase  100 
 
 
267 aa  555  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330573  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06933  hypothetical protein  81.89 
 
 
265 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0719  HAD family hydrolase  47.69 
 
 
262 aa  256  2e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00565065  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0709  HAD family hydrolase  47.67 
 
 
262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2852  Cof-like hydrolase  42.59 
 
 
265 aa  224  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.592712  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1549  Cof-like hydrolase  45.31 
 
 
279 aa  221  9e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.678007  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3216  Cof-like hydrolase  41.15 
 
 
287 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000076604  hitchhiker  0.00135645 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2525  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  39.08 
 
 
282 aa  190  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3081  Cof-like hydrolase  38.08 
 
 
283 aa  188  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313968  hitchhiker  0.00000030315 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1574  Cof-like hydrolase  36.19 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.34557  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3309  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.41 
 
 
281 aa  178  7e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0905  Cof-like hydrolase  35.27 
 
 
263 aa  159  5e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000138509  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2526  sugar phosphatase SupH  32.95 
 
 
271 aa  143  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0998065  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1251  Cof-like hydrolase  35.32 
 
 
256 aa  143  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202118  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0880  sugar phosphatase SupH  32.56 
 
 
271 aa  142  7e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00789  predicted hydrolase  32.56 
 
 
271 aa  141  9e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2820  Cof-like hydrolase  32.56 
 
 
271 aa  141  9e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0181531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00806  hypothetical protein  32.56 
 
 
271 aa  141  9e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0893  sugar phosphatase SupH  32.56 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.380533  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0971  sugar phosphatase SupH  32.56 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.526488  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0847  sugar phosphatase SupH  32.56 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2600  Cof-like hydrolase  35.51 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.20198  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2548  Cof-like hydrolase  35.51 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0286905  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1335  Cof-like hydrolase  33.71 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.136423 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2822  Cof-like hydrolase  32.56 
 
 
271 aa  139  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0910  sugar phosphatase SupH  31.15 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0883  sugar phosphatase SupH  31.15 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.815425  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0993  sugar phosphatase SupH  31.15 
 
 
269 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0972  sugar phosphatase SupH  31.15 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0943  sugar phosphatase SupH  31.15 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00811  hypothetical protein  34.72 
 
 
271 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2798  Cof-like hydrolase  34.72 
 
 
271 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.260626  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00828  hypothetical protein  34.72 
 
 
271 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0393  Cof-like hydrolase  30.77 
 
 
269 aa  132  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1316  Cof-like hydrolase  32.18 
 
 
271 aa  132  7.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0871  phosphatase YbjI  34.34 
 
 
271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.464954  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0906  phosphatase YbjI  33.96 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.742575  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2501  phosphatase YbjI  33.96 
 
 
271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2798  Cof-like hydrolase  33.96 
 
 
271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.373732  normal  0.741017 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0916  phosphatase YbjI  34.34 
 
 
271 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0158  Cof-like hydrolase  30.27 
 
 
265 aa  123  4e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2088  HAD superfamily hydrolase  33.45 
 
 
269 aa  122  6e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.656055  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0997  phosphatase YbjI  33.59 
 
 
271 aa  122  8e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.100252 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1377  HAD superfamily hydrolase  28.41 
 
 
270 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.110042  hitchhiker  0.00000000000523684 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1000  phosphatase YbjI  31.52 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0939  phosphatase YbjI  31.52 
 
 
271 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0971  phosphatase YbjI  31.52 
 
 
271 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0903  phosphatase YbjI  31.13 
 
 
271 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2405  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.41 
 
 
263 aa  115  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1019  phosphatase YbjI  31.13 
 
 
271 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130253  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1793  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.36 
 
 
269 aa  112  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324577  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0725  HAD superfamily hydrolase  30.38 
 
 
265 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0486  HAD superfamily hydrolase  31.03 
 
 
262 aa  110  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0954828  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0062  HAD superfamily hydrolase  28.63 
 
 
270 aa  108  6e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1878  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.42 
 
 
270 aa  108  9.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2739  Cof-like hydrolase  29.02 
 
 
263 aa  105  6e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1772  HAD superfamily hydrolase  29 
 
 
272 aa  104  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1105  HAD superfamily hydrolase  33.71 
 
 
273 aa  102  8e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1401  HAD superfamily hydrolase  31.84 
 
 
264 aa  102  9e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0836  HAD superfamily hydrolase  29.06 
 
 
273 aa  97.1  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.781364  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1724  HAD superfamily hydrolase  27.86 
 
 
265 aa  96.7  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000483617  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0909  Cof-like hydrolase  26.72 
 
 
268 aa  95.5  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000198866  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2751  Cof-like hydrolase  27.97 
 
 
272 aa  95.5  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.181052  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  26.79 
 
 
265 aa  92.4  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  27.41 
 
 
262 aa  92  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1451  Cof-like hydrolase  27.34 
 
 
276 aa  91.3  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0545  hydrolase  26.55 
 
 
278 aa  89  7e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1077  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.06 
 
 
268 aa  89  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000777546  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3191  Cof-like hydrolase  26.49 
 
 
291 aa  89  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3808  HAD superfamily hydrolase  28.06 
 
 
268 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0549007  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0053  Cof-like hydrolase  26.79 
 
 
277 aa  88.6  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0228565  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4119  HAD superfamily hydrolase  28.06 
 
 
268 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.213349  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3962  HAD superfamily hydrolase  26.82 
 
 
268 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3793  HAD superfamily hydrolase  26.82 
 
 
268 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4072  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.82 
 
 
268 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0578925 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4271  HAD superfamily hydrolase  26.82 
 
 
268 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.596112  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4161  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.67 
 
 
268 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000350471  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  26.37 
 
 
273 aa  86.7  4e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2983  Cof-like hydrolase  29.92 
 
 
273 aa  85.9  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  hitchhiker  0.000000295074 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3881  Cof-like hydrolase  27.67 
 
 
268 aa  85.9  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0852167  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4183  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.82 
 
 
268 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000631727  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  26.69 
 
 
266 aa  85.9  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3946  HAD family hydrolase  28.2 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3865  HAD family hydrolase  28.2 
 
 
273 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0908  sugar phosphatase SupH  31.65 
 
 
176 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0086  Cof-like hydrolase  28.89 
 
 
280 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  26.16 
 
 
268 aa  85.1  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1822  HAD superfamily hydrolase  25 
 
 
261 aa  85.1  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0457  Cof-like hydrolase  28.31 
 
 
270 aa  84  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  25.37 
 
 
272 aa  84  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1111  HAD superfamily hydrolase  28.99 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.609626  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1675  HAD family hydrolase  28.2 
 
 
273 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3444  HAD family hydrolase  28.2 
 
 
273 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2869  Cof-like hydrolase  28.2 
 
 
273 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3106  HAD family hydrolase  28.2 
 
 
273 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.24744  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1176  HAD superfamily hydrolase  30.43 
 
 
271 aa  83.2  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.534777  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1558  HAD superfamily hydrolase  24.64 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1689  Cof family protein  26.67 
 
 
461 aa  82.4  0.000000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00487865  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0582  Cof-like hydrolase  27.21 
 
 
289 aa  82.4  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.446766  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0596  Cof-like hydrolase  27.21 
 
 
289 aa  82.4  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>