More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1785 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  90 
 
 		 347 aa  640    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  100 
 
 		 350 aa  701    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  89.43 
 
 		 350 aa  635    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  89.71 
 
 		 350 aa  636    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  88.57 
 
 		 347 aa  628  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  88.57 
 
 		 347 aa  628  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  88.57 
 
 		 347 aa  628  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  86.86 
 
 		 347 aa  615  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  86.79 
 
 		 359 aa  594  1e-169  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  85.59 
 
 		 347 aa  596  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1492  recA protein  88.63 
 
 		 348 aa  591  1e-168  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  83.33 
 
 		 345 aa  592  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  83.57 
 
 		 345 aa  590  1e-167  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  82.76 
 
 		 346 aa  588  1e-167  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  84.93 
 
 		 345 aa  590  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  86.36 
 
 		 376 aa  584  1e-166  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  81.27 
 
 		 352 aa  580  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  83.19 
 
 		 350 aa  576  1.0000000000000001e-163  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  84.8 
 
 		 366 aa  575  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  82.03 
 
 		 350 aa  571  1.0000000000000001e-162  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  82.78 
 
 		 367 aa  570  1e-161  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  80.99 
 
 		 352 aa  564  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  82.34 
 
 		 345 aa  565  1e-160  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  82.67 
 
 		 365 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  82.82 
 
 		 364 aa  561  1.0000000000000001e-159  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  83.28 
 
 		 351 aa  563  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  83.74 
 
 		 348 aa  560  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  83.44 
 
 		 348 aa  559  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  80.85 
 
 		 368 aa  556  1e-157  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  82.01 
 
 		 378 aa  555  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  81.02 
 
 		 383 aa  556  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4183  recA protein  77.52 
 
 		 349 aa  551  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  0.191355 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  79.71 
 
 		 351 aa  553  1e-156  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3919  recA protein  81.02 
 
 		 344 aa  534  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  76.38 
 
 		 418 aa  527  1e-148  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  75.15 
 
 		 379 aa  523  1e-147  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  69.3 
 
 		 364 aa  484  1e-136  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  68.18 
 
 		 347 aa  484  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  70.86 
 
 		 363 aa  481  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  69.47 
 
 		 344 aa  483  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  65.6 
 
 		 350 aa  481  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  68.9 
 
 		 362 aa  481  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  67.06 
 
 		 348 aa  478  1e-134  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  68.71 
 
 		 347 aa  479  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0653  recA protein  67.08 
 
 		 346 aa  479  1e-134  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1629  recombinase A  69.04 
 
 		 355 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.849206  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  64.52 
 
 		 347 aa  477  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  70.19 
 
 		 336 aa  475  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4088  recombinase A  69.04 
 
 		 355 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  70.06 
 
 		 342 aa  474  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  67.48 
 
 		 341 aa  477  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1231  recombinase A  69.04 
 
 		 355 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000176903 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  69.63 
 
 		 348 aa  475  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  65.58 
 
 		 341 aa  476  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3015  recombinase A  69.04 
 
 		 347 aa  475  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.514179  hitchhiker  0.000000000000973321 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  64.52 
 
 		 347 aa  477  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4108  recA protein  63.61 
 
 		 358 aa  471  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4075  recA protein  63.61 
 
 		 358 aa  472  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  66.26 
 
 		 358 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4030  recombinase A  68.42 
 
 		 355 aa  471  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104307  unclonable  0.0000000000000597568 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2082  recombinase A  68.73 
 
 		 347 aa  474  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  67.38 
 
 		 355 aa  470  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1523  recombinase A  65.59 
 
 		 346 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  69.23 
 
 		 379 aa  469  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  68.94 
 
 		 358 aa  469  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  69.14 
 
 		 347 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  70.4 
 
 		 349 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3964  RecA protein  64.2 
 
 		 358 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3045  recombinase A  68.52 
 
 		 355 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.398232  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  66.46 
 
 		 352 aa  468  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  66.46 
 
 		 352 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17530  recombinase A  65.59 
 
 		 346 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  66.06 
 
 		 390 aa  471  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  67.54 
 
 		 346 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1655  recombinase A  72 
 
 		 354 aa  466  9.999999999999999e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.384834  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  67.38 
 
 		 358 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1378  recombinase A  65.4 
 
 		 354 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0217782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  64.91 
 
 		 347 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  69.06 
 
 		 356 aa  466  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  67.69 
 
 		 343 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38560  recombinase A  67.8 
 
 		 349 aa  466  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  68.44 
 
 		 360 aa  465  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  67.99 
 
 		 359 aa  468  9.999999999999999e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  67.6 
 
 		 343 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4033  recA protein  66.37 
 
 		 354 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  67.9 
 
 		 348 aa  463  1e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  67.9 
 
 		 348 aa  463  1e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0074  recA protein  67.91 
 
 		 344 aa  461  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1175  recombinase A  66.87 
 
 		 352 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  66.87 
 
 		 355 aa  461  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  67.61 
 
 		 338 aa  462  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1288  recombinase A  67.7 
 
 		 348 aa  463  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12750  DNA recombination protein RecA  92.34 
 
 		 790 aa  463  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000250397  normal  0.0414269 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  68.83 
 
 		 346 aa  463  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  67.61 
 
 		 338 aa  462  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10720  protein RecA  65.01 
 
 		 361 aa  462  1e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000907009  unclonable  0.00000000149755 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  68.44 
 
 		 357 aa  463  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1747  recombinase A  67.75 
 
 		 351 aa  464  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000101073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  66.87 
 
 		 343 aa  462  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  64.33 
 
 		 357 aa  464  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>