35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2833 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4100  MSHA biogenesis protein MshQ  35.43 
 
 		 1257 aa  639    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2833  hypothetical protein  100 
 
 		 1252 aa  2559    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000270915  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3473  MSHA biogenesis protein MshQ  35.98 
 
 		 1261 aa  622  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.928372 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0478  MSHA biogenesis protein MshQ  34.6 
 
 		 1255 aa  617  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233703  normal  0.793103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3649  MSHA biogenesis protein MshQ  36.7 
 
 		 1248 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.516469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0573  MSHA biogenesis protein MshQ  34.61 
 
 		 1258 aa  610  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0117136  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3335  hypothetical protein  37.65 
 
 		 1553 aa  606  1.0000000000000001e-171  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.545908  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0517  hypothetical protein  38.72 
 
 		 1543 aa  595  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0496  hypothetical protein  38.72 
 
 		 1543 aa  588  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0848067  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0521  hypothetical protein  38.48 
 
 		 1543 aa  586  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.402104 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3823  hypothetical protein  38.34 
 
 		 1541 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.473732  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3739  hypothetical protein  37.8 
 
 		 1532 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4403  hypothetical protein  36.02 
 
 		 1463 aa  528  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002382  hypothetical protein  27.66 
 
 		 1508 aa  301  7e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0466  MSHA biogenesis protein MshQ  40.93 
 
 		 837 aa  291  5.0000000000000004e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0264284  normal  0.812437 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0402  MSHA biogenesis protein MshQ  28.63 
 
 		 900 aa  262  3e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0473177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3755  PA14 domain-containing protein  27.8 
 
 		 1382 aa  251  7e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0111574  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0396  VcfQ-like protein  30.81 
 
 		 1306 aa  245  5e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0557  MSHA biogenesis protein MshQ  28.31 
 
 		 906 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0109211  normal  0.590942 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3263  VcfQ-like protein  29.56 
 
 		 1072 aa  230  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0888  hypothetical protein  40.89 
 
 		 1191 aa  178  8e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.199681 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3337  hypothetical protein  41.46 
 
 		 1202 aa  173  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0182  CUB domain-containing protein  25.63 
 
 		 1537 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384689  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0765  hypothetical protein  26.13 
 
 		 1085 aa  139  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232029  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3101  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1133 aa  132  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  26.27 
 
 		 1504 aa  122  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4562  hypothetical protein  22.11 
 
 		 1576 aa  119  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  34.72 
 
 		 2642 aa  115  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2801  conserved repeat domain protein  34.65 
 
 		 900 aa  97.1  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00263  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshQ (pilus type IV)  23.53 
 
 		 1168 aa  95.5  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  29.79 
 
 		 4896 aa  95.1  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0759  hypothetical protein  26.23 
 
 		 907 aa  90.9  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.747993 
 
 
-
 
NC_003296  RS05333  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  28.33 
 
 		 1111 aa  89.4  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.476781 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0192  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  33.11 
 
 		 1127 aa  66.6  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.48482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  36.94 
 
 		 3911 aa  54.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>