More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3544 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3544  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 246 aa  478  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.16365  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0219  short chain dehydrogenase  57.32 
 
 		 246 aa  271  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1931  short chain dehydrogenase  57.32 
 
 		 246 aa  271  9e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1673  short chain dehydrogenase  57.32 
 
 		 246 aa  271  9e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2209  short chain dehydrogenase  57.32 
 
 		 246 aa  271  9e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0309  short chain dehydrogenase  57.32 
 
 		 246 aa  271  9e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0946  short chain dehydrogenase  56.91 
 
 		 253 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1234  short chain dehydrogenase  56.91 
 
 		 279 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.446635  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5440  short chain dehydrogenase  55.37 
 
 		 254 aa  263  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0792659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4245  short chain dehydrogenase  55.02 
 
 		 249 aa  262  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4890  short chain dehydrogenase  55.37 
 
 		 254 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0080  short chain dehydrogenase  53.72 
 
 		 254 aa  258  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4617  short chain dehydrogenase  54.96 
 
 		 253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.891469  hitchhiker  0.00163121 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5248  short chain dehydrogenase  53.72 
 
 		 253 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5611  short chain dehydrogenase  53.72 
 
 		 253 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.637794  normal  0.281069 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3230  short chain dehydrogenase  54.55 
 
 		 254 aa  250  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.272744 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0225  short chain dehydrogenase  55.74 
 
 		 311 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6980  short chain dehydrogenase  54.55 
 
 		 252 aa  238  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3005  short chain dehydrogenase  53.28 
 
 		 252 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 		 251 aa  159  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3341  short chain dehydrogenase  35.42 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3306  short chain dehydrogenase  35.42 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3256  short chain dehydrogenase  35.42 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3555  short chain dehydrogenase  35.42 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000931047 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3602  short chain dehydrogenase  35.42 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0750697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3561  short chain dehydrogenase  35 
 
 		 249 aa  149  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 		 256 aa  148  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0899775  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1662  short chain dehydrogenase  34.73 
 
 		 249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.637972  hitchhiker  0.000000702398 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0532431 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3565  short chain dehydrogenase  35 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.578221  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3655  short chain dehydrogenase  33.89 
 
 		 249 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3250  short chain dehydrogenase  32.64 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0558976  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2223  short chain dehydrogenase  33.19 
 
 		 249 aa  140  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.637126  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3151  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.125802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1735  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 		 260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.355166  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.85 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1035  short chain dehydrogenase  36.99 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0959  short chain dehydrogenase  37.86 
 
 		 246 aa  128  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0597094 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0894  short chain dehydrogenase  38.68 
 
 		 246 aa  125  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.211983  normal  0.0749879 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1029  short chain dehydrogenase  40.16 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1071  short chain dehydrogenase  34.82 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0009  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.247011  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2989  short-chain alcohol dehydrogenase/reductase  31.98 
 
 		 243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000130997  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 		 260 aa  109  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.278227  normal  0.338656 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 		 249 aa  85.5  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0120  hypothetical protein  36.6 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.586754  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61312  predicted protein  30.8 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.243713  normal  0.492851 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.109628  normal  0.14985 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0747  hypothetical protein  30.3 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00775431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.362756  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0765  hypothetical protein  30.3 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1630  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.81 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0066  dehydrogenase/reductase  32.32 
 
 		 252 aa  72  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301861 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.01 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.699599  normal  0.026116 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.93 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.530045  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.53 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46579  predicted protein  31.61 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.198108  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164626 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.09 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.68 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.853199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.66 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453828  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.18 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.910239 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.36 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4141  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.38 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0914  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.6 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.3 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.186526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.6 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.331162 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.45 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.82 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09357  short-chain dehydrogenase/reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02370)  27.05 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00364064 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0177311  normal  0.151964 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  26.61 
 
 		 705 aa  67.4  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19210  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  25.98 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0731595  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0209  short chain dehydrogenase  27.42 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.37 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00331942  hitchhiker  0.00525068 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4057  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.6 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2697  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  33.33 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05303  oxidoreductase  30.05 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000627  putative sorbitol-6-phosphate 2-dehydrogenase  28.76 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4002  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.65 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.85 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00179  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G11240)  27.18 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.983253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3356  short chain dehydrogenase  34.45 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.52 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.300792  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2921  pteridine reductase  33.33 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6694  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.5 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1181  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.8 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.34 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.550134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.640458 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.34 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0464631 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1744  short chain dehydrogenase  33.16 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324234  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>