58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2262 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2262  MotA/TolQ/ExbB proton channel family  100 
 
 		 381 aa  736    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1074  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  47.79 
 
 		 442 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0210036  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2830  hypothetical protein  49.74 
 
 		 328 aa  305  1.0000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00712159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1709  hypothetical protein  46.4 
 
 		 377 aa  294  1e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.288619  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3368  MotA  47.9 
 
 		 359 aa  253  3e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1503  putative MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.6 
 
 		 362 aa  245  8e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.40508 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2585  hypothetical protein  46.95 
 
 		 330 aa  226  4e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0323  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  56.9 
 
 		 242 aa  222  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2099  hypothetical protein  48.12 
 
 		 320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.157749  hitchhiker  0.00162908 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4337  hypothetical protein  44.52 
 
 		 333 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0593676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0992  hypothetical protein  43.11 
 
 		 339 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6938  hypothetical protein  53.48 
 
 		 330 aa  206  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2743  hypothetical protein  44 
 
 		 358 aa  204  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.171341 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3541  hypothetical protein  49.6 
 
 		 353 aa  203  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4487  hypothetical protein  54.78 
 
 		 332 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264247  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0801  hypothetical protein  56.78 
 
 		 335 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.61408 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2664  hypothetical protein  45.51 
 
 		 368 aa  196  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636064  normal  0.726493 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2941  hypothetical protein  38.03 
 
 		 427 aa  195  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0937923 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2209  hypothetical protein  37.25 
 
 		 391 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0964  hypothetical protein  37.88 
 
 		 391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0530307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2096  hypothetical protein  35.75 
 
 		 392 aa  182  7e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2288  hypothetical protein  37.6 
 
 		 391 aa  182  7e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.485616  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3552  hypothetical protein  43.71 
 
 		 368 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3255  hypothetical protein  43.14 
 
 		 367 aa  179  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1039  hypothetical protein  37.27 
 
 		 399 aa  176  8e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1713  hypothetical protein  43.7 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1204  hypothetical protein  41.98 
 
 		 349 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2159  hypothetical protein  39.02 
 
 		 324 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3074  hypothetical protein  38.39 
 
 		 328 aa  162  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23107  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3343  hypothetical protein  39.68 
 
 		 353 aa  161  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.41153  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4542  hypothetical protein  37.46 
 
 		 328 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0926622  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0847  hypothetical protein  54.27 
 
 		 359 aa  156  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3187  hypothetical protein  52.47 
 
 		 337 aa  153  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.91365  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2317  hypothetical protein  38.99 
 
 		 330 aa  153  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0554801  normal  0.125751 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3671  hypothetical protein  42.86 
 
 		 337 aa  153  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.673224  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2638  hypothetical protein  39.06 
 
 		 331 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2361  hypothetical protein  39.06 
 
 		 334 aa  151  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.261278 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1405  hypothetical protein  38.49 
 
 		 569 aa  150  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5364  hypothetical protein  38.73 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725258  decreased coverage  0.00123752 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1193  MotA/TolQ/ExbB proton channel  21.39 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0504  hypothetical protein  28.33 
 
 		 723 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0231  hypothetical protein  23.68 
 
 		 476 aa  56.6  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2438  hypothetical protein  27.69 
 
 		 445 aa  55.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4289  hypothetical protein  24.48 
 
 		 549 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0230  hypothetical protein  22.63 
 
 		 476 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132063  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4508  putative integral membrane protein  25 
 
 		 462 aa  53.1  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.48653  normal  0.86135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2737  hypothetical protein  32.85 
 
 		 495 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.112498 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0320  hypothetical protein  25.97 
 
 		 488 aa  50.8  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4517  putative integral membrane protein  26 
 
 		 462 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4653  putative methyl-accepting chemotaxis protein  26 
 
 		 462 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0572045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4602  hypothetical protein  26 
 
 		 462 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4603  putative integral membrane protein  26 
 
 		 462 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.156774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  21.41 
 
 		 563 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5803  hypothetical protein  27.89 
 
 		 550 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.485501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3888  hypothetical protein  27.89 
 
 		 550 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4824  hypothetical protein  27.9 
 
 		 550 aa  44.3  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1849  hypothetical protein  24.11 
 
 		 524 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3240  protein of unknown function DUF802  32.98 
 
 		 696 aa  43.9  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.701112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>