More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2111 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2111  Resolvase domain protein  100 
 
 
191 aa  382  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.813305  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  91.4 
 
 
197 aa  343  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  91.4 
 
 
197 aa  343  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  91.4 
 
 
197 aa  343  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5339  DNA-invertase  91.4 
 
 
192 aa  342  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  66.67 
 
 
194 aa  248  3e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  66.67 
 
 
194 aa  248  3e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3497  resolvase domain-containing protein  68.85 
 
 
219 aa  226  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503079  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3606  resolvase domain-containing protein  68.85 
 
 
219 aa  226  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal  0.996271 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1104  resolvase domain-containing protein  68.85 
 
 
219 aa  226  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3570  resolvase domain-containing protein  66.31 
 
 
197 aa  223  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  50 
 
 
204 aa  178  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  50 
 
 
204 aa  178  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  50 
 
 
204 aa  178  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  50.53 
 
 
204 aa  171  6.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  50 
 
 
206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  49.72 
 
 
204 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  49.72 
 
 
204 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  50.28 
 
 
193 aa  160  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  53.33 
 
 
191 aa  158  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  53.33 
 
 
191 aa  158  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  50 
 
 
188 aa  157  6e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  49.72 
 
 
210 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  51.43 
 
 
209 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  46.15 
 
 
191 aa  151  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  49.15 
 
 
215 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  48.3 
 
 
197 aa  150  8e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  48.02 
 
 
185 aa  150  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  48.02 
 
 
185 aa  150  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  50 
 
 
201 aa  150  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  48.31 
 
 
188 aa  149  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  45.76 
 
 
188 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  47.27 
 
 
190 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  45.76 
 
 
187 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  47.25 
 
 
199 aa  149  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  47.09 
 
 
182 aa  148  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  47.31 
 
 
188 aa  148  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  47.19 
 
 
184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  45.56 
 
 
188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  49.14 
 
 
194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  41.94 
 
 
205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  52.74 
 
 
184 aa  145  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  46.63 
 
 
219 aa  145  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  45.56 
 
 
186 aa  145  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  46.82 
 
 
185 aa  144  8.000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  44.15 
 
 
185 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  44.63 
 
 
196 aa  143  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  41.04 
 
 
192 aa  142  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  44.02 
 
 
198 aa  143  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  46.77 
 
 
185 aa  143  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  45.41 
 
 
187 aa  143  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  52.86 
 
 
176 aa  142  4e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  45.2 
 
 
188 aa  141  7e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  44.63 
 
 
309 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  46.67 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  45.66 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  46.7 
 
 
193 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  44.77 
 
 
197 aa  138  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  46.7 
 
 
193 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  45.4 
 
 
189 aa  138  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  44.75 
 
 
184 aa  138  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2332  resolvase domain-containing protein  41.97 
 
 
227 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  43.26 
 
 
188 aa  138  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  41.04 
 
 
197 aa  137  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  44.07 
 
 
307 aa  137  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  41.04 
 
 
197 aa  137  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  44.07 
 
 
307 aa  137  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  45.56 
 
 
197 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  46.67 
 
 
185 aa  136  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  46.15 
 
 
193 aa  136  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  45.03 
 
 
190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  45.6 
 
 
193 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  44.39 
 
 
189 aa  134  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  43.1 
 
 
189 aa  133  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  46.24 
 
 
193 aa  133  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0022  resolvase-like protein  55.12 
 
 
133 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.119432  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  43.35 
 
 
184 aa  133  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  47.13 
 
 
214 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  43.18 
 
 
201 aa  132  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  43.09 
 
 
188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5525  hypothetical protein  75.86 
 
 
158 aa  130  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  44.64 
 
 
208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  44.44 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3501  resolvase domain-containing protein  54.35 
 
 
324 aa  129  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.654072  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  47.51 
 
 
203 aa  128  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  44.02 
 
 
193 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  42.37 
 
 
201 aa  127  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  42.54 
 
 
196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4488  DNA-invertase  40.91 
 
 
187 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.258493  normal  0.0155508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  45.07 
 
 
201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  42.16 
 
 
197 aa  124  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal 
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  51.18 
 
 
190 aa  124  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  40.59 
 
 
195 aa  124  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  43.09 
 
 
201 aa  124  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  38.83 
 
 
203 aa  124  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  51.43 
 
 
228 aa  124  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  43.1 
 
 
186 aa  123  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  42.63 
 
 
196 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  45.29 
 
 
206 aa  123  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  41.18 
 
 
198 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>