243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0598 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009661  Shew185_4456  type III restriction protein res subunit  43.77 
 
 		 1079 aa  816    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4250  protein of unknown function DUF450  44.07 
 
 		 1027 aa  788    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1553  protein of unknown function DUF450  43.7 
 
 		 985 aa  682    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0424  type I restriction enzyme, R subunit  53.41 
 
 		 1102 aa  1136    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0958  protein of unknown function DUF450  40.17 
 
 		 1067 aa  636    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1014  type I restriction-modification system restriction subunit  40.54 
 
 		 965 aa  645    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2685  DEAD/DEAH box helicase  44.85 
 
 		 1009 aa  780    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0160  type I site-specific restriction-modification system, R subunit (helicase)  44.06 
 
 		 1035 aa  872    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0639  type III restriction enzyme, res subunit  37.99 
 
 		 1009 aa  650    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28859  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2689  hypothetical protein  55.14 
 
 		 1063 aa  1161    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11077  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2695  hypothetical protein  40.67 
 
 		 1008 aa  714    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.285383  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1482  hypothetical protein  57.34 
 
 		 1081 aa  1209    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2870  DEAD/DEAH box helicase-like  44.21 
 
 		 1085 aa  818    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.737132  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0278  hypothetical protein  39.13 
 
 		 989 aa  660    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1065  DEAD/DEAH box helicase-like  47.06 
 
 		 1039 aa  921    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00124695  normal  0.0212089 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0797  protein of unknown function DUF450  43.38 
 
 		 1000 aa  786    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00985204 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0194  hypothetical protein  43.85 
 
 		 1041 aa  792    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.394359 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0598  type I site-specific restriction-modification system, R subunit  100 
 
 		 1052 aa  2171    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2607  hypothetical protein  41.91 
 
 		 1022 aa  720    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3444  type III restriction protein res subunit  38.46 
 
 		 1012 aa  686    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1325  type III restriction enzyme, res subunit  53.52 
 
 		 1112 aa  1176    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1789  type III restriction enzyme, res subunit  42.3 
 
 		 1029 aa  731    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2605  type III restriction enzyme, res subunit  53.25 
 
 		 1087 aa  1122    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0189627  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19090  helicase, type I site-specific restriction-modification system restriction subunit  40.32 
 
 		 1004 aa  685    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.210967 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13690  helicase, type I site-specific restriction-modification system restriction subunit  43.7 
 
 		 1073 aa  753    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.161894 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4762  type I restriction-modification system endonuclease  42.75 
 
 		 1078 aa  827    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1497  protein of unknown function DUF450  45.4 
 
 		 1051 aa  828    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0324371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0230  hypothetical protein  57.07 
 
 		 1060 aa  1176    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0415  hypothetical protein  56.09 
 
 		 1069 aa  1186    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.484825  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0077  type I restriction-modification system subunit R  58.48 
 
 		 1067 aa  1224    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0485  hypothetical protein  48.9 
 
 		 1039 aa  954    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.646894  decreased coverage  0.000377567 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3355  hypothetical protein  42.86 
 
 		 1007 aa  747    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4924  hypothetical protein  48.83 
 
 		 1035 aa  955    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3992  type III restriction protein res subunit  41.77 
 
 		 984 aa  720    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.208178 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1151  hypothetical protein  58.27 
 
 		 1059 aa  1186    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.255903  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1859  hypothetical protein  46.76 
 
 		 1033 aa  875    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0265  type III restriction protein res subunit  38.98 
 
 		 1010 aa  637    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.268157  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2221  type III restriction enzyme, res subunit  48.18 
 
 		 905 aa  843    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.432598  normal  0.944916 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22820  type I restriction enzyme R protein  39.72 
 
 		 1006 aa  624  1e-177  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.324704 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0749  type III restriction protein res subunit  39.82 
 
 		 992 aa  620  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4471  hypothetical protein  37.72 
 
 		 991 aa  593  1e-168  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.756132  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1515  protein of unknown function DUF450  36.01 
 
 		 1142 aa  587  1e-166  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.695629 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0780  type I site-specific deoxyribonuclease chain R  36.19 
 
 		 971 aa  585  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0180253  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2197  protein of unknown function DUF450  38.12 
 
 		 999 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1218  hypothetical protein  36.4 
 
 		 990 aa  557  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1859  DEAD/DEAH box helicase-like  35.29 
 
