216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0293 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0293  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
179 aa  357  7e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1276  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.21 
 
 
183 aa  137  7.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.476809  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1178  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.21 
 
 
183 aa  137  7.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0328  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.76 
 
 
181 aa  131  6e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3878  ATP synthase F1, delta subunit  27.01 
 
 
178 aa  81.3  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000205385  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  30.18 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.22 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.44 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2872  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.24 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3077  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.4 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26673  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.44 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2433  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.29 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3056  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.07 
 
 
180 aa  67  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2913  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.07 
 
 
180 aa  67  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2800  F-type H+-transporting ATP synthase, delta (OSCP) subunit  24.71 
 
 
178 aa  67.4  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31614  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4465  ATP synthase F1, delta subunit  26.01 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00110137  hitchhiker  0.0000000108481 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.26 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6359  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.44 
 
 
178 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73280  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.44 
 
 
178 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3514  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.67 
 
 
175 aa  63.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.86 
 
 
180 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.44 
 
 
183 aa  63.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0269  ATP synthase F1, delta subunit  29.76 
 
 
175 aa  63.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.26 
 
 
178 aa  62.4  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.97 
 
 
180 aa  60.8  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.97 
 
 
180 aa  60.8  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52190  F1 sector of membrane-bound ATP synthase, delta subunit  24.28 
 
 
178 aa  60.8  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.97 
 
 
180 aa  60.8  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3337  ATP synthase F1 delta subunit  26.22 
 
 
184 aa  60.8  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.631562  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4258  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.9 
 
 
177 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.510184  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4149  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.9 
 
 
177 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0979605  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4093  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.9 
 
 
177 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4078  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.9 
 
 
177 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.079303  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.7 
 
 
180 aa  60.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3733  ATP synthase F1, delta subunit  27.22 
 
 
177 aa  60.8  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4199  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.9 
 
 
177 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  0.940305 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4205  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.36 
 
 
177 aa  59.7  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000051054  normal  0.165641 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.11 
 
 
178 aa  59.7  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2590  ATP synthase F1, delta subunit  22.62 
 
 
178 aa  59.7  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.570122  normal  0.0802262 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0335  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.98 
 
 
180 aa  60.1  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.584491  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.97 
 
 
180 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2937  ATP synthase delta chain  24.14 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213023  normal  0.0695694 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4179  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.36 
 
 
177 aa  59.7  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.37 
 
 
181 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4223  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.36 
 
 
177 aa  59.7  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000462366  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.7 
 
 
180 aa  59.3  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.12 
 
 
180 aa  59.3  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4129  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.36 
 
 
177 aa  59.3  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000754285  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03110  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.3 
 
 
175 aa  58.5  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.71 
 
 
182 aa  58.9  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4610  ATP synthase F1, delta subunit  29.03 
 
 
178 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.994341  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3969  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.12 
 
 
178 aa  58.5  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110961  normal  0.295514 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0009  ATP synthase F1, delta subunit  23.84 
 
 
178 aa  58.2  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.7 
 
 
180 aa  58.2  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.95 
 
 
183 aa  58.5  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4191  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.97 
 
 
177 aa  58.2  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000591932  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5602  ATP synthase F1, delta subunit  25.71 
 
 
178 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5733  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.71 
 
 
178 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607755  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.99 
 
 
180 aa  57.8  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03619  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.2 
 
 
177 aa  57  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00523657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4232  ATP synthase F1, delta subunit  32.2 
 
 
177 aa  57  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.245958  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  23.67 
 
 
178 aa  57.4  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4251  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.2 
 
 
177 aa  57  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538372  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4186  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.2 
 
 
177 aa  57  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000191061  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5171  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.2 
 
 
177 aa  57  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00189703  decreased coverage  0.00512499 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03563  hypothetical protein  32.2 
 
 
177 aa  57  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00259121  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3951  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.2 
 
 
177 aa  57  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000356722  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4259  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.2 
 
 
177 aa  57  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000372939  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4103  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.2 
 
 
177 aa  57  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00374645  normal  0.126439 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4254  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.91 
 
 
177 aa  56.6  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.177027  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5124  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.14 
 
 
178 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.346499  normal  0.863545 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.7 
 
 
179 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  23.49 
 
 
179 aa  56.6  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.29 
 
 
179 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  20.93 
 
 
179 aa  56.6  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.84 
 
 
182 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2328  ATP synthase F1, delta subunit  32.35 
 
 
178 aa  56.6  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000241371  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3990  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.97 
 
 
177 aa  56.6  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934211  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002027  ATP synthase delta chain  24.85 
 
 
177 aa  56.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.002001  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  17.61 
 
 
182 aa  55.8  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.86 
 
 
180 aa  55.5  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4298  ATP synthase F1, delta subunit  30.77 
 
 
177 aa  55.1  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142998  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18501  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.35 
 
 
182 aa  55.1  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.28 
 
 
180 aa  54.7  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2760  ATP synthase F1, delta subunit  22.73 
 
 
187 aa  54.7  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4111  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  22.62 
 
 
178 aa  54.7  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243479  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2189  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.29 
 
 
182 aa  54.7  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3848  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.13 
 
 
177 aa  54.7  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000255174 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0982  F0F1 ATP synthase subunit delta  21.79 
 
 
182 aa  54.3  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.86 
 
 
180 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.86 
 
 
180 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.86 
 
 
180 aa  53.9  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.86 
 
 
180 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.86 
 
 
180 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2747  ATP synthase F1, delta subunit  26.59 
 
 
178 aa  53.9  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00491756  normal  0.287613 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3287  ATP synthase F1, delta subunit  24.43 
 
 
178 aa  53.9  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.19524  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2027  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.95 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873114  normal  0.0511628 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.67 
 
 
188 aa  53.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  21.64 
 
 
186 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0190  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.9 
 
 
209 aa  53.1  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00459232 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>