More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3820 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3820  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 391 aa  789    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5222  acetyl-CoA acetyltransferase  76.67 
 
 		 391 aa  618  1e-176  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.64162  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1536  acetyl-CoA acetyltransferase  76.82 
 
 		 398 aa  615  1e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5018  acetyl-CoA acetyltransferase  77.63 
 
 		 392 aa  615  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  77.63 
 
 		 392 aa  615  1e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4724  acetyl-CoA acetyltransferase  77.63 
 
 		 392 aa  615  1e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3966  propanoyl-CoA C-acyltransferase  77.52 
 
 		 392 aa  610  1e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.238561  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2644  acetyl-CoA acetyltransferase  76.23 
 
 		 391 aa  604  9.999999999999999e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000531608  normal  0.301355 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2841  acetyl-CoA acetyltransferase  77.17 
 
 		 392 aa  605  9.999999999999999e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13556  acetyl-CoA acetyltransferase  75.9 
 
 		 394 aa  597  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148092 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2734  acetyl-CoA acetyltransferase  72.7 
 
 		 388 aa  584  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3981  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  68.05 
 
 		 385 aa  544  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.480226  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1484  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  65.71 
 
 		 383 aa  524  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3092  acetyl-CoA acetyltransferase  67.01 
 
 		 393 aa  521  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2763  putative SCP-x_thiolase/acetyl- CoA acetyltransferase, PaaJ-like  36.92 
 
 		 400 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.470356  normal  0.471158 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2782  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.33 
 
 		 392 aa  172  7.999999999999999e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.133795  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0270  acetyl-CoA acetyltransferase  33.77 
 
 		 391 aa  168  1e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00178908  normal  0.140204 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  32 
 
 		 391 aa  160  3e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  31.76 
 
 		 392 aa  150  5e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  30.67 
 
 		 390 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  30.48 
 
 		 383 aa  143  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1290  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.64 
 
 		 378 aa  143  4e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  33.07 
 
 		 392 aa  143  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  31.54 
 
 		 387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.2 
 
 		 384 aa  140  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0510  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.18 
 
 		 376 aa  140  4.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3786  acetyl-CoA acetyltransferase  30.23 
 
 		 389 aa  140  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00704604  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.69 
 
 		 387 aa  138  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.26 
 
 		 387 aa  138  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  32.54 
 
 		 387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  30.95 
 
 		 388 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  31.16 
 
 		 386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  27.76 
 
 		 395 aa  134  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  32.2 
 
 		 387 aa  134  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  28.01 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  30.35 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  30.46 
 
 		 388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3505  acetyl-CoA acetyltransferase  30.43 
 
 		 389 aa  129  7.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  30.41 
 
 		 390 aa  127  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  30.63 
 
 		 387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  32.72 
 
 		 388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  30.97 
 
 		 388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3272  acetyl-CoA acetyltransferase  30.83 
 
 		 386 aa  125  9e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.21 
 
 		 389 aa  125  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  30.71 
 
 		 386 aa  125  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.48 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  29.72 
 
 		 388 aa  124  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  29.53 
 
 		 387 aa  122  7e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  30.45 
 
 		 394 aa  123  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.4 
 
 		 392 aa  122  8e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  29.89 
 
 		 385 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  30.63 
 
 		 387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  28.35 
 
 		 395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  30.55 
 
 		 387 aa  120  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  30.61 
 
 		 382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.19 
 
 		 386 aa  120  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  27.37 
 
 		 378 aa  119  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  29.43 
 
 		 384 aa  119  9e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.89 
 
 		 392 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3119  lipid-transfer protein  33.33 
 
 		 398 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.42 
 
 		 383 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0628  putative nonspecific lipid-transfer protein (sterol carrier protein)  31.2 
 
 		 386 aa  117  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  32.63 
 
 		 384 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6077  acetyl-CoA acetyltransferase  30.24 
 
 		 390 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  29.6 
 
 		 406 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  27.66 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28.14 
 
 		 392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  27.34 
 
 		 401 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  31.43 
 
 		 384 aa  114  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  33.2 
 
 		 395 aa  113  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  30.66 
 
 		 382 aa  113  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3567  putative thiolase  31.01 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  28.45 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  28.79 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  29.74 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.81 
 
 		 385 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0941  lipid-transfer protein  31.03 
 
 		 398 aa  111  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.303203  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1855  acetyl-CoA acetyltransferase  29.4 
 
 		 401 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0446253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0646  acetyl-CoA acetyltransferase  29.85 
 
 		 397 aa  110  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4922  acetyl-CoA acetyltransferase  30.2 
 
 		 386 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  30.42 
 
 		 409 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  30.42 
 
 		 395 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  30.42 
 
 		 395 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  30.45 
 
 		 385 aa  109  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3077  acetyl-CoA acetyltransferase  29.5 
 
 		 389 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  30.71 
 
 		 390 aa  109  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.34 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3907  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.56 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  29.19 
 
 		 413 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  29.19 
 
 		 413 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  29.71 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  29.37 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.19 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2721  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.55 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0489  acetyl-CoA acetyltransferase  29.15 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  31.17 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  25.37 
 
 		 393 aa  107  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  27.46 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  27.46 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  27.46 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>