More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0717 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  100 
 
 		 99 aa  201  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  61.62 
 
 		 98 aa  121  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  62.5 
 
 		 98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  57.58 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  55.56 
 
 		 94 aa  101  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  56.12 
 
 		 94 aa  101  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  56 
 
 		 95 aa  98.2  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  48.42 
 
 		 105 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  55.21 
 
 		 94 aa  94.4  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  51.55 
 
 		 95 aa  93.6  7e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  53.26 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  53.26 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1865  50S ribosomal protein L23  48.98 
 
 		 95 aa  90.5  7e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0212066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16761  50S ribosomal protein L23  51.09 
 
 		 97 aa  90.1  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  50.51 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 100 aa  87.8  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  46.94 
 
 		 95 aa  87.4  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  51.09 
 
 		 100 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0769  50S ribosomal protein L23  47.96 
 
 		 94 aa  85.5  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000223701  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  51.06 
 
 		 100 aa  85.9  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1648  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 100 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17471  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 100 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.576191  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1159  Ribosomal protein L25/L23  48.45 
 
 		 99 aa  85.1  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000025981  hitchhiker  0.000000476583 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  48 
 
 		 95 aa  85.1  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17381  50S ribosomal protein L23  48.91 
 
 		 100 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2561  Ribosomal protein L25/L23  45.74 
 
 		 104 aa  84.3  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  45.65 
 
 		 97 aa  84.3  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1957  50S ribosomal protein L23  46.74 
 
 		 100 aa  84  6e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 94 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0374  50S ribosomal protein L23  46.74 
 
 		 100 aa  83.2  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  52.04 
 
 		 95 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  48.98 
 
 		 95 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0693  50S ribosomal protein L23  44.94 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.001904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0257  ribosomal protein L23  51.06 
 
 		 98 aa  82.8  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  48.42 
 
 		 96 aa  82.8  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  51.04 
 
 		 98 aa  82.8  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1342  Ribosomal protein L25/L23  47.47 
 
 		 98 aa  81.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  52.17 
 
 		 95 aa  81.6  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  50.51 
 
 		 97 aa  81.3  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2686  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 104 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0258195  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  50.51 
 
 		 97 aa  81.3  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2230  50S ribosomal protein L23  44.21 
 
 		 100 aa  80.9  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3010  50S ribosomal protein L23  47.19 
 
 		 101 aa  80.9  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00732369 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  49.49 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  47.92 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0107  50S ribosomal protein L23  53.12 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000207631  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1557  ribosomal protein L25/L23  46.94 
 
 		 97 aa  80.5  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271789  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_419  ribosomal protein L23  42.42 
 
 		 94 aa  79.7  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0245207  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  48 
 
 		 96 aa  79.3  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  45.92 
 
 		 94 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1709  50S ribosomal protein L23  48.94 
 
 		 98 aa  79.7  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.182173  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0453  50S ribosomal protein L23  41.41 
 
 		 94 aa  80.1  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00013155  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0476  50S ribosomal protein L23  42.42 
 
 		 94 aa  79.3  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00880639  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  47.42 
 
 		 97 aa  79.3  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  51.09 
 
 		 98 aa  79  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  45.74 
 
 		 101 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1829  50S ribosomal protein L23  51.04 
 
 		 91 aa  78.2  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.132177  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1905  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 98 aa  77.8  0.00000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0184535  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0112  50S ribosomal protein L23  52.08 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000886787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0112  50S ribosomal protein L23  52.08 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000031737  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0108  50S ribosomal protein L23  52.08 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.29551e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0106  50S ribosomal protein L23  52.08 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000563087  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5193  50S ribosomal protein L23  52.08 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000262494  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0124  50S ribosomal protein L23  52.08 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.40944e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0143  50S ribosomal protein L23  52.08 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000263853  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0112  50S ribosomal protein L23  52.08 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000156815  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0133  50S ribosomal protein L23  52.08 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000888654  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0700  50S ribosomal protein L23  48.48 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000143862  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0668  50S ribosomal protein L23  48.48 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142276  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2167  Ribosomal protein L25/L23  45 
 
 		 98 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00207145  normal  0.264777 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0788  ribosomal protein L25/L23  47.42 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1763  50S ribosomal protein L23  45 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00961532  normal  0.39775 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 97 aa  77.4  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 96 aa  77  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5785  Ribosomal protein L25/L23  45.65 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0742289 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  43.16 
 
 		 100 aa  76.6  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  43.16 
 
 		 100 aa  76.6  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1136  ribosomal protein L25/L23  46.81 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000719358  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0106  50S ribosomal protein L23  51.04 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000244838  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3665  ribosomal protein L25/L23  46.94 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149169  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  43.16 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4345  Ribosomal protein L25/L23  44.57 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000178584  normal  0.183841 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0060  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 98 aa  75.9  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.735142  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0955  ribosomal protein L25/L23  44.33 
 
 		 101 aa  75.5  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000594054  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0604  Ribosomal protein L25/L23  38.54 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0758  50S ribosomal protein L23  45.16 
 
 		 99 aa  75.5  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000156644  normal  0.0173378 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0491  50S ribosomal protein L23  43.88 
 
 		 98 aa  74.7  0.0000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.98557  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1392  50S ribosomal protein L23  45.92 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000409295  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3326  50S ribosomal protein L23  45.45 
 
 		 94 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.23257e-16 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  47.87 
 
 		 98 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0081  50S ribosomal protein L23  45 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1294  50S ribosomal protein L23  45.92 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000021109  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  42.11 
 
 		 110 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  48.94 
 
 		 101 aa  75.1  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0935  50S ribosomal protein L23  45.45 
 
 		 94 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000134151  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2227  50S ribosomal protein L23  45.05 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000627291  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0988  50S ribosomal protein L23  46.46 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137365  normal  0.02544 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0291  50S ribosomal protein L23  44.94 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>