214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0777 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0777  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 287 aa  563  1.0000000000000001e-159  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.245899  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  50.9 
 
 		 303 aa  261  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 296 aa  258  9e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1690  transcriptional regulator, XRE family  51.99 
 
 		 305 aa  256  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal  0.186529 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2101  helix-turn-helix domain protein  50.35 
 
 		 293 aa  251  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0682  transcriptional regulator, XRE family  48.75 
 
 		 292 aa  249  5e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  50.18 
 
 		 290 aa  246  4e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  47.75 
 
 		 293 aa  245  6e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3498  transcriptional regulator, XRE family  51.25 
 
 		 293 aa  240  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19300  Helix-turn-helix protein  47.72 
 
 		 302 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4120  helix-turn-helix domain protein  49.83 
 
 		 313 aa  238  8e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  48.56 
 
 		 287 aa  238  8e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3277  helix-turn-helix domain protein  48.01 
 
 		 294 aa  237  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  50.55 
 
 		 298 aa  235  7e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20310  hypothetical protein  47.69 
 
 		 297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.643001  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1568  transcriptional regulator, XRE family  46.98 
 
 		 304 aa  226  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2666  helix-turn-helix domain-containing protein  46.57 
 
 		 297 aa  226  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.372203  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2622  XRE family transcriptional regulator  46.57 
 
 		 304 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2651  XRE family transcriptional regulator  46.57 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3682  helix-turn-helix domain protein  47.52 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2109  transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 		 299 aa  223  4e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611283 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04290  Helix-turn-helix protein  46.92 
 
 		 334 aa  223  4e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12000  Helix-turn-helix protein  51.35 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14370  hypothetical protein  46.05 
 
 		 297 aa  216  4e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2718  helix-turn-helix domain protein  46.71 
 
 		 308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.479107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4541  helix-turn-helix domain-containing protein  43.94 
 
 		 307 aa  199  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  42.81 
 
 		 309 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0411  helix-turn-helix domain protein  43.25 
 
 		 303 aa  195  6e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  45.66 
 
 		 293 aa  195  7e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  41.7 
 
 		 297 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  41.76 
 
 		 292 aa  188  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 282 aa  188  8e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3299  helix-turn-helix domain protein  44.44 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.043491  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 285 aa  183  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  41.43 
 
 		 302 aa  182  6e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  42.38 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  42.55 
 
 		 310 aa  177  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 312 aa  176  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  41.3 
 
 		 303 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2441  transcriptional regulator, XRE family  43.87 
 
 		 275 aa  168  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  38.79 
 
 		 317 aa  168  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  38.87 
 
 		 276 aa  166  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2784  transcriptional regulator, XRE family  41.45 
 
 		 284 aa  165  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.583087  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  39.78 
 
 		 302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6984  helix-turn-helix domain protein  40.99 
 
 		 286 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118873  normal  0.27222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7348  hypothetical protein  41.37 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  40.42 
 
 		 318 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1995  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000234374  normal  0.041772 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2804  putative transcriptional regulator, XRE family  42.03 
 
 		 300 aa  162  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4329  transcriptional regulator, XRE family  43.53 
 
 		 290 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5666  putative transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 273 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2188  transcriptional regulator, XRE family  40.14 
 
 		 281 aa  155  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371471  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  40.29 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  41.18 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4317  helix-turn-helix domain protein  38.89 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  40.07 
 
 		 289 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 289 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0367  helix-turn-helix domain protein  38.38 
 
 		 284 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1956  putative transcriptional regulator, XRE family  39.42 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4218  XRE family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 289 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4284  XRE family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 289 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 279 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1003  putative transcriptional regulator, XRE family  37.73 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3211  XRE family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.663604  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  40.36 
 
 		 281 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  37.18 
 
 		 299 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14230  Helix-turn-helix protein  40.7 
 
 		 277 aa  139  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.814537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2562  XRE family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 342 aa  138  8.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8805  transcriptional regulator, XRE family  39.6 
 
 		 298 aa  138  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2521  helix-turn-helix domain protein  39.41 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.895975  hitchhiker  0.00158212 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3700  transcriptional regulator, XRE family  36.53 
 
 		 273 aa  137  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.564208  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0368  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6148  XRE family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 284 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.171229 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 283 aa  136  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20270  hypothetical protein  35.25 
 
 		 277 aa  135  7.000000000000001e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.161196 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5385  XRE family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 289 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0902  XRE family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 284 aa  135  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4269  helix-turn-helix domain protein  35.23 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0718578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4719  XRE family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3644  XRE family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.560718 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1949  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 307 aa  133  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4662  helix-turn-helix domain protein  39.05 
 
 		 287 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  34.81 
 
 		 292 aa  132  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 299 aa  132  5e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1464  helix-turn-helix domain-containing protein  31.72 
 
 		 301 aa  132  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2702  helix-turn-helix domain protein  36.76 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.590252 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  34.87 
 
 		 303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3876  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  34.42 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5457  helix-turn-helix domain-containing protein  33.57 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8368  XRE family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1007  XRE family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  35.23 
 
 		 313 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0524  hypothetical protein  29.92 
 
 		 276 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1997  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2494  helix-turn-helix domain protein  36.36 
 
 		 265 aa  129  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>