More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3926 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3926  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 322 aa  648    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.838043  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  60.65 
 
 		 311 aa  388  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5429  alpha/beta hydrolase fold  57.01 
 
 		 319 aa  358  8e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80867 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1377  alpha/beta hydrolase fold  56.78 
 
 		 319 aa  356  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.2117  normal  0.107315 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13701  epoxide hydrolase ephE  55.28 
 
 		 327 aa  347  1e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0688152 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5199  alpha/beta hydrolase fold  55.03 
 
 		 317 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0800557  hitchhiker  0.000578485 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4812  alpha/beta hydrolase fold  54.4 
 
 		 317 aa  338  7e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.744056  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4898  alpha/beta hydrolase fold  54.4 
 
 		 317 aa  338  7e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.451029  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  50.16 
 
 		 308 aa  303  3.0000000000000004e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  51.42 
 
 		 313 aa  301  1e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  48.37 
 
 		 308 aa  264  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  45.51 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  45.22 
 
 		 301 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  46.84 
 
 		 307 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  43.13 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  42.99 
 
 		 308 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  42.44 
 
 		 311 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  44.23 
 
 		 349 aa  232  7.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  43.93 
 
 		 308 aa  229  6e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 		 310 aa  224  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  43.73 
 
 		 494 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  40.91 
 
 		 307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4437  alpha/beta hydrolase fold  41.2 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.684387  hitchhiker  0.00120619 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0418  alpha/beta hydrolase fold  43.45 
 
 		 305 aa  205  7e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0502159  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3092  alpha/beta hydrolase fold protein  39.87 
 
 		 309 aa  203  4e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  39.87 
 
 		 298 aa  195  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.681258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0723  alpha/beta hydrolase fold protein  39.92 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3036  alpha/beta hydrolase fold protein  38.71 
 
 		 310 aa  192  5e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0438  alpha/beta hydrolase fold protein  35.46 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.207857 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  40.44 
 
 		 308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  31.42 
 
 		 289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  31.42 
 
 		 289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  34.11 
 
 		 287 aa  149  8e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  34.78 
 
 		 301 aa  146  6e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  34.55 
 
 		 303 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  32.56 
 
 		 291 aa  142  7e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  33.11 
 
 		 286 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 		 287 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  31.46 
 
 		 284 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  32.44 
 
 		 297 aa  139  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  30.59 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 		 288 aa  125  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  33.45 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  34.94 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  31.16 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  31.16 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  34.73 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  30.69 
 
 		 304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 		 287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  32.61 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  33.22 
 
 		 308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  33.22 
 
 		 297 aa  109  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  30.16 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  31.41 
 
 		 305 aa  106  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  28.92 
 
 		 322 aa  106  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  32.57 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  30.79 
 
 		 283 aa  102  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  29.52 
 
 		 328 aa  101  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 291 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 291 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 		 287 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 		 293 aa  100  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 315 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 315 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 294 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 		 282 aa  99  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  30 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.59 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  36.56 
 
 		 323 aa  97.8  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2645  Alpha/beta hydrolase  29.53 
 
 		 289 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0678318 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2543  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 298 aa  97.4  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 		 288 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  31 
 
 		 288 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 		 289 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1845  alpha/beta hydrolase fold  27.81 
 
 		 306 aa  96.7  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12367 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 		 308 aa  96.3  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  30.67 
 
 		 288 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 		 308 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 		 293 aa  95.5  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  28.66 
 
 		 311 aa  95.1  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  29.05 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  26.73 
 
 		 323 aa  94.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5124  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 291 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49570  predicted protein  28.04 
 
 		 326 aa  94.4  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2349  alpha/beta hydrolase fold protein  29.85 
 
 		 288 aa  94.7  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21563  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  44.27 
 
 		 351 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  29.54 
 
 		 300 aa  93.6  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 		 323 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  41.98 
 
 		 356 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  45.24 
 
 		 350 aa  91.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 		 292 aa  91.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2042  alpha/beta hydrolase fold  24.11 
 
 		 329 aa  92  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.416275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>