More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0619 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0619  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 407 aa  794    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4593  acetyl-CoA acetyltransferase  66.91 
 
 		 404 aa  543  1e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3849  acetyl-CoA acetyltransferase  65.34 
 
 		 405 aa  534  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4073  acetyl-CoA acetyltransferases  65.34 
 
 		 399 aa  528  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23240  acetyl-CoA acetyltransferase  65.5 
 
 		 400 aa  513  1e-144  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0554052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1013  acetyl-CoA acetyltransferases  68.08 
 
 		 404 aa  514  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0223058  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13000  acetyl-CoA acetyltransferase  65.25 
 
 		 391 aa  503  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0875  thiolase  63 
 
 		 391 aa  488  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0626  acetyl-CoA acetyltransferases  64.07 
 
 		 391 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0380375  decreased coverage  0.00188207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7930  3-oxoadipyl-CoA thiolase  61.19 
 
 		 391 aa  437  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155909  normal  0.485519 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  48.91 
 
 		 401 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  48.77 
 
 		 403 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  49.26 
 
 		 398 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  48.91 
 
 		 402 aa  365  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0492  acetyl-CoA acetyltransferase  49.39 
 
 		 402 aa  361  1e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  49.14 
 
 		 402 aa  361  1e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0164  acetyl-CoA acetyltransferase  51.24 
 
 		 394 aa  360  3e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2156  acetyl-CoA acetyltransferase  53.55 
 
 		 404 aa  358  8e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.744792  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3063  acetyl-CoA acetyltransferase  50.24 
 
 		 408 aa  355  6.999999999999999e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1582  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  48.48 
 
 		 424 aa  354  2e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05285  acetyl-CoA acetyltransferase  42.79 
 
 		 404 aa  350  3e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0115  acetyl-CoA acetyltransferase  50.5 
 
 		 384 aa  348  7e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.286312  normal  0.0707668 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3048  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.52 
 
 		 403 aa  348  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214699  normal  0.389192 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3268  acetyl-CoA acetyltransferases  50 
 
 		 409 aa  347  2e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.73 
 
 		 402 aa  347  3e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0301  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.39 
 
 		 401 aa  346  4e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6183  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.39 
 
 		 401 aa  343  2.9999999999999997e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5094  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.76 
 
 		 400 aa  343  5e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1122  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.52 
 
 		 401 aa  342  7e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2825  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.24 
 
 		 401 aa  342  8e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0222  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.59 
 
 		 400 aa  341  1e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0698438 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  46.36 
 
 		 398 aa  341  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20220  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.8 
 
 		 405 aa  340  4e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  45.72 
 
 		 398 aa  339  4e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.93 
 
 		 401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.93 
 
 		 401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02790  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.28 
 
 		 401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4811  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.15 
 
 		 401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.346578 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6797  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.18 
 
 		 401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.93 
 
 		 401 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2196  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.66 
 
 		 400 aa  336  3.9999999999999995e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2616  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.42 
 
 		 406 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3039  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.66 
 
 		 400 aa  335  7.999999999999999e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6117  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.05 
 
 		 401 aa  334  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1532  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.37 
 
 		 401 aa  335  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117462 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4887  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.36 
 
 		 401 aa  335  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589853 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.69 
 
 		 401 aa  334  2e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4020  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.51 
 
 		 401 aa  333  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0676172  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.87 
 
 		 412 aa  333  3e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1017  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.56 
 
 		 400 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.473484  hitchhiker  0.0000869499 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5883  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.07 
 
 		 401 aa  333  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2457  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.2 
 
 		 400 aa  332  9e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2485  acetyl-CoA acetyltransferase  47.62 
 
 		 411 aa  331  1e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3669  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.93 
 
 		 400 aa  331  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.39 
 
 		 402 aa  331  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408018  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0314  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.55 
 
 		 401 aa  331  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3492  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.16 
 
 		 397 aa  330  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.141414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0917  acetyl-CoA acetyltransferase  50.97 
 
 		 412 aa  330  3e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0879  Acetyl-CoA C-acyltransferase  50.86 
 
 		 401 aa  330  3e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.28 
 
 		 404 aa  330  3e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0320  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.84 
 
 		 402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2064  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.45 
 
 		 400 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.664786 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1169  acetyl-CoA acetyltransferase  44.42 
 
 		 400 aa  326  4.0000000000000003e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.178123 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5587  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.86 
 
 		 400 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02905  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.03 
 
 		 402 aa  326  4.0000000000000003e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1236  acetyl-CoA acetyltransferase  44.66 
 
 		 400 aa  325  7e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.439957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1696  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.61 
 
 		 400 aa  325  7e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.142195 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0905  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.66 
 
 		 402 aa  325  8.000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3707  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.27 
 
 		 405 aa  325  1e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.394558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1359  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.15 
 
 		 401 aa  324  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0514  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.62 
 
 		 402 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201521  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0226  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.15 
 
 		 400 aa  325  1e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.206359  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2629  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.26 
 
 		 406 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.577515  normal  0.0691319 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7640  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.87 
 
 		 402 aa  325  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202781  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38200  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.28 
 
 		 401 aa  324  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4307  3-oxoadipyl-CoA thiolase  47.79 
 
 		 399 aa  323  3e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4011  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.55 
 
 		 399 aa  323  3e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0170191 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0875  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.24 
 
 		 404 aa  323  3e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4336  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.82 
 
 		 402 aa  323  4e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.834663 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3097  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.47 
 
 		 404 aa  323  4e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99011  hitchhiker  0.000409619 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5022  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.03 
 
 		 399 aa  323  4e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0302  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.92 
 
 		 401 aa  323  5e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.480832  normal  0.217803 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  43.17 
 
 		 400 aa  322  6e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0636  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.57 
 
 		 400 aa  322  9.999999999999999e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1269  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.34 
 
 		 401 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.690521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3944  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.79 
 
 		 402 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0822503  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2252  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.18 
 
 		 400 aa  320  3e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00123839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0525  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.15 
 
 		 402 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.859351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0659  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.04 
 
 		 401 aa  320  3e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.993676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0598  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.33 
 
 		 400 aa  319  3.9999999999999996e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.319983  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0650  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.69 
 
 		 401 aa  319  7e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0831  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.72 
 
 		 400 aa  318  7e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3718  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.95 
 
 		 400 aa  318  9e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1377  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.56 
 
 		 400 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388007  normal  0.268922 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  42.93 
 
 		 399 aa  318  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5019  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.19 
 
 		 400 aa  317  3e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.582505 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4346  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.07 
 
 		 400 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.269292  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3280  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.92 
 
 		 406 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.939828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3665  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.47 
 
 		 400 aa  316  5e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3179  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.54 
 
 		 399 aa  315  8e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.694628  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>