73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2196 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2196  Polysulphide reductase NrfD  100 
 
 		 414 aa  815    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203832  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2474  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit  61.89 
 
 		 400 aa  438  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.750101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1664  polysulphide reductase, NrfD  58.42 
 
 		 425 aa  420  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1709  polysulphide reductase, NrfD  45.24 
 
 		 397 aa  295  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0260794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1962  polysulphide reductase, NrfD  40.3 
 
 		 416 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  31.25 
 
 		 413 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  32.09 
 
 		 388 aa  98.2  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  28.13 
 
 		 411 aa  95.9  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  30.67 
 
 		 393 aa  90.5  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0102  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit, putative  23.91 
 
 		 393 aa  89.7  8e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.757619  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  32.36 
 
 		 406 aa  88.2  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1845  Polysulphide reductase NrfD  26.49 
 
 		 384 aa  88.6  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0829523  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3666  Polysulphide reductase NrfD  28.53 
 
 		 380 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.396142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  30.71 
 
 		 389 aa  87.8  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  26.2 
 
 		 442 aa  86.7  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1150  polysulphide reductase, NrfD  24.62 
 
 		 385 aa  86.3  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0596071  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_112  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit  25.33 
 
 		 393 aa  85.9  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3346  Polysulphide reductase NrfD  25.21 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000267  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  28.12 
 
 		 384 aa  84  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1603  polysulphide reductase, NrfD  24.69 
 
 		 385 aa  82.8  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00601969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0140  polysulphide reductase, NrfD  24.25 
 
 		 383 aa  80.1  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0707  Polysulphide reductase NrfD  25.08 
 
 		 385 aa  79.7  0.00000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  27.71 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0066  Polysulphide reductase NrfD  27.08 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.411771 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  26.11 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0266  polysulphide reductase, NrfD  24.73 
 
 		 393 aa  76.3  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0214  polysulphide reductase, NrfD  26.56 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  28.21 
 
 		 408 aa  72  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  24.53 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0239  Polysulphide reductase NrfD  27.86 
 
 		 386 aa  69.7  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  23.75 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  23.7 
 
 		 383 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0274  Polysulphide reductase NrfD  22.94 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00211929  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02400  polysulphide reductase  28.13 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  26.35 
 
 		 400 aa  67  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1511  Polysulphide reductase NrfD  24.8 
 
 		 382 aa  67  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  25.46 
 
 		 391 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2275  reductase, transmembrane subunit, putative  23.95 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2436  Polysulphide reductase NrfD  25.44 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  24.79 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0166  polysulphide reductase, NrfD  26.13 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.391929  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1779  polysulphide reductase, NrfD  24.47 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.263014 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2406  polysulphide reductase NrfD  25.26 
 
 		 417 aa  63.2  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.148885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_175  molybdopterin oxidoreductase, formate dehydrogenase membrane subunit  25.9 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.100817  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3386  polysulphide reductase, NrfD  26.3 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1424  polysulphide reductase, NrfD  25 
 
 		 416 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4229  Polysulphide reductase NrfD  27.91 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2523  Polysulphide reductase NrfD  24.68 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  26.05 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0355  polysulphide reductase, NrfD  24.57 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0121208  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0186  formate dehydrogenase, membrane subunit, putative  25.54 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2001  polysulphide reductase, NrfD  26.15 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.438759  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2687  Polysulphide reductase NrfD  22.78 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046719 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  24.64 
 
 		 389 aa  57  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1957  Polysulphide reductase NrfD  24.65 
 
 		 403 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0447  Polysulphide reductase NrfD  25.31 
 
 		 389 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1562  Polysulphide reductase NrfD  24.59 
 
 		 435 aa  55.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382538  normal  0.988263 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2265  Polysulphide reductase NrfD  25 
 
 		 403 aa  54.3  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1061  polysulphide reductase, NrfD  25.45 
 
 		 401 aa  50.1  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.079733 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3282  Polysulphide reductase NrfD  22.17 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3088  polysulphide reductase, NrfD  22.36 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.187838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3188  Polysulphide reductase NrfD  22 
 
 		 413 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0920163  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1229  Polysulphide reductase NrfD  28.75 
 
 		 304 aa  47.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3083  Polysulphide reductase NrfD  25.17 
 
 		 448 aa  46.6  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3520  polysulphide reductase, NrfD  23.35 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000358671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3085  polysulphide reductase NrfD  28.04 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.488046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2271  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  20.51 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0327  polysulphide reductase, NrfD  30.84 
 
 		 417 aa  43.9  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.180424  hitchhiker  0.00000238958 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1066  Polysulphide reductase NrfD  30.17 
 
 		 412 aa  43.9  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4681800000000002e-26 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0353  polysulphide reductase, NrfD  23.7 
 
 		 315 aa  43.9  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3393  Polysulphide reductase NrfD  23.17 
 
 		 411 aa  43.9  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3196  Polysulphide reductase NrfD  30.17 
 
 		 412 aa  43.5  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0700  Polysulphide reductase NrfD  25.45 
 
 		 318 aa  43.1  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000375278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>