 		 997 aa  552  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.397249  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1787  type III restriction enzyme, res subunit  36.26 
 
 		 1011 aa  546  1e-154  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.990163  normal  0.226288 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1363  putative type I restriction enzyme HsdR  34.64 
 
 		 1022 aa  534  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0659  protein of unknown function DUF450  33.4 
 
 		 969 aa  523  1e-147  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003238  type I restriction-modification system restriction subunit R  33.8 
 
 		 1023 aa  522  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0843  hypothetical protein  35.59 
 
 		 983 aa  522  1e-146  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.10122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3575  protein of unknown function DUF450  41.24 
 
 		 976 aa  513  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0274  type I restriction-modification system, R subunit, putative  34.38 
 
 		 1002 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.273589  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6264  type III restriction protein res subunit  34.83 
 
 		 1016 aa  507  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.724284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2267  type I restriction-modification system endonuclease  33.49 
 
 		 1023 aa  496  1e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2175  hypothetical protein  32.87 
 
 		 1031 aa  493  1e-137  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2936  restriction enzyme type I helicase subunit; type I restriction enzyme HsdR  34.45 
 
 		 1034 aa  493  1e-137  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101388 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0881  putative type I site specific deoxyribonuclease HsdR  24.89 
 
 		 1060 aa  127  8.000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0350782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17680  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  26.14 
 
 		 1035 aa  127  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0986  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  26.44 
 
 		 1040 aa  124  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3142  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  22.73 
 
 		 1053 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.311039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1534  type I restriction-modification enzyme, R subunit  23.67 
 
 		 1031 aa  122  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0146067  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0017  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.6 
 
 		 1032 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.13213  hitchhiker  0.00259353 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3131  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  27.12 
 
 		 1060 aa  119  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.789076  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1642  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  23.39 
 
 		 1003 aa  119  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0040  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.44 
 
 		 1032 aa  118  5e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1124  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  23.22 
 
 		 1084 aa  118  6e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2251  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.85 
 
 		 1044 aa  118  6e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1362  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.22 
 
 		 1060 aa  117  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4244  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.82 
 
 		 1084 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104553 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2450  type I site-specific deoxyribonuclease HsdR family  24.5 
 
 		 1042 aa  115  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2781  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.54 
 
 		 1042 aa  112  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.759966 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1213  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.38 
 
 		 1074 aa  112  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1115  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  23.55 
 
 		 1107 aa  112  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0289  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.31 
 
 		 1044 aa  112  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1089  type I restriction-modification enzyme, R subunit, putative  25.83 
 
 		 1040 aa  111  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0842  type I restriction-modification enzyme, R subunit  23.8 
 
 		 967 aa  111  9.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.156677  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0790  type I restriction-modification enzyme, R subunit  23.8 
 
 		 967 aa  111  9.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.225053  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1367  type III restriction enzyme, res subunit  25.96 
 
 		 1289 aa  110  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0157  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.85 
 
 		 1096 aa  109  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0939  hypothetical protein  34.01 
 
 		 313 aa  109  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.702425 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0281  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.9 
 
 		 1028 aa  108  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000241298 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0288  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  23.69 
 
 		 1003 aa  108  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2740  type I restriction-modification system endonuclease  24.58 
 
 		 1051 aa  108  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0101  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.04 
 
 		 986 aa  108  6e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4470  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  24.18 
 
 		 1084 aa  108  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.566129  normal  0.610404 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2912  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.36 
 
 		 1045 aa  107  9e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4010  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.31 
 
 		 1067 aa  106  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3906  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.7 
 
 		 1097 aa  105  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2283  Type I site-specific deoxyribonuclease  24.49 
 
 		 1044 aa  105  6e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1854  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  25.62 
 
 		 1026 aa  105  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0222  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  26.23 
 
 		 1028 aa  104  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2911  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  22.66 
 
 		 1079 aa  104  9e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1804  Type I site-specific deoxyribonuclease HsdR  25.15 
 
 		 1068 aa  103  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2596  type I restriction-modification system, R subunit  24.04 
 
 		 1059 aa  104  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0011  type I site-specific deoxyribonuclease  25.15 
 
 		 1061 aa  103  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.386666 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2923  R (restriction) subunit/helicase  25.75 
 
 		 984 aa  102  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3549  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.65 
 
 		 1092 aa  102  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.254191 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1093  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  25.34 
 
 		 1074 aa  102  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3755  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  24.29 
 
 		 1029 aa  102  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0174443  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>